Verification of the subfunctionalization hypothesis in paralogous genes by engrafting cis-regulatory elements
通过植入顺式调控元件验证旁系同源基因的亚功能化假说
基本信息
- 批准号:21H02543
- 负责人:
- 金额:$ 11.15万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- 财政年份:2021
- 资助国家:日本
- 起止时间:2021-04-01 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
2022年度はDlx3-4遺伝子クラスターおよびDlx5-6遺伝子クラスターの構造の類似性に注目し、CTCFによる長距離ゲノム領域間でのループ形成などによって物理的にプロモーターと近くなる領域のクラスター間での構造的類似性および鰓弓でのエンハンサー活性の強さから、Dlx3-4遺伝子クラスターではTAD3鰓弓エンハンサー、Dlx5-6遺伝子クラスターでは新規の鰓弓のエンハンサーをそれぞれターゲットとして選定し、エンハンサーノックアウトマウスをCRISPR/Cas9で作製し系統化した。このマウスを用いて、正確にエンハンサー欠失の発現量変化を定量できるAccu-cis法を用いてRNA-seq結果から鰓弓発現に及ぼすその影響を評価した。Dlx56鰓弓エンハンサー欠失マウスでは下顎が上顎化する顕著な表現型が観察された。このマウスの表現型をパラログ活性化でレスキューすることが可能かどうかを確認するため、Dlx56鰓弓エンハンサーをDlx3-4遺伝子クラスターにノックインしたマウスを作成し、交配によりその解析を進めているところである。また、Dlx3-4遺伝子の鋤鼻器エンハンサーをクラスターとして欠失することで効率よく鋤鼻器組織特異的なノックダウンを実現できることが示され、新たな条件付きノックアウトマウス作成の方法論へとつながる成果となった。特に、通常ノックアウトで致死的な表現型を示す遺伝子の場合に、この方法により致死性を回避しつつ特定器官での遺伝子機能解析が可能になる新たな実験系として期待し検証を進めている。
In the year of 2022, Dlx3-4 sub-equipment equipment Dlx5-6 sub-equipment was used to create a high level of similarity, CTCF equipment was used for long-distance communication in the field of communication, and the formation of equipment in the field of long-distance communication. The performance of the device was similar to that of physics. Dlx3-4, TAD3, CRISPR/Cas9, and Dlx5-6, respectively, do not know how to systematize the system. The quantitative Accu-cis method is based on the RNA-seq results. The results show that there are significant differences between the two methods. The Dlx56 bow is not good enough to show that it is in the lower part of the table. You may want to make sure that you have a problem, Dlx56 may want to make sure that you have a problem, and that you may have a problem with Dlx3-4. You may want to know if you have a problem, and that you will not be able to do so. In the Dlx3-4 system, the nasal apparatus is not available. The rate of loss of the nasal apparatus is higher than that of the nasal tissue. The results show that the method is based on the results. In particular, the table type that usually causes death shows that the child is closed, and the method is used to avoid the death of specific organs. the sub-machine is able to analyze the possibility that the new system can be used in the future.
项目成果
期刊论文数量(20)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
頭顔面形態発生を司るDlx遺伝子の発現調節機構とその進化
颅面形态发生Dlx基因的表达调控机制及其进化
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Nakagawa Hiroyuki;Maehara Shiori;Kume Kazuhiko;Ohta Hiroto;Tomita Jun;隅山 健太
- 通讯作者:隅山 健太
Conditional gene knockout by enhancer cluster elimination in the Dlx3-4 bigene system
Dlx3-4 双基因系统中通过增强子簇消除进行条件基因敲除
- DOI:
- 发表时间:2023
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Akira Tanave;Kenta Sumiyama
- 通讯作者:Kenta Sumiyama
脊椎動物祖先まで遡る起源の古いcis-element機能の哺乳類個体でのin vivo 定量評価
哺乳动物个体体内定量评估可追溯到脊椎动物祖先的古代顺式元素功能
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:隅山 健太;田邉 彰
- 通讯作者:田邉 彰
筋細胞の融合にかかわる内 在性レトロウイルス由来の新規遺伝子
源自内源性逆转录病毒的新基因参与肌肉细胞融合
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Nakashima Mitsuko;Argilli Emanuela;Nakano Sayaka;Sherr Elliott H.;Kato Mitsuhiro;Saitsu Hirotomo;上田真保子
- 通讯作者:上田真保子
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
隅山 健太其他文献
遺伝子改変マウスを用いた非コード領域の進化的研究
使用转基因小鼠进行非编码区的进化研究
- DOI:
- 发表时间:
2017 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Fukumori Hiroaki;Hasegawa Kazunori;Kano Yasunori;隅山 健太;隅山 健太 - 通讯作者:
隅山 健太
SMART Tg マウスを用いた急性腎障害によるネクロプトーシスの in vivo FRET 解析
使用 SMART Tg 小鼠对急性肾损伤引起的坏死性凋亡进行体内 FRET 分析
- DOI:
- 发表时间:
2022 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
村井 晋;隅山 健太;森脇 健太;高倉 加奈子;山口良文;駒澤 幸子;寺井 健太;松田 道行;中野 裕康 - 通讯作者:
中野 裕康
初代マウスで表現型解析可能なゲノム編集技術の開発と進化学研究への応用
开发可对第一代小鼠进行表型分析的基因组编辑技术及其在进化研究中的应用
- DOI:
- 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
隅山 健太 - 通讯作者:
隅山 健太
鋤鼻器のDlx3 /Dlx4 遺伝子発現に必須なシス調節モジュールクラスターの発見
犁鼻器官中 Dlx3/Dlx4 基因表达必需的一系列顺式调控模块的发现
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
田邉 彰;隅山 健太 - 通讯作者:
隅山 健太
2-クロロプロペンの水素化脱塩素反応における単元系還元触媒の活性挙動
单组分还原催化剂在2-氯丙烯加氢脱氯反应中的活性行为
- DOI:
- 发表时间:
2022 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
村井 晋;隅山 健太;森脇 健太;高倉 加奈子;山口良文;駒澤 幸子;寺井 健太;松田 道行;中野 裕康;日和田有香・矢原稜太・霜田直宏・杉山 茂 - 通讯作者:
日和田有香・矢原稜太・霜田直宏・杉山 茂
隅山 健太的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('隅山 健太', 18)}}的其他基金
エンハンサーが駆動する進化メカニズムの合成的手法による解明
使用合成方法阐明增强子驱动的进化机制
- 批准号:
24K02076 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
トランスポゾン由来進化的高度保存配列の転写調節機能獲得の進化メカニズムの解明
阐明通过转座子衍生的高度保守的进化保守序列获得转录调节功能的进化机制
- 批准号:
20657003 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
マウス鰓弓内で遠近軸情報を規定するDlx3遺伝子の発現調節機構の解析
决定小鼠鳃弓近轴信息的Dlx3基因表达调控机制分析
- 批准号:
16027253 - 财政年份:2004
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
霊長類免疫グロブリンCα遺伝子ヒンジ領域における正淘汰進化の研究
灵长类免疫球蛋白Cα基因铰链区正选择进化的研究
- 批准号:
96J01636 - 财政年份:1998
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
相似海外基金
Coupled Evolution of Ice Shelf and Ocean in the Amundsen Sea Sector of Antarctica
南极阿蒙森海区冰架与海洋的耦合演化
- 批准号:
NE/Y001338/1 - 财政年份:2026
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Research Grant
Coupled Evolution of Ice Shelf and Ocean in the Amundsen Sea Sector of Antarctica
南极阿蒙森海区冰架与海洋的耦合演化
- 批准号:
NE/Y000811/1 - 财政年份:2026
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Research Grant
SHINE: The Evolution of Coronal Dimmings and Their Relationship to Eruptive Phenomena
闪耀:日冕变暗的演变及其与喷发现象的关系
- 批准号:
2400789 - 财政年份:2025
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Continuing Grant
Human-Robot Co-Evolution: Achieving the full potential of future workplaces
人机协同进化:充分发挥未来工作场所的潜力
- 批准号:
DP240100938 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Discovery Projects
Population genomic methods for modelling bacterial pathogen evolution
用于模拟细菌病原体进化的群体基因组方法
- 批准号:
DE240100316 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Discovery Early Career Researcher Award
進化的ハイブリッドハイパーヒューリスティクスの新展開
进化混合超启发法的新进展
- 批准号:
24K15098 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
意思決定支援のための大規模並列多目的進化計算システムの開発
开发用于决策支持的大规模并行多目标进化计算系统
- 批准号:
24K15119 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
アナログ回路に基づく進化計算手法による深層学習モデルの最適化
基于模拟电路的进化计算方法优化深度学习模型
- 批准号:
24K15115 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Seeing in the dark: evolution of supraglacial lakes on the Greenland and Antarctic ice sheets during polar night
黑暗中的视觉:极夜期间格陵兰岛和南极冰原上冰上湖泊的演化
- 批准号:
2902592 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Studentship
The Role of Climate Change in Early Human Behavioural Evolution
气候变化在早期人类行为进化中的作用
- 批准号:
2903287 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Studentship