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両親が同じでも表現型が異なる合成パンコムギ系統間のエピゲノム解析

具有相同亲本但不同表型的合成面包小麦品系之间的表观基因组分析

基本信息

批准号：
19K22309
负责人：
宅見薫雄
金额：
$ 4.16万
依托单位：
Kobe University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019 至 2020
项目状态：
已结题

项目摘要

異質倍数体の作物では近縁野生種の有用遺伝子を作物育種に効果的に利用するため、種間交雑を介して両親の染色体セットを併せ持つ「合成倍数体」が中間体として利用される。しかし、異質倍数化の過程でゲノムの再編成やクロマチン修飾の再構成が行われることが多々ある。また現在のところ、クロマチン修飾の違いが実際に同一の遺伝子型をもつ合成倍数体系統の表現型の差異を生み出すという明確なデータはない。そこで、マカロニコムギにタルホコムギを交雑して得られた合成6倍体で、同一交雑組み合わせに由来し表現型が異なる系統を材料に、クロマチンのエピジェネティック修飾の違いが転写産物のプロファイルの違いに関係するかを検討するのが本研究の目的である。同一交雑組み合わせに由来するAABBDDゲノムを有する合成パンコムギ2系統Syn6256-16とSyn6256-12を解析に用いた。2年間の圃場における調査によって、合成パンコムギ2系統後代の圃場での表現型は明確に異なっていた。RNA-seq解析を行ったところ、生育不全が認められたSyn6256-12では4B染色体に大きな欠失が見出された。さらにSyn6256-12の後代には1B染色体上にも欠失が見出された個体がいくつか存在することが明らかになった。すなわち、生育不良を示す系統では染色体上に新規の欠失が生じている可能性が高く、そのような個体の後代ではさらに新たな欠失が生じる可能性が高いことが示唆された。Syn6256-16よりSyn6256-12で遺伝子発現量が減少した遺伝子についてGO解析をしたところ、タンパク質の合成、光合成に関連する遺伝子が多く含まれていた。Syn6256-12の生育不全は、様々な機能を担うタンパク質の合成や光合成の働きが損なわれることによって生じたことが示唆された。根端をwhole mountでCENH3me2, H3K9me2抗体により免疫染色し、蛍光顕微鏡でヒストン修飾を解析したが、Syn6256-16とSyn6256-12の間で顕著な違いを見出すことはできなかった。

The use of seeds in the breeding of fruit in wild plants, the use of seeds, the introduction of rice chromosomes, the use of synthetic ploidy, and the use of synthetic polyploidy. In the process of multiplying and multiplying, the process is changed and then edited into a multiplicative process and then edited into a line. Now that you are in the system, you can make sure that you can make sure that you have a good understanding of the system. In this paper, we have obtained the results of the synthesis of 6-ploidy, the origin of the same communication group and the origin of the system materials in the same group. in this study, the purpose of this study is to achieve the purpose of this study. The reason for the combination of the same communication group is that the synthetic AABBDD system Syn6256-16 Syn6256-12 is used to analyze the system. In the past 2 years, the tables of the future generations of nursery farms and synthetic nursery farms have clearly demonstrated that they are in good condition. RNA-seq analysis showed that the number of chromosomes in Syn6256-12 and 4B chromosomes were large and deficient, while those with birth defects were abnormal. In the later generations of Syn6256-12, there was a deletion on chromosome 1B and there was a significant difference in the number of individuals. Pregnancy and malbirth indicate that new regulations on the chromosomes of the system are highly likely to be lost, while the offspring of children are likely to have a high probability of losing a child. Syn6256-16 "Syn6256-12"son", "less", "son", "GO analysis", "synthesis", "synthesis", "light synthesis", "son", "less", "less", "" Syn6256-12 fetal anaplasia, which is responsible for the synthesis of light synthesis, has been shown to be instigated by the birth of the baby. Root tip whole mount CENH3me2, H3K9me2 antibody immunostaining, light microanalysis, Syn6256-16 Syn6256-12 immunostaining, Syn6256-16 antibody immunostaining, light microscopy, immunostaining, immunostaining, immunostaining