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MIG-seq法を用いた三陸岩手サケの河川遡上集団と沿岸海域集団の遺伝特性分析

利用MIG-seq方法分析岩手三陆鲑鱼河流洄游种群和沿海海洋种群遗传特征

基本信息

批准号：
20K06177
负责人：
塚越英晴
金额：
$ 2.75万
依托单位：
Iwate University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K06177/
关键词：
サケ三陸資源遺伝特性遺伝的多様性 MIG-seq

项目摘要

本研究は三陸岩手の水産重要種であるシロザケ（サケ）の資源（種卵）管理単位の把握や沿岸海域で漁獲されている資源の特徴を明らかにすることを目的として，当該地域の河川に回帰した個体や沿岸海域で漁獲された個体を対象にゲノムワイドにSNPを捉えることのできるMIG-seq法を用いて遺伝特性分析を実施するものである．本年度では前年度に続き岩手県の河川に遡上した集団を対象に分析を実施した．津軽石川と盛川の遡上時期の異なる前期群と後期群，甲子川の後期群，および北上川水系支流砂鉄川の計6集団(1集団あたり48個体)について，最適化した実験方法によりSNP情報を取得した．前年度に分析した集団に上記した集団を加えて，予備的に以下の解析を行った．全集団から得られたSNPのうち，全個体の9割で共通してみられかつ個体間で変異のある1,619 座位を解析に供した．そのSNP情報に基づきDAPC分析を行った結果，沿岸前期群，沿岸後期群，および北上川水系に属する集団ごとにまとまりがみられた．沿岸前期群および北上川水系に属する集団では集団間でも分化していることが推測された．一方で，沿岸後期群に属する集団間では明瞭な違いはみられず，各々似かよった遺伝特性を有することが示唆された．一部の河川遡上集団および沿岸海域集団を対象とした遺伝特性分析の進捗状況に大きな遅れがみられていることから，それらの集団について早急に分析を進める．

In this study, there is an important information on the management of resources (eggs) in the coastal waters. When the river in that area returns to the coastal area, the sea area is divided into two parts: the sea area, the coastal area, the coastal area, the The pre-and late-stage groups of the time cycle. In the later period of Jiazichuan Group, 6 episodes (1 collection 48 bodies) of the tributaries of the north Shangchuan water system were collected in 6 episodes, and the most efficient method was to obtain the information of the SNP. The previous year's analysis was completed on the basis of the analysis of the previous year, and the following analysis was given. The results of SNP analysis, coastal antecedent group, coastal antecedent group. The north Shangchuan water system is located in the coastal area. In the early coastal period, the north Shangchuan water system is divided into two groups. On the one hand, the coastal post-cluster group is known to be in the middle of the cluster. There are signs of instigation in each of the characteristics. An analysis of the characteristics of the coastal area in the upper part of the river is very important, and the analysis is very important.