日本人潰瘍性大腸炎感受性遺伝子SLC26A3の遺伝子多型機能解析
日本溃疡性结肠炎易感基因SLC26A3基因多态性功能分析
基本信息
- 批准号:23790763
- 负责人:
- 金额:$ 2.66万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- 财政年份:2011
- 资助国家:日本
- 起止时间:2011 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
潰瘍性大腸炎の発症には遺伝的素因が関与していることが疫学的研究から明らかになっている。2009年に行ったゲノムワイド相関解析によって、いくつかの日本人潰瘍性大腸炎の感受性遺伝子が新たに報告された。しかし、ゲノムワイド相関解析では相関を示す遺伝子多型を決められた多型セットから抽出するだけであり、実際に相関を示している多型がその多型とは限らない。また、その多型が疾患と相関するかどうかをみているだけであり、疾患の病態や病型、治療反応性などとの関連は不明である。本研究では、その中の一つであるSLC26A3遺伝子について、その相関がどのようなものであるかを明らかにし、感受性を示すメカニズムを探ることを目的とした。遺伝子解析をより詳細に行うため、SLC26A3遺伝子の上流にあるrs2108225について、臨床データや他の感受性遺伝子の遺伝子型とともに検討を行った。対象は東北大学病院を受診した潰瘍性大腸炎患者260人と、健常人ボランティア654人とし、まず各群での対立遺伝子頻度の違いについてカイ二乗検定で検討を行った。その結果、対立遺伝子Cの頻度が、患者群で69.6%、健常人群で64.1%であり、有意に患者群で頻度が多いことが確認された。(p値0.0262,オッズ比1.28)。また、他の感受性遺伝子候補との関連を見るため、これまでに報告したNKX2.3遺伝子、HLA-B*52遺伝子について、それぞれのリスクキャリアとそれ以外に分けて相関解析を行った。その結果、NKX2.3遺伝子については、NKX2.3遺伝子リスクキャリアのみにおいてSLC26A3が相関を示した(p=0.00472,オッズ比=1.44)。また、HLA-B*52については、B*52キャリアと非キャリアでSLC26A3対立遺伝子頻度が有意に異なり(p=0.0212)、B*52キャリアでは相関を示さず、非キャリアでのみ相関を示した(p=0.00167,オッズ比=1.69)。このことから、SLC26A3は、他の感受性遺伝子との相互作用がある可能性が示唆された。
Ulcerative colitis の 発 disease に は but 伝 element for が masato and し て い る こ と が epidemiology research か ら Ming ら か に な っ て い る. Line 2009 に っ た ゲ ノ ム ワ イ ド phase analytical に masato よ っ て, い く つ か の Japanese ulcerative colitis の susceptibility heritage 伝 が new た に report さ れ た. し か し, ゲ ノ ム ワ イ ド phase analytical で masato は phase masato を shown す survived more than 伝 son type を め ら れ た polymorphism セ ッ ト か ら spare す る だ け で あ り, the event be に masato を shown し て い る polymorphism が そ の polymorphism と は limit ら な い. と ま た, そ の polymorphism が disease phase masato す る か ど う か を み て い る だ け で あ り の morbid や, disease disease type, treatment of anti 応 な ど と の masato even unknown は で あ る. In this study で は, そ の の a つ で あ る SLC26A3 heritage 伝 son に つ い て, そ の phase masato が ど の よ う な も の で あ る か を Ming ら か に し and susceptibility を す メ カ ニ ズ ム を agent る こ と を purpose と し た. Posthumous son 伝 parsing を よ り detailed line に う た め, SLC26A3 but 伝 の upper に あ る rs2108225 に つ い て, clinical デ ー タ や he の susceptibility heritage 伝 son の heritage 伝 sub-type と と も に 検 line for を っ た. Like は seaborne を tohoku university hospital diagnosis し と た ulcerative colitis patients with 260 people, the healthy normal ボ ラ ン テ ィ ア 654 と し, ま ず each group of で の state heritage seaborne 伝 sub frequency の violations い に つ い て カ イ squares 検 set で 検 line for を っ た. そ の results, moral heritage 伝 C の frequency が, group of patients with で 64.1% 69.6%, the healthy crowd で often で あ り, intentionally に patients group of い で frequency が こ と が confirm さ れ た. (p value 0.0262, ッズ ッズ vs. 1.28). ま た, he の susceptibility heritage 伝 son alternate と の masato even see を る た め, こ れ ま で に report し た NKX2.3 heritage 伝, traces of HLA - B * 52 伝 son に つ い て, そ れ ぞ れ の リ ス ク キ ャ リ ア と そ れ に points outside け line analytical を masato っ て phase た. そ の results, NKX2.3 but 伝 に つ い て は, NKX2.3 but 伝 リ ス ク キ ャ リ ア の み に お い て SLC26A3 が phase masato を shown し た (p = 0.00472, オ ッ ズ ratio = 1.44). ま た, HLA - B * 52 に つ い て は, B * 52 キ ャ リ ア と the キ ャ リ ア で SLC26A3 state heritage seaborne 伝 sub frequency が intentionally に different な り (p = 0.0212), B * 52 キ ャ リ ア で は phase masato を shown さ ず, non キ ャ リ ア で の み phase masato を shown し た (p = 0.00167, オ ッ ズ ratio = 1.69). The possibility of interaction がある between <s:1> と ら, SLC26A3, and other <s:1> sensitive progeny 伝 と された が indicates された.
项目成果
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Inhibition of autophagy by 3-MA enhances sodium butyrate-induced apoptosis in human colon cancer cells
3-MA 抑制自噬可增强丁酸钠诱导的人结肠癌细胞凋亡
- DOI:
- 发表时间:2011
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Masatake Kuraha;Youichi Kakuta;Seiichi Takahashi;Yoshitaka Kinouchi;Tooru Shimosegawa
- 通讯作者:Tooru Shimosegawa
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