創薬を指向した補助刺激受容体CD28ファミリーとシグナル伝達分子の構造基盤解明

阐明共刺激受体 CD28 家族的结构基础和药物发现的信号转导分子

• 批准号: 18K14395
• 负责人: 稲葉 理美
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: High Energy Accelerator Research Organization (2022)Japan Synchrotron Radiation Research Institute (2018-2019)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-11-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18K14395/
• 关键词: X線小角散乱; 複合体構造; ダイナミクス; タンパク質; 立体構造; 放射光円二色性分散; 小角散乱; シグナル伝達タンパク質; X線結晶構造; 溶液構造; 免疫系シグナル伝達; 分子間相互作用

2022年6月より、海外渡航に伴って一時中断していた本課題を再開した。2022年度はSAXSなどで得られた実験データを元に、構造情報との相関づけを試みた。具体的には、SAXSなどで得られた溶液情報は、結晶構造を支持する結果となっているが、一部の(分解能)領域においては一致しないことが分かっていた。その原因としては、構造解析で用いたリガンドと溶液物性解析で用いるリガンドの鎖長が異なっていることが考えられた。そのため、比較する分子モデルを既存の構造情報をもとに新たに構築して比較することにした。さらに、溶媒条件(pHやイオン強度)を変えることでもSAXSの特性が変わることもわかった。以上のことより、よりダイナミクスにフォーカスした解析が必要であることが明らかとなり、次年度に向けてどのような解析を進めるべきかなどの指針を立てることができた。

从2022年6月开始，由于出国旅行而被暂时停职的这项任务已经恢复。在2022财年，我们试图根据通过SAXS和其他来源获得的实验数据将其与结构信息相关联。具体而言，已经发现由SAXS等获得的解决方案信息支持晶体结构，但已经发现它在某些（分辨率）区域不匹配。原因是在结构分析中使用的配体的链长度和解决方案物理性能分析中使用的配体的链长不同。因此，我们决定根据现有的结构信息进行构建和比较要进行比较的分子模型。此外，还发现改变溶剂条件（pH和离子强度）也改变了萨克斯的特性。从上面的角度来看，很明显，必须进行更多关注动态的分析，并且我们能够提供有关明年应进行哪种分析的准则。

项目成果

Crystal and solution structures of SH2 domain of signaling molecule in complex with the co-stimulatory receptor CD28

信号分子SH2结构域与共刺激受体CD28复合物的晶体和溶液结构

• 发表时间: 2019
• 作者: Satomi INABA-INOUE;Katsuaki INOUE;Takaaki HIKIMA;Hiroshi SEKIGUCHI;Robert RAMBO
• 通讯作者: Robert RAMBO

放射光X線による免疫系シグナル伝達タンパク質SH2と補助刺激受容体CD28との複合体溶液構造解析

使用同步辐射 X 射线对免疫系统信号蛋白 SH2 和共刺激受体 CD28 之间的复合物进行溶液结构分析

• 发表时间: 2019
• 作者: 稲葉理美;井上勝晶;引間孝明;Rohanah Hussain;Giuliano Siligardi; 森井尚之;織田昌幸;八木直人;関口博史;Robert P. Rambo
• 通讯作者: Robert P. Rambo