骨髄異形成症候群に合併した肺胞蛋白症のドライバー遺伝子変異の解析

骨髓增生异常综合征相关肺泡蛋白沉积症驱动基因突变分析

• 批准号: 20K08547
• 负责人: 石井 晴之
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Kyorin University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K08547/
• 关键词: 肺胞蛋白症; 骨髄異形成症候群; トリソミー; ドライバー遺伝子

我々は、1番染色体転座と8番染色体トリソミーに骨髄染色体異常が集中していることを見出し、これらの染色体にはMYCやTETなどの癌化に重要な遺伝子をみとめていた。そこで、MDS-SPAP症例のExome sequenceの解析を開始し、新たに解析できた1例にてNKcellのCSF3R, 白血病化に関連しているTET2: frameshift deletion, ASXL1: frameshift insertion, そして転写に関わる調整因子（クロマチン合成蛋白）のBCOR: stop gain, frameshift insertionが検出された。これまでにTarget sequencingを行った2例においては、14番アレル不均衡、20番長腕部分欠失、1番染色体異常などが検出されており、ミスリード0.05から有意な部位の可能性が示唆された。そのため2, 3年次には、新たなMDS-SPAP症例の臨床検体を追加し、合計13例のMDS-SPAPにおいてPBMCのエクソーム解析、およびtargeted sequencing解析したデータを分析した。スプライシング因子U2AF1においては13例中4例すべてにnonsynonymous SNV異常がみられていた。またエピジェネティック制御因子ASXL1も4例, 転写制御RUNX1は3例, コヒーシン複合体STAG2も3例に異常をみとめていたが、frameshift insertion, frameshift deletion, stop gain, non-frameshift insertion,など遺伝子変異は様々であった。他、TET2やZRSR2なども遺伝子変異をみとめていた。今後はMDS-SPAPに関連する候補遺伝子の同定に向けた分析を進めていく。

Chromosome 1 and chromosome 8 are the most common chromosomal abnormalities in bone marrow. TET2: frameshift deletion, ASXL1: frameshift insertion, BCOR: stop gain, frameshift insertion detection. The Target sequencing was performed in 2 cases, 14 cases of imbalance, 20 cases of partial loss of chromosome length, 1 case of chromosome abnormality, and 0.05 cases of possibility of intentional site. In addition, the clinical manifestations of MDS-SPAP cases were analyzed in 2 and 3 years. In total, 13 cases of MDS-SPAP were analyzed in PBMC and targeted sequencing. 4 out of 13 cases of SNV abnormality were detected. In addition, there were 4 cases of ASXL, 3 cases of RUNX, 2 cases of STAG, 3 cases of frameshift insertion, frameshift deletion, stop gain, non-frameshift insertion, etc. He, TET2, ZRSR2, In the future, MDS-SPAP correlation analysis of candidate genes will be carried out.

项目成果

続発性肺胞蛋白症

继发性肺泡蛋白沉积症

• 发表时间: 2021
• 作者: Takeshige Tomohito;Harada Norihiro;Harada Sonoko;Ishimori Ayako;Katsura Yoko;Sasano Hitoshi;Sandhu Yuuki;Matsuno Kei;Makino Fumihiko;Ito Jun;Atsuta Ryo;Akiba Hisaya;Takahashi Kazuhisa;石井晴之
• 通讯作者: 石井晴之