Spectroscopy basis for elucidating mechanims of allosteric ligand recognition in GPCR
阐明 GPCR 中变构配体识别机制的光谱学基础
基本信息
- 批准号:21H01883
- 负责人:
- 金额:$ 11.07万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- 财政年份:2021
- 资助国家:日本
- 起止时间:2021-04-01 至 2025-03-31
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
今年度は、M2R選択的なNAMの一つ、アルクロニウムと作動薬あるいは阻害薬の共存条件下での全反射赤外分光測定を行った結果、アルクロニウムの存在により作動薬についてはM2Rからの解離による結合スペクトル強度の減少、阻害薬については結合スペクトル強度の増加が観測された。さらに、詳細な解析の結果、アルクロニウムによる作動薬に対するアロステリックな阻害効果、および阻害薬に対する結合促進効果に反映した、M2Rの協同変化を示す差スペクトルを抽出することに成功した。これらの結果より、赤外分光法を用いることで、GPCRのアロステリック効果を原子レベルで捉えられることを実証した。また、アロステリックリガンドの濃度依存性など、物理化学的なパラメーターの取得にも成功している。さらに、リガンド結合部を構成するアミノ酸の変異体に対する測定により、赤外信号の帰属も達成し、これらの結果をまとめて、M2Rに対するNAMによるアロステリック効果を議論した論文を投稿予定である。一方で、Gタンパク質との結合誘起赤外分光解析を含めた、“タンパク質-タンパク質”相互作用解析の実現に向けて、光応答性GPCRであるロドプシンと抗体フラグメントとの結合誘起赤外分光解析を行った。そして、抗体フラグメントの選択的な結合によって、これまでに構造情報が未解明のロドプシン中間体の動的な構造変化情報を獲得し、その成果を論文に投稿、現在リバイズ中である。このように、“タンパク質―タンパク質”相互作用解析が可能になったため、今年度はM2RとGタンパク質フラグメント (mini Gタンパク質) との相互作用に伴う構造変化をスペクトル変化として取得することを目指す。すでに、大腸菌発現系によりmini Gタンパク質の精製試料を獲得している。今後は、作動薬とmini Gタンパク質の共存在下でのM2Rのダイナミックな構造変化解析を行う予定である。
Of our は, M2R sentaku な NAM の つ, ア ル ク ロ ニ ウ ム と actuation 薬 あ る い は resistance against 薬 の coexistence conditions で の total reflection spectrophotometric determination of を outside barefoot っ た results, ア ル ク ロ ニ ウ ム の is に よ り actuation 薬 に つ い て は M2R か ら の dissociation に よ る combining ス ペ ク ト ル の reduce strength, resistance to harm 薬 に つ い て は combining ス ペ ク ト <s:1> intensity <s:1> increase が観 measure された. さ ら に, detailed analytical の な results, ア ル ク ロ ニ ウ ム に よ る actuation 薬 に す seaborne る ア ロ ス テ リ ッ ク な resistance against unseen fruit, お よ び resistance against 薬 に す seaborne combination る promote unseen fruit に reflect し た, M2R の synergy - the poor を shown す ス ペ ク ト ル を spare す る こ と に successful し た. こ れ ら の results よ り, red spectrometry を with い る こ と で, GPCR の ア ロ ス テ リ ッ ク unseen fruit を atomic レ ベ ル で catch え ら れ る こ と を card be し た. ま た, ア ロ ス テ リ ッ ク リ ガ ン ド の concentration dependence な ど, physical and chemical な パ ラ メ ー タ ー の obtain に も successful し て い る. さ ら に, リ ガ ン ド bungalows を constitute す る ア ミ ノ acid の - variant に す seaborne る determination に よ り, red signal の 帰 も reach し and こ れ ら の results を ま と め て, M2R に す seaborne る NAM に よ る ア ロ ス テ リ ッ ク unseen fruit を comment し た paper contribute を designated で あ る. Party で, G タ ン パ ク qualitative と の combining induced outside red spectroscopic analytical を containing め た, "タ ン パ ク mass - タ ン パ ク quality interaction parsing の be am に to け て, light 応 answer GPCR で あ る ロ ド プ シ ン と antibody フ ラ グ メ ン ト と の combine induced outside the red line spectral analytical を っ た. そ し て, antibody フ ラ グ メ ン ト の sentaku な combined に よ っ て, こ れ ま で に structure intelligence が not interpret の ロ ド プ シ ン intermediates の な structural variations of dynamic intelligence を し, そ result を の に contribution, now リ バ イ ズ in で あ る. こ の よ う に, "タ ン パ ク mass - タ ン パ ク quality analytical が interaction may に な っ た た め, our は M2R と G タ ン パ ク qualitative フ ラ グ メ ン ト (mini G タ ン パ ク qualitative) と の に interaction with う structure - the を ス ペ ク ト ル variations change と し て obtain す る こ と を refers す. Youdaoplaceholder0, coliform bacteria are found in によ mini Gタ パ パ high-quality samples を obtained て て る る. Future は, actuation 薬 と mini G タ ン パ ク qualitative の coexist in で の M2R の ダ イ ナ ミ ッ ク な structure - dissolve the analysis line を う designated で あ る.
项目成果
期刊论文数量(36)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
ATR-FTIRによるアドレナリン受容体とリガンドの相互作用解析
使用 ATR-FTIR 分析肾上腺素能受体和配体的相互作用
- DOI:
- 发表时间:2023
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:西川遼;片山耕大;神取秀樹
- 通讯作者:神取秀樹
Application of ATR-FTIR spectroscopy for ligand recognition on kappa opioid receptor
ATR-FTIR 光谱在 kappa 阿片受体配体识别中的应用
- DOI:
- 发表时间:2023
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:S. Iwata;K. Katayama;K. Suzuki;R. Suno;C. Suno;H. Tsujimoto;T. Kobayashi;S. Iwata;H. Kandori
- 通讯作者:H. Kandori
ATR-FTIR study of ligand recognition on GPCRs
GPCR 上配体识别的 ATR-FTIR 研究
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:S. Iwata;K. Katayama;K. Suzuki;R. Suno;C. Suno;H. Tsujimoto;T. Kobayashi;S. Iwata;H. Kandori
- 通讯作者:H. Kandori
全反射赤外分光法によるkappa-オピオイド受容体のリガンド認識機構研究
全内反射红外光谱研究κ阿片受体配体识别机制
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:岩田聖矢;魲洸平;片山耕大;辻本浩一;寿野千代;寿野良二;岩田想;小林拓也;神取秀樹
- 通讯作者:神取秀樹
全反射赤外分光法によるアセチルコリン受容体のアロステリック機構の解析
全内反射红外光谱分析乙酰胆碱受体的变构机制
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:杉浦勇也;片山耕大;寿野良二;神取秀樹
- 通讯作者:神取秀樹
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
片山 耕大其他文献
視覚ロドプシンとは逆向きの異性化反応を示すハエトリグモペロプシンの光異性化機構解析
跳蛛视紫红质的光异构化机制分析,其表现出与视觉视紫红质相反方向的异构化反应。
- DOI:
- 发表时间:
2022 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
犬飼 紫乃;片山 耕大;杉原 智博;小柳 光正;寺北 明久;神取 秀樹 - 通讯作者:
神取 秀樹
色覚センサータンパク質の色認識とシグナル伝達の分子機構
色觉传感器蛋白颜色识别和信号转导的分子机制
- DOI:
- 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
石井 宏和;大友 康平;根本 知己;片山 耕大 - 通讯作者:
片山 耕大
赤外線とX線を融合させたGタンパク質共役型受容体の構造・機能相関研究
利用红外线和X射线研究G蛋白偶联受体的结构-功能关系
- DOI:
- 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Lim Wei Ming;Ito Yuma;Sakata-Sogawa Kumiko;Tokunaga Makio;片山 耕大 - 通讯作者:
片山 耕大
片山 耕大的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('片山 耕大', 18)}}的其他基金
振動分光法を基軸としたGPCRアロステリックリガンド作用機構解明
基于振动光谱阐明GPCR变构配体的作用机制
- 批准号:
23K21097 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.07万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
相似海外基金
振動分光法を基軸としたGPCRアロステリックリガンド作用機構解明
基于振动光谱阐明GPCR变构配体的作用机制
- 批准号:
23K21097 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.07万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Development of sunitinib-based molecular targeted drug conjugates
基于舒尼替尼的分子靶向药物缀合物的开发
- 批准号:
19K16325 - 财政年份:2019
- 资助金额:
$ 11.07万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Study of the affinities of allosteric ligands for G protein-coupled receptors by the measurement of cellular signaling
通过测量细胞信号传导研究变构配体对 G 蛋白偶联受体的亲和力
- 批准号:
26460092 - 财政年份:2014
- 资助金额:
$ 11.07万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
自己受容体とSNARE蛋白質群との直接相互作用による開口放出抑制機構の解明
通过自身受体和 SNARE 蛋白之间的直接相互作用阐明胞吐抑制机制
- 批准号:
18700356 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 11.07万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
ソフトな分子間相互作用を認識できるペプチドプローブの開発と応用
识别软分子间相互作用的肽探针的开发及应用
- 批准号:
16048202 - 财政年份:2004
- 资助金额:
$ 11.07万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas