Assessment of metal impacts on aquatic insects using environmental DNA by developing a database of highly reliable DNA references.

通过开发高度可靠的 DNA 参考数据库，利用环境 DNA 评估金属对水生昆虫的影响。

• 批准号: 21H03624
• 负责人: 今藤 夏子
• 金额: $ 10.73万
• 依托单位: National Institute for Environmental Studies
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H03624/
• 关键词: 水生昆虫; DNAバーコード; メタバーコーディング; 休廃止鉱山; 重金属汚染

本年度は、水生昆虫の参照DNA塩基配列の収集と、前年度に調査を実施した廃鉱山下流のコドラート調査結果の解析、環境DNAによる多様性解析を中心に研究を進めた。水生昆虫標本の収集を主に東日本において進め、引き続き形態同定と、昆虫において標準的なDNAバーコード配列であるミトコンドリアCOIの塩基配列解析を行った。また、本年度は新たにミトコンドリア16S rRNA領域の配列取得も開始した。本年度得た標本のほか、前年度までにCOIを解析した標本についても対象とした。この16S rRNA領域については、2022年度に新たに発表されたユニバーサルプライマーが多様性検出に有効であることが報告されつつあり、データベースの拡充が期待されている。種名が確定した配列については、国際塩基配列データベースに登録し、塩基配列を公開予定である。また、隠ぺい種など分類学上の整理が必要な種については、形態と塩基配列による検討を進めた。コドラート調査で得られた底生動物の種数や個体数は、廃止鉱山下流では参照地点に比べて顕著に減少していた。また、コドラート調査と同じ地点において得られた環境DNA解析も進めた。リファレンス地点1箇所を含む5箇所の調査地点について、新たにCOIの2種類、16S rRNAの1種類、合計３種類のプライマーセットによる解析を進めた。2種類のCOIプライマーセットについて、得られた塩基配列は、既存国際データベースに基づく相同性検索により生物分類名を同定した。検出された水生昆虫の多様性の比較を行ったところ、両プライマーセットで概ね同様の結果が得られた。今後、本研究で得られたリファレンス配列に基づくデータベースを用いることで、同定精度の向上が見られるかについて検証する。コドラート調査と環境DNAで得られる多様性の比較、COI領域と16S領域における検出多様性の比較も引き続き進める。

This year, the collection of reference DNA sequences of aquatic insects, the analysis of the results of the previous year's survey of aquatic insects and the analysis of diversity of environmental DNA have been carried out. Aquatic insect species are mainly collected in the east of Japan, and the morphological identity of insects is determined. The DNA sequence of insects is determined by DNA sequence analysis. This year, the new 16S rRNA domain has been allocated. This year's COI analysis was carried out on the basis of the results obtained in the previous year. The 16S rRNA domain is currently under review. In 2022, new reports will be issued for diversity detection. The species name is determined by the assignment, the international base assignment is registered, and the base assignment is publicly determined. Taxonomical arrangement of species, morphological arrangement of species, morphological arrangement, morphological arrangement of species, morphological arrangement of species, morphological arrangement, morphological arrangement of species, morphological arrangement of species, morphological arrangement, morphological arrangement of species, morphological arrangement of species, morphological arrangement, morphological arrangement of species, morphological arrangement of species, morphological The number of species and individuals found in the survey decreased compared with the reference site. The environmental DNA analysis was carried out in the same place as the investigation. The analysis of 1 site, including 5 sites, was carried out for 2 species of COI, 1 species of 16S rRNA, and 3 species in total. 2. The classification of species is the same as that of existing international species. A comparison of the diversity of aquatic insects found here shows that the results are generally the same. In the future, this study will be based on the use of the same precision and upward observation of the same precision. Comparison of diversity between COI and 16S domains, and comparison of diversity between COI and 16S domains

项目成果

環境DNAによる昆虫多様性検出とデータベースの重要性

利用环境 DNA 检测昆虫多样性以及数据库的重要性

• 发表时间: 2022
• 作者: Oguri Hidetoshi;Nakashima Kazunori;Godigamuwa Kasun;Okamoto Junnosuke;Takeda Yudai;Okazaki Fumiyoshi;Sakono Masafumi;Kawasaki Satoru;渡辺幸一，楊柳，姫玖玖，中村賢，大谷拓也，森絢三朗;今藤夏子
• 通讯作者: 今藤夏子

水生昆虫のDNAバーコード収集と公開、環境DNA解析への応用

水生昆虫DNA条形码的收集与出版及其在环境DNA分析中的应用

• 发表时间: 2021
• 作者: Jamhari Anas Ahmad;Latif Mohd Talib;Wahab Muhammad Ikram A.;Hassan Hanashriah;Othman Murnira;Abd Hamid Haris Hafizal;Tekasakul Perapong;Phairuang Worradorn;Hata Mitsuhiko;Furuchi Masami;Rajab Nor Fadilah;渡辺幸一，楊柳，中村賢，大谷卓也，長村遥，増田竜之;今藤夏子;羽野健志，伊藤克敏，伊藤真奈，高島景，宗宮麗，高井優生，大嶋雄治，大久保信幸;今藤夏子
• 通讯作者: 今藤夏子

The genetic differentiation within species in two Nanocladius species phoretic on Megaroptera and Plecopteara

大翅目和斑翅目两个纳米枝属物种内的遗传分化

• 发表时间: 2022
• 作者: Natsuko I. Kondo;Yasue Inoue;Hiroshi C. Ito;Nobuyoshi Nakajima
• 通讯作者: Nobuyoshi Nakajima

国立環境研究所における環境ゲノム科学研究推進事業の紹介

国立环境研究所环境基因组科学研究推进项目介绍

• 发表时间: 2021
• 作者: 中嶋信美;今藤夏子;山口晴代;安藤温子
• 通讯作者: 安藤温子

Biodiversity monitoring is essential to be a sustainable and resilient society

生物多样性监测对于建设可持续和有复原力的社会至关重要

• 发表时间: 2021
• 作者: Karin Hain;Michael Kern;Jixin Qiao;Francesca Quinto;Aya Sakaguchi;Peter Steier;Gabriele Wallner;Andreas Wiederin;Akihiko Yokoyama;and Robin Golser;佐藤琢;渡辺幸一，楊柳，中村賢，大谷卓也，長村遥，増田竜之，千村勘二，森藤孝太郎，中澤暦;Noriko Uchida
• 通讯作者: Noriko Uchida