Developments and Applications of free energy calculations with quantum chemical effects of solvation
Developments and Applications of free energy calculations with quantum chemical effects of solvation
批准号:
20K03885
负责人:
渡邉 宙志
金额:
$2.83万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-01 至 2024-03-31
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これまでの研究で、QM/MM法において溶液中のプロトン移動のダイナミクスの取り扱いを可能にするフレームワークを構築した。これをもとにしたベンチマーク計算において、プロトンが時間的に間をおいて順々に水分子の間をジャンプしていくのは、比較的安定して取り扱うことができることが確認された。一方、一列に並んだ水分子間でほぼ同時にプロトン移動が起こるような状況(例えば水チャネルタンパク質中など)では、計算が不安定になることが判明した。これを防ぐ一つの方法としては量子的な取り扱いをするQM領域のサイズを拡張することあるいは高速化することであるが、現在の計算機において計算コストの問題から現実的ではない。そこで本年度はQM領域に適用する計算方法に量子コンピュータを用いる枠組みを検討した。量子コンピュータ上で量子計算を実行するアルゴリズムは二つに大別されるが、今回は現在のノイズの大きいデバイス上で実行可能な変分量子固有値法を対象とした。ただしこの方法は、ハミルトニアンの期待値をコストと見立てて最適化を行うことで、対象系の基底状態を求める方法である。量子ビット数が大きくなると最適化が進行しないなどの欠点があることが知られており、この問題を回避するには適切な量子回路設計が重要となる。そのために我々は回路構造最適化法に着目した。これはコスト関数の最適化の最中に回路構造も同時に変化(最適化)させるものである。ただし従来の方法では、この最適化は単一量子ビットゲートに関して3つの回転軸をXYZの中から不連続に選択するものであった。我々は従来法を拡張/改善し連続的に単一量子ビットを連続的に、すなわち複数の自由度を同時にそして解析的に最適化する方法を提案した。これにより比較的に浅いに高い表現能力を持たせることが可能となり、効率的に最適化つまりハミルトニアンの基底状態を算出することが可能になった。
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回転軸選択法による量子回路最適化
使用旋转轴选择方法的量子电路优化
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[渡邉宙志, Rudy Raymond, 大西裕也, 上西慧理子, 菅原道彦]
通讯作者:
菅原道彦
Dynamics Simulation of Solution System Based on Quantum/Classical Hybrid Model―Toward Incorporation of Quantum Chemical Effect of Solvation
基于量子/经典混合模型的溶液系统动力学模拟——考虑溶剂化的量子化学效应
DOI:
10.11316/butsuri.76.2_81
发表时间:
2021
期刊:
Butsuri
影响因子:
--
作者:
[Marcel Holtmann, Peter Krüger, Koji Miyamoto, Taichi Okuda, Pascal J. Grenz, Shiv Kumar, Kenya Shimada, and Markus Donath, 渡邉 宙志]
通讯作者:
渡邉 宙志
Proton transfer in bulk water using the full adaptive QM/MM method: integration of solute- and solvent-adaptive approaches
使用完全自适应 QM/MM 方法在散装水中进行质子转移:溶质和溶剂自适应方法的集成
DOI:
10.1039/d1cp00116g
发表时间:
2021
期刊:
Physical Chemistry Chemical Physics
影响因子:
3.3
作者:
[Hiroshi C. Watanabe, Masayuki Yamada, Yohichi Suzuki]
通讯作者:
Yohichi Suzuki
Sequential Quantum Optimizer of Parameterized Quantum Circuits for Generalized Eigenvalue Problems
广义特征值问题的参数化量子电路的顺序量子优化器
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[佐藤 勇気, 渡邉 宙志, Raymond Rudy, 近藤 瑠歩, 和田 凱渡, 遠藤 克浩, 菅原 道彦, 山本 直樹]
通讯作者:
山本 直樹
Proton transfer in bulk water using the full adaptive QM/MM method
使用完全自适应 QM/MM 方法在散装水中进行质子转移
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[MIYASHITA Akira, MUKAI Kiyofumi, OHSHIMA Shinsuke, MATOIKE Ryota, PETERSON Byron J., KOBAYASHI Shinji, OKADA Hiroyuki, KADO Shinichiro, MINAMI Takashi, MIZUUCHI Tohru, KONOSHIMA Shigeru, NAGASAKI Kazunobu, 福山 隆雄,末吉 悠太郎,西田 直輝, Hiroshi C. Watanabe]
通讯作者:
Hiroshi C. Watanabe
共 19 条
Developments of variational quantum algorithms based on circuit structure optimization
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批准号:23K03266
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2023
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负责人:渡邉 宙志
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依托单位:
計算機シミュレーションによるチャネルロドプシンの構造と機能の解析
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批准号:14J03041
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.75万
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财政年份:2014
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负责人:渡邉 宙志
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依托单位:
海外基金