細胞外小胞の不均質性を可視化するデジタルMSイメージング

エクソソームをはじめとした細胞外小胞が、がん領域で重要視されるようになり、その小胞に含まれる核酸やタンパク質の解析が盛んに行われている。しかしながら、がん細胞の不均質性が議論されているにも関わらず、細胞外小胞内容物の不均質性については未知の部分が多い。これは、単一細胞の分泌物を捕捉・可視化できる手法が確立していないことが大きい。単一細胞由来のエクソソームを含む細胞外小胞を解析できれば、細胞外小胞の不均質性についての新たな知見が得られるばかりでなく、細胞外小胞を利用した新規腫瘍マーカー探索に貢献できると考えられる。そこで本研究では、単一がん細胞由来の細胞外小胞に含まれる分子群の可視化に向けたプラットフォームの構築を目指す。昨年度は、研究分担者の所属する東京農工大学と引継ぎに伴った再現性の確認を実施した。また、オンラインミーティングを活用して、バイオインフォマティクスを応用した解析手法を用いた評価のまとめを進めている。そこで、分泌タンパク質と1分子のRNA-seqを実施し、興味深い分子が細胞株レベルであるが同定されつつある。当施設内での感染対策の緩和に伴い、現地でのやり取りを増やすことができ、コロナ禍前と同様な緊密な情報交換が可能になってきた。これが研究の推進につながることを期待している。その一方で、がんゲノム医療中核拠点病院としての業務拡大、AMEDの研究拡大、新部署の立ち上げに伴い、この研究に対するエフォートが十分に確保できていない状況にあり、研究は遅れている。

エクソソームをはじめとした細胞外小胞が、がん領域で重要視されるようになり、その小胞に含まれる核酸やタンパク質の解析が盛んに行われている。しかしながら、がん細胞の不均質性が議論されているにも関わらず、細胞外小胞内容物の不均質性については未知の部分が多い。これは、単一細胞の分泌物を捕捉・可視化できる手法が確立していないことが大きい。単一細胞由来のエクソソームを含む細胞外小胞を解析できれば、細胞外小胞の不均質性についての新たな知見が得られるばかりでなく、細胞外小胞を利用した新規腫瘍マーカー探索に貢献できると考えられる。そこで本研究では、単一がん細胞由来の細胞外小胞に含まれる分子群の可視化に向けたプラットフォームの構築を目指す。昨年度は、研究分担者の所属する東京農工大学と引継ぎに伴った再現性の確認を実施した。また、オンラインミーティングを活用して、バイオインフォマティクスを応用した解析手法を用いた評価のまとめを進めている。そこで、分泌タンパク質と1分子のRNA-seqを実施し、興味深い分子が細胞株レベルであるが同定されつつある。当施設内での感染対策の緩和に伴い、現地でのやり取りを増やすことができ、コロナ禍前と同様な緊密な情報交換が可能になってきた。これが研究の推進につながることを期待している。その一方で、がんゲノム医療中核拠点病院としての業務拡大、AMEDの研究拡大、新部署の立ち上げに伴い、この研究に対するエフォートが十分に確保できていない状況にあり、研究は遅れている。