RNAポリメラーゼを中心に形成される中核的複合体の構造基盤
RNA聚合酶周围形成核心复合物的结构基础
基本信息
- 批准号:20H00461
- 负责人:
- 金额:$ 28.62万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
- 财政年份:2020
- 资助国家:日本
- 起止时间:2020-04-01 至 2021-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
DNAの遺伝情報をRNAに転写する巨大なタンパク質複合体であるRNAポリメラーゼは、細胞内の様々な分子と相互作用し、多くの生命機能を支えるハブとして機能している。しかしながら、これらの諸機能と転写との接点で形成される分子の実体やその構造、機能や制御のメカニズムはほとんど分かっていない。RNAポリメラーゼを中心に形成される超複合体の構造解析を行うことを目指し、以下の研究に着手した。RNAポリメラーゼII (RNAP II)による転写は、クロマチン構造をとったDNA上で行われる。我々はすでに、クロマチンの基本単位であるヌクレオソームとRNAP IIとの複合体の構造解析に成功しており、RNAP IIがヒストンからDNAを段階的に引き剥がしつつヌクレオソームDNAを転写するメカニズムを明らかにしている。転写に伴うエピジェネティクス関連因子の作用メカニズムを解明するために、ヌクレオソームDNAの転写系にこれらの因子を加えて得られた複合体の構造解析に着手した。転写を開始したRNAP IIは、一般に転写開始点の近傍で一時停止する。高等真核生物では、転写の一時停止は転写制御に重要と考えられている。高等真核生物に固有の転写制御の構造基盤を解明するために、一時停止複合体の構造解析をを行う準備を進めた。細菌では、リボソームによるmRNAの翻訳が完了すると、リボソームと入れ替わりに転写終結因子RhoがRNAPに結合して転写を終結させる。Rhoによる転写終結および翻訳との連携の構造基盤を明らかにするために、複合体の構造解析を進めた。
Traces of DNA の 伝 intelligence を RNA に planning write す る huge な タ ン パ ク qualitative complex で あ る RNA ポ リ メ ラ ー ゼ は, intracellular の others 々 な molecular と し, interaction between many く の vital functions with を え る ハ ブ と し て function し て い る. し か し な が ら, こ れ ら の と the function planning write と の contact で form さ れ る molecular の be body や そ の structure, functional や suppression の メ カ ニ ズ ム は ほ と ん ど points か っ て い な い. RNA ポ リ メ ラ ー ゼ を center に form さ れ る super complex の structure line を う こ と を refers し, the following の に to し た. RNAポリメラ ポリメラ ゼ ゼII (RNAP II)による転 writes ゼ and ロ ロ チ チ <s:1> constructs で rows われる on をとったDNA. I 々 は す で に, ク ロ マ チ ン の basic 単 a で あ る ヌ ク レ オ ソ ー ム と RNAP II と の complex の structure に successful し て お り, RNAP II が ヒ ス ト ン か ら DNA を guide Duan Jie に き peel が し つ つ ヌ ク レ オ ソ ー ム DNA を planning write す る メ カ ニ ズ ム を Ming ら か に し て い る. Planning to write に with う エ ピ ジ ェ ネ テ ィ ク ス masato even factors の メ カ ニ ズ ム を interpret す る た め に, ヌ ク レ オ ソ ー ム DNA の planning write system に こ れ ら の factor を plus え て must ら れ た complex の structure に to し た. Youdaoplaceholder0 writes を to start <s:1> たRNAP II, and generally に転 to start する near で to stop する for a moment. Higher eukaryotes で 転, 転 write 転 for a moment, 転 転 write control に important と examination えられて る る. Higher eukaryotes に inherent の planning write suppression の structure substrate を interpret す る た め に, temporarily stop complex の structure parsing を を line う prepare を into め た. Bacteria で は, リ ボ ソ ー ム に よ る mRNA の turn 訳 が finished す る と, リ ボ ソ ー ム と into れ for わ り に planning write end factor Rho が RNAP に combining し て planning write を end さ せ る. Rhoによる転 write to the end および flip through 訳と <s:1> link the <s:1> structure base disk を, ら にするために にするために, complex <s:1> structure analysis を enter めた.
项目成果
期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
関根 俊一其他文献
Analyses of the general rule on residue pair frequencies in local amino acid sequences of soluble ordered proteins
可溶性有序蛋白局部氨基酸序列残基对频率一般规律分析
- DOI:
10.1002/pro.2255 - 发表时间:
2013 - 期刊:
- 影响因子:8
- 作者:
中川 裕文;倉谷 光央;伊藤(後藤) 桜子;伊藤 拓宏;桂 一茂;寺田 貴帆;白水 美香子;関根 俊一;鴫 直樹;横山 茂之;鴫 直樹;中川 裕文;Naoki Shigi;Shirota M and Kinoshita K. - 通讯作者:
Shirota M and Kinoshita K.
Structural basis for the trans- and cis-interactions of the voltage-gated sodium channel β subunits
电压门控钠通道β亚基反式和顺式相互作用的结构基础
- DOI:
- 发表时间:
2014 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
清水 英明; 白水 美香子; 貫名 信行;関根 俊一;横山 茂之 - 通讯作者:
横山 茂之
ピキア酵母ヌクレオソームのCryo-EM構造解析および生化学的解析
毕赤酵母核小体的冷冻电镜结构和生化分析
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
福島 友太郎;畠澤 卓;滝沢 由政;鯨井 智也;江原 春彦;関根 俊一;胡桃坂 仁志 - 通讯作者:
胡桃坂 仁志
DNA オリガミを用いたタンパク質の構造解析に向けて
使用 DNA 折纸技术进行蛋白质结构分析
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
福本 紘大;村山 祐子;Yuxiang Liu;Bingxun Wang;原田 慶恵;多田隈 尚史;関根 俊一 - 通讯作者:
関根 俊一
古細菌/真核生物型フェニルアラニルtRNA合成酵素の校正機構
古菌/真核苯丙氨酰-tRNA合成酶的校准机制
- DOI:
- 发表时间:
2007 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
佐々木 浩;関根 俊一;横山 茂之 - 通讯作者:
横山 茂之
関根 俊一的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('関根 俊一', 18)}}的其他基金
クロマチンを背景とした転写の構造基盤
基于染色质的转录的结构基础
- 批准号:
24H00062 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 28.62万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
Structural basis of higher-order complexes connecting transcription and its related functions
连接转录及其相关功能的高阶复合体的结构基础
- 批准号:
20H05690 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 28.62万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
転写終結複合体のX線結晶構造解析
转录终止复合物的X射线晶体结构分析
- 批准号:
17770083 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 28.62万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
ヒト由来グルタミルプロリルtRNA合成酵素のX線結晶構造解析
人源谷氨酰脯氨酰 tRNA 合成酶的 X 射线晶体结构分析
- 批准号:
14780482 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 28.62万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
仏教工芸品の体系的分類と検索に関する基礎的研究
佛教文物系统分类与检索基础研究
- 批准号:
03610029 - 财政年份:1991
- 资助金额:
$ 28.62万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
鈴身に仏教尊像を表現した金剛鈴の基礎的研究
以钟体表现佛像的金刚钟的基础研究
- 批准号:
63710030 - 财政年份:1988
- 资助金额:
$ 28.62万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
相似海外基金
クライオ電子顕微鏡法を用いたGPCR創薬研究
使用冷冻电子显微镜进行 GPCR 药物发现研究
- 批准号:
23K24014 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 28.62万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
クライオ電子顕微鏡による生体膜構造生物学
使用冷冻电子显微镜进行生物膜结构生物学
- 批准号:
23K27132 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 28.62万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
クライオ電子顕微鏡による光合成蛋白質超複合体の構造解析基盤
使用冷冻电子显微镜进行光合蛋白超复合物结构分析的平台
- 批准号:
23K27121 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 28.62万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
クライオ電子顕微鏡を用いた異常構造粒子の新規分析法と機能評価に関する研究
利用冷冻电子显微镜研究异常结构颗粒的新分析方法和功能评价
- 批准号:
24KJ1573 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 28.62万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
クライオ電子顕微鏡による嗅覚受容体のシグナル伝達機構の解明
使用冷冻电子显微镜阐明嗅觉受体的信号转导机制
- 批准号:
24KJ0906 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 28.62万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
クライオ電子顕微鏡によるSARS-CoV-2細胞侵入機構の解明
使用冷冻电子显微镜阐明 SARS-CoV-2 细胞侵袭机制
- 批准号:
24KJ1540 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 28.62万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
クライオ電子顕微鏡画像データとシミュレーションの融合による生体高分子動的構造解析
结合冷冻电子显微镜图像数据和模拟对生物聚合物进行动态结构分析
- 批准号:
24K09347 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 28.62万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
クライオ電子顕微鏡によるメラトニン受容体のシグナル伝達機構の解明
使用冷冻电子显微镜阐明褪黑激素受体信号转导机制
- 批准号:
22KJ0604 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 28.62万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
クライオ電子顕微鏡による「柔らかい」一回膜貫通タンパク質の可視化
通过冷冻电子显微镜观察“软”单次跨膜蛋白
- 批准号:
23K18193 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 28.62万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
クライオ電子顕微鏡法による甘味受容体の単粒子解析
使用冷冻电子显微镜对甜味受体进行单颗粒分析
- 批准号:
23KJ0491 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 28.62万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows