权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

デオキシリボザイムを用いた特定微生物の検出法の開発

使用脱氧核酶开发特定微生物的检测方法

基本信息

批准号：
17780070
负责人：
末永光
金额：
$ 2.11万
依托单位：
National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2005
项目状态：
已结题

项目摘要

廃水処理に広く用いられている活性汚泥法における問題のひとつに糸状性細菌の急激な増殖により引き起こされる汚泥沈降性の低下、すなわちバルキングがある。細菌の増殖活性は、細菌細胞中のrRNAの存在量と相関があることが知られている。従って、活性汚泥中において、糸状性細菌由来の16S rRNAの検出と定量は活性汚泥のバルキング傾向を評価するための重要な指標となりうる。そこで本研究において16S rRNAの配列特異的切断に基づいた迅速・簡便な定量法を考案した。すなわち、複数種の16S rRNA存在下において標的16S rRNAのみを特異的に切断し、その後、電気泳動により切断された16S rRNA断片と未切断片を分離し、それぞれのRNA断片の定量を行うことで全16S rRNAにおける標的16S rRNAの存在比が求められる。16S rRNAの配列特異的切断には、一本鎖のDNAから成り、任意のRNA配列を特異的に切断する機能を持つデオキシリボザイムを利用した。モデル実験より得られた結果を基に、活性汚泥に対し本手法の適用を行った。処理槽中の活性汚泥の一部を毎日一定時刻に抜き取り、RNAを抽出し、バルキングの起因菌であるSphaerotilus属の16S rRNAを、デオキシリボザイム法を用いて定量した。また、同属由来16S rDNAを定量的PCRによって測定し、比較解析を行った。標的16S rDNA存在量の挙動は概ねSVIの変化と一致し、Sphaerotilus属細菌の存在量と汚泥の沈降性の相関が示された。一方、16S rRNAはバルキングの早期発見のための有効な指標であることが示された。

The problems of activated sludge process in wastewater treatment include rapid growth of bacteria, low settling property of sludge, and poor quality of sludge. Bacterial proliferation activity, the presence of rRNA in bacterial cells, and correlation. The detection of 16S rRNA in activated sludge and its origin are important indicators for quantitative evaluation of activated sludge degradation tendency. In this study, a rapid and simple quantitative method was developed to detect the sequence-specific cleavage of 16S rRNA. In the presence of multiple species of 16S rRNA, the target 16S rRNA was isolated from the uncut fragments by electroporation, and the target 16S rRNA was quantified. 16S rRNA sequence-specific cleavage, DNA sequencing, arbitrary RNA sequence-specific cleavage, and function maintenance The application of activated sludge to the treatment of wastewater was investigated. Part of the activated sludge in the treatment tank is collected at a certain time every day, RNA extracted, and the causative bacteria of the genus Sphaerotilus are quantified by the method of extraction. PCR assay and comparative analysis of 16S rDNA The correlation between the amount of target 16S rDNA and sludge sedimentation was also studied. A square, 16S rRNA, and early detection indicators

项目成果

期刊论文数量（4）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Steady-state Kinetic Characterization of Evolved Biphenyl Dioxygenase, which Acquired Novel Degradation Ability for Benzene and Toluene

进化联苯二加氧酶的稳态动力学表征，该酶获得了苯和甲苯的新降解能力

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 70(4)
影响因子：
0
作者：
Hikaru Suenaga;Mike Sato;Masatoshi Goto;Mariko Taeshita
通讯作者：
Mariko Taeshita

Novel Approach to Quantitative Detection of Specific rRNA in a Microbial Community, Using Catalytic DNA.

使用催化 DNA 定量检测微生物群落中特定 rRNA 的新方法。

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
Applied and Environmental Microbiology 71
影响因子：
0
作者：
Hikaru Suenaga;Masatoshi Goto;Kensuke Eurukawa;Hikaru Suenaga et al.
通讯作者：
Hikaru Suenaga et al.

Measurement of growth activity of filamentous bacteria in activated sludge using catalytic DNA molecule.

使用催化 DNA 分子测量活性污泥中丝状细菌的生长活性。

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
Proceeding of the 4th IWA, Activated Sludge Population Dynamics Specialist Conference.
影响因子：
0
作者：
Hikaru Suenaga;Masatoshi Goto;Kensuke Eurukawa;Hikaru Suenaga et al.;Hikaru Suenaga et al.
通讯作者：
Hikaru Suenaga et al.