高速原子間力顕微鏡で解き明かすリボソームの機能ダイナミクス
使用高速原子力显微镜揭示核糖体的功能动力学
基本信息
- 批准号:20J00036
- 负责人:
- 金额:$ 3.08万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2020
- 资助国家:日本
- 起止时间:2020-04-24 至 2023-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
翻訳はリボソーム自身がダイナミックな構造変化を起こしながら様々な翻訳制御因子との結合と解離を繰り返すことで進行する動的な反応である。本研究では生体分子の形状と動きを同時観察できる高速原子間力顕微鏡(高速AFM)を用いて、翻訳反応におけるリボソームの機能ダイナミクスを捉えることを目標とし、(1)高速AFM観察のためのリボソーム試料の固定化方法の検討、(2)リボソームストークの機能ダイナミクス解明、(3)タンパク質合成反応の各ステップの可視化に取り組む。2021年度は主に課題(3)に取り組んだ。(3)タンパク質合成反応の各ステップの可視化: 当初の計画では翻訳伸長反応の可視化を試みる予定であったが観察に最適なリボソームの固定化条件を確立することができなかったため、一部計画を変更し、真正細菌のリボソームリサイクル反応、特にサブユニット解離反応の可視化に取り組んだ。まず、精製した大腸菌70Sリボソーム、リボソームリサイクル因子RRF、翻訳伸長因子EF-G、非加水分解GTPアナログGMP-PCPからなる70S pre-splitting複合体を試験管内で再構成後、アミノシラン処理したマイカ基板 (AP-マイカ) に固定し、高速AFMによる観察を行った。AP-マイカに固定されたpre-splitting複合体のZ方向のプロファイルをとると、おおよそ30~45 nmの高さを持っていたことから、pre-splitting複合体は複数の配向性を持ってAP-マイカに固定されることがわかった。リボソームの中央突起が明確に観察できた分子に関して、高速AFMの観察中に高濃度のGTPを含む緩衝液に交換したところ、GTP依存的に1~3回のトランスロケーション反応が生じ、それに続くサブユニット解離反応が観察された。
This is the combination of the control factor and the combination of the control factor and the control factor of the control factor in combination with the countermeasure of the anti-alienation operation. In this study, high-speed atomic force micrometer (high-speed AFM) was used to detect the shape of living molecules at the same time. (1) high-speed AFM was used to detect high-speed atomic force microscopes (high-speed atomic force microscopes). (2) high-speed atomic force microscopes (high-speed atomic force microscopes) were used. (3) the system is integrated into a system that can be customized. The main project (3) of the year 2021 was selected from the organization. (3) the synthesis and feasibility of each system: the original plan can be expanded to determine the conditions for the immobilization of the system. This is very important for you to remove the anti-alienation from the system. Strain 70s, strain 70s, strain RRF, elongation factor EF-G, non-hydrolyzed GTP, GMP-PCP complex, 70s pre-splitting complex were reconstructed in the tube, and the substrate (AP- substrate) was fixed, and the high-speed AFM was used to observe the temperature. The AP- complex is fixed in the Z direction, the pre-splitting copy is fixed in the Z direction, the pre-splitting copy is in the Z direction, the pre-splitting copy is fixed in the Z direction, the pre-splitting copy is fixed in the Z direction, the pre-splitting copy is fixed in the Z direction, the pre-splitting copy is fixed in the Z direction, the pre-splitting copy is fixed in the Z direction, the pre-splitting copy is fixed in the Z direction. The central protuberance clearly detects the molecular weight, the high degree of GTP in the high-speed AFM detection, the liquid communication in the high-speed GTP, the GTP-dependent response in 1, 3, and 3 times, the anti-virus, anti-interference, anti-interference and anti-interference.
项目成果
期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
高速原子間力顕微鏡で可視化されたリボソームと翻訳伸長因子の超分子集合体
通过高速原子力显微镜观察核糖体的超分子组装和平移延伸因子
- DOI:
- 发表时间:2020
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:今井 大達;内海 利男;古寺 哲幸
- 通讯作者:古寺 哲幸
高速原子間力顕微鏡解析から示唆されたミトコンドリアタンパク質搬入ゲートTOM複合体の不均等な三量体構造
高速原子力显微镜分析表明线粒体蛋白输入门TOM复合物的不均匀三聚体结构
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:九笹 加菜;今井 大達;古寺 哲幸;稲津 明広;遠藤 斗志也;荒磯 裕平
- 通讯作者:荒磯 裕平
Visualization of translational GTPase factor-pool formed around the archaeal ribosomal P-stalk by HS-AFM
通过 HS-AFM 观察古细菌核糖体 P 柄周围形成的翻译 GTP 酶因子池
- DOI:
- 发表时间:2020
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:今井 大達;内海 利男;古寺 哲幸
- 通讯作者:古寺 哲幸
HS-AFM visualizes translational GTPase factor pool formed around the ribosomal P-stalk
HS-AFM 可视化核糖体 P 柄周围形成的翻译 GTP 酶因子池
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:今井 大達;内海 利男;古寺 哲幸
- 通讯作者:古寺 哲幸
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
今井 大達其他文献
海洋産抗腫瘍性物質アプリロニンAと細胞骨格タンパク質
海洋抗肿瘤物质aprironin A和细胞骨架蛋白
- DOI:
- 发表时间:
2014 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
丸山 圭;今井 大達;三好 智博;伊東 孝祐;内海 利男;木越英夫 - 通讯作者:
木越英夫
高速原子間力顕微鏡解析によって明らかになったミトコンドリアタンパク質搬入ゲートTOM複合体の構造とダイナミクス
高速原子力显微镜分析揭示线粒体蛋白输入门 TOM 复合物的结构和动力学
- DOI:
- 发表时间:
2022 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
九笹 加菜;小林 菜々子;今井 大達;槙野 愛実;稲津 明広;古寺 哲幸;遠藤 斗志也;荒磯 裕平 - 通讯作者:
荒磯 裕平
高速原子間力顕微鏡を用いたミトコンドリアタンパク質搬入ゲートTOM複合体の動的構造解析
使用高速原子力显微镜对线粒体蛋白输入门 TOM 复合物进行动态结构分析
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
九笹 加菜;今井 大達;古寺 哲幸;稲津 明広;遠藤 斗志也;荒磯 裕平 - 通讯作者:
荒磯 裕平
Recruitment of translation factors by the tentacles of ribosomes
核糖体触手招募翻译因子
- DOI:
10.14952/seikagaku.2022.940739 - 发表时间:
2022 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Imai Hirotatsu;Utsumi Daisuke;Torihara Hidetsugu;Takahashi Kenzo;Kuroyanagi Hidehito;Yamashita Akio;今井 大達 - 通讯作者:
今井 大達
国際協力の現場におけるリスク管理:サプライチェーンマネジメントから学ぶ国際協力の現場におけるリスク管理:サプライチェーンマネジメントから学ぶ
国际合作领域的风险管理:向供应链管理学习风险管理在国际合作领域:向供应链管理学习
- DOI:
- 发表时间:
2016 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
今井 大達;阿部 高也;三好 智博;伊東 孝祐;内海 利男;佐藤寛 - 通讯作者:
佐藤寛
今井 大達的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('今井 大達', 18)}}的其他基金
統合的ストレス応答がリボソームを不活化する分子機構の解明
阐明整合应激反应使核糖体失活的分子机制
- 批准号:
24K18056 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
リボソームストークをハブとする翻訳関連因子プールの機能動態解明
以核糖体茎为中心阐明一系列翻译相关因子的功能动力学
- 批准号:
21K15015 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
翻訳伸長段階におけるリボソームストークタンパク質複合体の分子動態解析
翻译延伸阶段核糖体茎蛋白复合物的分子动力学分析
- 批准号:
16J01001 - 财政年份:2016
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
相似海外基金
剪断流中における糖鎖高分子動態の解明に向けた流動制御高速AFMの開発
开发流量控制的高速 AFM,用于阐明剪切流中聚糖聚合物的动力学
- 批准号:
24K17723 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
局在化AFM法と温度制御型高速AFMを用いたウイルスゲノムリリース機構の解明
使用局部 AFM 方法和温控高速 AFM 阐明病毒基因组释放机制
- 批准号:
24K08213 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
次世代型高速AFMの実現とそのバイオ応用研究
下一代高速AFM的实现及其生物应用研究
- 批准号:
24H00402 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
高速AFMで明らかにする一分子局所力学物性のダイナミクスと機能相関
高速 AFM 揭示单分子局部机械性能的动力学和功能相关性
- 批准号:
24K01309 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
生体分子機能メカニズムを解明する増強ラマン/高速AFMマルチモーダル計測技術の開発
开发增强型拉曼/高速 AFM 多模态测量技术以阐明生物分子功能机制
- 批准号:
24K01385 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
コムロック型超高速AFM可視化技術の創出と触媒反応過程の可視化
开创Comlock型超高速AFM可视化技术及催化反应过程可视化
- 批准号:
22H00289 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
毎秒100フレーム取得可能な高速AFMの開発と実証応用研究
每秒100帧采集的高速AFM开发及示范应用研究
- 批准号:
22H00405 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
Significance and Mechanisms of Phase Separation Mediated by Cancer-Driving Fusion Oncoprotein EML4-ALK as Revealed by High-Speed AFM
高速 AFM 揭示癌症驱动融合癌蛋白 EML4-ALK 介导的相分离的意义和机制
- 批准号:
22K07208 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
High-Speed-AFM Analysis of Structural and Mechanical Properties of Single Protein under Mechanical Stimulation
机械刺激下单一蛋白质的结构和机械特性的高速 AFM 分析
- 批准号:
21H01772 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
高速AFM/光ピンセット複合機を用いたSMCの液-液相分離の形成・破壊機構の解明
使用高速AFM/光镊组合装置阐明SMC中液-液相分离的形成和破坏机制
- 批准号:
21K04849 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)