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Varianzkomponentenbasierte Verfahren zur simultanen Kartierung gekoppelter QTL mit epistatischen Effekten und linienspezifischen Markern

基于方差成分的方法，用于同时定位具有上位效应和谱系特异性标记的连锁 QTL

基本信息

批准号：
35530980
负责人：
Privatdozent Dr. Manfred Mayer
金额：
--
依托单位：
Institut für Genetik und Biometrie
依托单位国家：
德国
项目类别：
Research Grants
财政年份：
2007
资助国家：
德国
起止时间：
2006-12-31 至 2010-12-31
项目状态：
已结题

来源：
https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/35530980?language=en
关键词：
Varianzkomponentenbasierte Verfahren zur simultanen Kartierung

项目摘要

Die multiple Intervallkartierung (multiple interval mapping) ist die Referenzmethode bei der Kartierung multipler QTL in experimentellen F2- oder Rückkreuzungspopulationen. Theoretische Ableitungen und Simulationsstudien haben gezeigt, dass rechentechnisch weniger aufwendige Methoden, wie z.B. regression interval mapping, insbesondere bei gekoppelten QTL und bei QTL in Repulsion problematisch in Bezug auf die Trennschärfe und die Genauigkeit der Schätzung von QTL-Parametern sein können. In der Humangenetik sowie bei Daten von Outcrosspopulationen in der Tierzucht sind varianzkomponentenbasierte Methoden relativ weit verbreitet und stellen einen sehr flexiblen und mächtigen methodischen Ansatz dar. In dem vorliegenden Forschungsantrag sollen daher die methodischen Voraussetzungen zur Anwendung varianzkomponentenbasierter Methoden für die QTL-Analyse bei linienspezifischen Markern in den Ausgangspopulationen erarbeitet werden. Dabei soll ein Schwerpunkt auch auf die Berücksichtigung nichtadditiver Geneffekte (Dominanz, vor allem aber auch Epistasie) gelegt werden. Die Problematik des eventuellen Vorhandenseins nichtfixierter und möglicherweise multipler QTL-Allele in den Ausgangspopulationen soll durch die Entwicklung eines methodischen Instrumentariums für Founder-QTL-Modelle angegangen werden. Die Eigenschaften des entwickelten Instrumentariums werden ergänzend durch Simulationsuntersuchungen geprüft und verglichen.

用多重区间作图法对Rück kreuzungspopolationen的F_2代进行了多个参考方法的选择。[中英文摘要]理论[1][1][1][1][2][2][1][2][2][1][1][2][1][2][1][1][1][2][1][2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]，[2]]，[2]，[5]，[2]，[2]]，[5]，[5]，[5]，[2]]。在人类社会中，不同的方法论是不同的，它们是相对的，灵活的，灵活的。在DEM vvliegenden Forschungsantrag Sollen Daher die way dischen en Vorossetzungen zur anwendung arianzkomententenbasiter Methoden für die die QTL-analyn by linienSpezifischen Markern in den Ausangspopulationen erarbeitet.他说：“这是一项非常重要的工作。”在澳大利亚的环境中存在的问题是QTL-等位基因和多个QTL-等位基因。这些仪器的特征是在模拟过程中发生的，例如Geprüft和Verglichen。