Cell free RNA methylation genome-wide analysis in head and neck cancer

头颈癌的无细胞 RNA 甲基化全基因组分析

• 批准号: 21K09559
• 负责人: 山田 大貴
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Hamamatsu University School of Medicine
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K09559/
• 关键词: 血中循環RNA修飾網羅的解析; リキッドバイオプシー; クラスター解析; GO解析; セルフリーRNA; クラスター解析、GO解析

これまで我々研究グループは、DNAメチル化修飾（エピゲノム）をマーカーとした先行研究をおこなっている。具体的には、HPV関連中咽頭癌におけるセルフリーDNA-メチル化解析により、3遺伝子(CALML5、DNAJC5G、LY6D) の治療効果・腫瘍消失・再発の判定の有効性を報告している。この3遺伝子は、細胞株の網羅的メチル化解析、頭頸部癌252症例のメチル化解析による予後評価、セルフリーDNA-メチル化解析の3段階の解析により抽出に成功している。今回本研究は、これまでの経験を基に、エピトランスクリプトーム解析によるセルフリーRNAマーカーの探索の研究である。現在、頭頸部癌での特徴など全貌は明かになってない。本研究では、DNAメチル化などの塩基修飾（エピゲノム：epigenome）が癌化機構など多様な影響を与えることが広く認識されている。最近では、転写産物（transcript）であるRNAが修飾されるエピトランスクリプトーム(epitranscriptome)が注目され、RNAにアデノシン6位窒素原子へのメチル基の付加反応であるN6-メチルアデノシン (m6A)という塩基修飾が存在しその重要性が認識されている。我々は、これまで長くDNAメチル化修飾に関する研究をおこない、臨床検体、リキッドバイオプシーからのDNAメチル化マーカーの研究を継続している。本研究では、RNA修飾に焦点をあてた新たなRNAメチル化マーカーの抽出を目指す研究に取り組む。頭頸部癌におけるリキッドバイオプシーからのセルフリーRNAからRNAメチル化を検出する研究はいまだ報告はなく、これまでのセルフリーDNAからのDNAメチル化修飾（エピゲノム）の経験を生かして、RNA修飾（エピトランスクリプトーム）と癌化機構についての知見を蓄積していきたい。

こ れ ま で 々 I study グ ル ー プ は, DNA メ チ ル chemical modification (エ ピ ゲ ノ ム) を マ ー カ ー と し た leading research を お こ な っ て い る. Specific に は, HPV masato even those in cancer に お け る セ ル フ リ ー DNA - メ チ ル resolve analysis に よ り, 3 but 伝 (CALML5 DNAJC5G LY6D) の treatment services, fruit swollen sores, disappear, then 発 の determine の have sharper sex を report し て い る. こ の 3 but 伝 は, cell lines の snare メ チ ル resolve analysis, head and neck cancer, 252 cases の メ チ ル resolve analysis に よ る after review 価, セ ル フ リ ー DNA - メ チ ル resolve analysis の three period of stage の parsing に よ り spare に successful し て い る. Today this study は, こ れ ま で の 経 験 を に, エ ピ ト ラ ン ス ク リ プ ト ー ム parsing に よ る セ ル フ リ ー RNA マ ー カ ー の の research で あ る. Now, the で characteristics of head and neck cancer な <s:1> full picture clear な になってな で. This study で は, DNA メ チ ル change な ど の salt base modification (エ ピ ゲ ノ ム : epigenome) が cancer agency な ど others more な influence を and え る こ と が hiroo く know さ れ て い る. Recent で は, planning to write a product (transcript) で あ る RNA が modified さ れ る エ ピ ト ラ ン ス ク リ プ ト ー ム (epitranscriptome) が attention さ れ, RNA に ア デ ノ シ ン six smothering element atoms へ の メ チ ル base pay plus the 応 の で あ る N6 - メ チ ル ア デ ノ シ ン (m6A)と と う the importance of the base modification が the existence of <s:1> そ <s:1> が が が recognize されて る る る. I 々 は, こ れ ま で long く DNA メ チ ル chemical modified に masato す る research を お こ な い, clinical 検 body, リ キ ッ ド バ イ オ プ シ ー か ら の DNA メ チ ル change マ ー カ ー の research を 継 続 し て い る. Focus of this study で は, RNA modified に を あ て た new た な RNA メ チ ル change マ ー カ ー の spare を refers む に take り す research group. Head and neck cancer に お け る リ キ ッ ド バ イ オ プ シ ー か ら の セ ル フ リ ー RNA か ら RNA メ チ ル change を 検 out す る research は い ま だ report は な く, こ れ ま で の セ ル フ リ ー DNA か ら の DNA メ チ ル chemical modification (エ ピ ゲ ノ ム) の 経 験 を raw か し て, RNA modification (エ ピ ト ラ ン ス ク リ プ ト ー ム) と cancerization Youdaoplaceholder0, に て, て, て, knowledge, を, accumulation, て, た, た.

项目成果

リキッドバイオプシーによるメチル化解析について

关于使用液体活检进行甲基化分析

• 发表时间: 2022
• 作者: 三澤清

原発不明癌におけるリキッドバイオプシーについて

关于原发灶不明癌症的液体活检

• 发表时间: 2022
• 作者: Inohaya Asako Chigusa Yoshitsugu;Kondoh Eiji;Yasuda Eriko1;Takakura Masahito;Ueda Yusuke;Kawamura Yosuke;Io Shingo;Kawasaki Kaoru;Mogami Haruta;Mandai Masaki;三澤清
• 通讯作者: 三澤清

Novel prognostic value and potential utility of opioid receptor gene methylation in liquid biopsy for oral cavity cancer

• DOI: 10.1016/j.currproblcancer.2021.100834
• 发表时间: 2022-03-17
• 期刊: CURRENT PROBLEMS IN CANCER
• 影响因子: 2.6
• 作者: Ishikawa, Ryuji;Imai, Atsushi;Misawa, Kiyoshi
• 通讯作者: Misawa, Kiyoshi