Comprehensive analysis of roles of endogenous virome during virus infection

近年、常在細菌叢は、粘膜における感染防御や免疫制御などで重要な働きを持ち、１つの臓器として捉えられるようになってきた。一方で、同じ常在微生物叢であっても、常在ウイルス叢については、これまで体系だった解析は行われてきていない。本研究では、常在ウイルス叢として、内在性レトロウイルス（ERV）とレトロトランスポゾン、内在性RNAウイルス配列からなる「内在性ウイルス叢」を想定する。その上で、外来性ウイルス感染が内在性ウイルス叢にどのような変化をもたらし、その変化がどのようにウイルス感染に影響するのかを、体系的・統合的に明らかにする。本年度は、ウイルス感染による生じた内在性ウイルス配列の機能解析とレトロトランスポゾンの生理意義の解明を計画した。その結果、本年度の研究においては、以下に示す結果を得た。（１）RNAウイルスのボルナウイルスが感染により形成されたと考えられる内在性ボルナウイルス配列についてその機能解析を行なった。ヒトボルナウイルス配列-2がミトコンドリアに局在するタンパク質をコードしていることを明らかにした。このタンパク質が細胞生存に関わることを明らかにした。（2）レトロトランスポゾンのアンチセンスプロモーターから発現するレトロトランスポゾン叢を、既に構築済みの独自の解析パイプラインを用いて解析した。その結果、このレトロトランスポゾン叢が、細胞増殖を制御していることが明らかとなった。このように本年度は、内在性ウイルス叢の挙動とその意義について、概ね順調に解析を進めることができた。

近年、常在細菌叢は、粘膜における感染防御や免疫制御などで重要な働きを持ち、１つの臓器として捉えられるようになってきた。一方で、同じ常在微生物叢であっても、常在ウイルス叢については、これまで体系だった解析は行われてきていない。本研究では、常在ウイルス叢として、内在性レトロウイルス（ERV）とレトロトランスポゾン、内在性RNAウイルス配列からなる「内在性ウイルス叢」を想定する。その上で、外来性ウイルス感染が内在性ウイルス叢にどのような変化をもたらし、その変化がどのようにウイルス感染に影響するのかを、体系的・統合的に明らかにする。本年度は、ウイルス感染による生じた内在性ウイルス配列の機能解析とレトロトランスポゾンの生理意義の解明を計画した。その結果、本年度の研究においては、以下に示す結果を得た。（１）RNAウイルスのボルナウイルスが感染により形成されたと考えられる内在性ボルナウイルス配列についてその機能解析を行なった。ヒトボルナウイルス配列-2がミトコンドリアに局在するタンパク質をコードしていることを明らかにした。このタンパク質が細胞生存に関わることを明らかにした。（2）レトロトランスポゾンのアンチセンスプロモーターから発現するレトロトランスポゾン叢を、既に構築済みの独自の解析パイプラインを用いて解析した。その結果、このレトロトランスポゾン叢が、細胞増殖を制御していることが明らかとなった。このように本年度は、内在性ウイルス叢の挙動とその意義について、概ね順調に解析を進めることができた。