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Genomic origin of chemodiversity in medicinal plants

Genomic origin of chemodiversity in medicinal plants
药用植物化学多样性的基因组起源
批准号:
19H05652
负责人:
齊藤 和季
金额:
$128.63万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
财政年份:
2019
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2019-06-26 至 2024-03-31

项目摘要

项目成果

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本研究は、今後医薬学や医療分野において重要性が増加する薬用資源植物の統合ゲノム科学を推進することを目的とする。特に、漢方処方において重要生薬である「甘草」とその他の薬用植物について薬用成分の生産に関する統合ゲノム科学を推進し、薬用資源植物の化学的多様性のゲノム起源解明に資する。すでに2016年にドラフトゲノム配列を発表した1系統(品種)のウラル甘草について、8本の染色体から構成される全長429メガ塩基対の染色体スケールでほぼ完全につながった高品質ゲノム解読に成功した。甘草ゲノムでは、かつて起こったゲノム重複の痕跡と考えられる染色体間でのシンテニーの存在が認められ、また、同じマメ科に属するタルウマゴヤシや大豆ともシンテニー関係が認められた。グリチルリチンや関連サポニン生合成に関わる酵素遺伝子のほぼ全体が二つの染色体にクラスターとして存在していることが確認された。また、別の薬効成分として知られるイソフラボノイド生合成に関連する遺伝子クラスターも同定された。以上の成果はDNA Research誌に発表した。さらに、ナス科タバコの主要アルカロイドであるニコチン生合成を制御する転写因子をゲノムレベルで解明し、当該遺伝子のゲノム編集によって超低ニコチン含量のタバコを作出した。本成果はPlant Journal誌に発表した。また、薬用植物等から広範なメタボローム情報を収集すると共に、薬用植物等における二次代謝成分の生合成遺伝子と酵素の機能推定も進めた。
期刊论文(26)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: --
发表时间: 2023
期刊:
影响因子: --
作者: [大川祐樹, 貫戸紀子, 中??三弥子, 藤縄玲子, 木塚康彦, 原田陽一郎, 田村純一, 谷口直之, Kazuki Saito]
通讯作者: Kazuki Saito
The Origin of Plant Chemodiversity - Conceptual and Empirical Insights
植物化学多样性的起源 - 概念和经验见解
DOI: --
发表时间: 2020
期刊:
影响因子: --
作者: [海寶 大輔, 鈴木 秀海, 松本 寛樹, 豊田 行英, 稲毛 輝長, 田中 教久, 坂入 祐一, 中島 崇裕, 木内 政宏, 本橋 新一郎, 中山 俊憲, 吉野 一郎, 永森收志, Kazuki Saito, Kazuki Saito]
通讯作者: Kazuki Saito
DOI: --
发表时间: 2020
期刊:
影响因子: --
作者: [Amit Rai , Yohei Shimizu , Hideki Hirakawa , Mami Yamazaki, Kazuki Saito]
通讯作者: Kazuki Saito
Metabolomics with 15N Labeling for Characterizing Missing Monoterpene Indole Alkaloids in Plants
使用 15N 标记的代谢组学来表征植物中缺失的单萜吲哚生物碱
DOI: 10.1021/acs.analchem.9b03860
发表时间: 2020
期刊: Analytical Chemistry
影响因子: 7.4
作者: [Nakabayashi Ryo, Mori Tetsuya, Takeda Noriko, Toyooka Kiminori, Sudo Hiroshi, Tsugawa Hiroshi, Saito Kazuki]
通讯作者: Saito Kazuki
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    国内産の重要薬用資源植物の統合ゲノム科学
    Functional genomics for the biosynthesis of highly-oxygenated steroidal compounds in plants
    海外基金