权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

メタゲノミクスによる海綿における天然有機化合物生産機構の解明

利用宏基因组学阐明海绵中天然有机化合物的产生机制

基本信息

批准号：
20H03080
负责人：
末永光
金额：
$ 11.07万
依托单位：
National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

海洋生物である海綿からは、非常にユニークな構造からなる生理活性物質が単離されているが、その真の生産者は、共生する培養困難な微生物であることが知られている。本研究課題では、海綿に共生する培養困難な微生物が生産する医薬品候補化合物であるマンザミンを標的モデル化合物として、海洋動物に由来する生物活性物質の生産を担う微生物の同定、および生合成機構の解明を行う。海綿と微生物との共生関係を、生物活性化合物を鍵として紐解き、将来的に化合物の安定供給に繋げることを目指す。前年度までに、マンザミンを共通に生産する 2 種の海綿、Haliclona sp.ならびに、A. ingens を沖縄近海で採取し、採取サンプルを冷凍して輸送することなく現地（琉球大学）で処理することにより、共生微生物と分取と高分子・高品質のメタゲノムDNAを取得することに成功している。本年度は、 2 種の海綿より得られた共生微生物メタゲノム DNA を、次世代シーケンサーに供し、シーケンス解析を行った。この際にPacBioを用いたロングリード配列情報と、Novaseqを用いたショートリード配列情報の両方のシーケンス解析を行い、２種のシーケンスデータのハイブリッドアセンブリを行うことを試みた。まず、複数のアセンブリプログラムを試行し、最も結果が良かったプログラムを選択した。次に、本プログラムのアセンブリ条件について最適なパラメーター調整を行った。その結果、複雑なメタゲノム配列中からの高品質のコンティグの取得に成功した。

Marine organisms are difficult to cultivate because of their sponge, unusual structure, and physiological activity. This research topic is to identify microorganisms that are difficult to cultivate and produce, candidate compounds for medical products, target compounds, bioactive substances produced from marine animals, and explain the mechanisms of biosynthesis. The symbiotic relationship between sponges and bioactive compounds, and the stable supply of future compounds In the previous year, two kinds of sponge, Haliclona sp. and A. Ingests are collected from the sea, frozen and transported locally (University of the Ryukyus). This year, two kinds of sponges were collected and analyzed. In this case, PacBio uses the middle class configuration information, Novaseq uses the middle class configuration information, and the middle class configuration information and the middle class configuration information are analyzed. There are two kinds of middle class configuration information and the middle class configuration information. The results of the trial were excellent. Second, the original selection of the selection of the The results of the survey, the results of the survey, the results of the survey and the results of the survey were successful.