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核酸立体構造の選択的修飾による遺伝子調節技術の開発

通过选择性修饰核酸3D结构开发基因调控技术

基本信息

批准号：
19K05743
负责人：
寺正行
金额：
$ 2.75万
依托单位：
Tokyo University of Agriculture and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

グアニン豊富な核酸で形成されるグアニン四重鎖 (G-quadruplex: G4) は、ゲノムワイドに存在し、特にテロメア配列や遺伝子プロモーター領域などで多く発見されている)。生体内では、G4が「動的に形成される」ことで複製タイミングの調節や遺伝子の発現制御等、様々な生物機能に関与するが、過渡的に形成されることから、詳細な調節メカニズムは未解明である。G4は塩基配列に応じて多様な構造を形成しており、これらは「トポロジー」と呼ばれる三種の基本構造 (パラレル、ハイブリッド、アンチパラレル) に分類できる。近年、このトポロジーの違いがG4由来の生物機能に影響することが示唆されており、低分子化合物 (G4リガンド) 等でトポロジーを選択的に認識することが求められている。加えてG4リガンドを用いたG4との共有結合による修飾は、G4の動的平衡を不可逆的に固定化できるため、G4の安定化において有望な戦略である。過去20年に渡り、共有結合型G4リガンドが複数報告されているが、G4の各トポロジーを選択的に認識しG4と共有結合を形成するG4リガンドの報告は極めて少ない。G4は全てのG4に共通する構造である「G-quartet」と、G4の各トポロジーにより異なる構造の「Groove」とから成る。従って、G4リガンドがG4の各トポロジーを選択的に認識するためには、G-quartetとGrooveの二点を認識することが重要だと考えられる。これまでに、G-quartetとスタッキングによってG4を安定化するL2H2-6OTD (1) を報告している。そこで本年度は、二点認識を志向して、1の構造中にGrooveと相互作用することのできる、光架橋基を有するリンカーの導入により、特定のトポロジーのG4を選択的に認識し、かつG4と共有結合を形成することで当該構造を選択的に固定化する手法の開発を目的とした。

G-quadruplex (G4) is a four-fold lock formed by nucleic acid, which is required to exist in the field. In vivo, G4 is a "dynamic formation", a "replication", a "regulation", a "production control", a "biological function", a "transitional formation", a "detailed regulation", and an "unexplained". The G4 has three basic structures ( In recent years, the biological function of G4 has been affected by the violation of this principle, such as the recognition of low molecular weight compounds (G4). G4 and G4 share common binding, modification, G4 dynamic equilibrium, irreversible immobilization, G4 stabilization, and are expected to be slightly modified. In the past 20 years, the G4 has been recognized as a multi-channel, multi-channel, multi-channel G4 is a common structure of G4, and G4 is a different structure of G4. The G4 is the most important part of the G4. L2H2-6OTD (1) is a report on the G4 stabilization process. This year, two points of understanding are proposed: Groove interaction in 1 structure, introduction of optical bridging groups, recognition of G4 selection in specific groups, formation of G4 common bonds, and development of immobilization methods when selecting this structure.