Segregations- und Kopplungsanalysen bei komplexen genetischen Modellen und Familienstrukturen

复杂遗传模型和家族结构中的分离和连锁分析

基本信息

项目摘要

In dem vorliegenden Projekt soll ein methodisches Instrumentarium entwickelt werden mit dem Ziel simultan multiple QTL (quantitative trait loci) unter Verwendung von Markerdaten zu identifizieren und die entsprechenden Effekte zu quantifizieren. Dieses Instrumentarium soll auch zur Analyse komplexer Pedigreedaten, wie sie bedingt durch die tierzüchterische Selektion bei landwirtschaftlichen Nutztieren die Regel sind, verwendet werden können und damit einen Beitrag zu zuverlässigeren Aussagen über den Vererbungsmodus eines Merkmals leisten. Die genetische Komponente bei der Merkmalausprägung wird dazu als eine generelle lineare Funktion von additiven, dominanten sowie epistatischen Effekten der unbekannten QTL-Genotypen modelliert. Dieser Ansatz wird im Vergleich mit den heute üblichen Ansätzen, welche auf dem genetischen Mischmodell bzw. auf endlich polygenen Modellen (welche biallele Loci mit gleichen und additiven Effekten unterstellen) beruhen, als wesentlich wirklichkeitsnäher betrachtet. Dabei müssen allerdings eine ganze Reihe von biometrischen Problemen, die z.B. mit der rechentechnischen Komplexität, der mögichen Überparametrisierung des Modells usw. zusammenhängen, gelöst werden. Die Entwicklung entsprechender Lösungsansätze und Rechenalgorithmen erscheint aber durch die Verwendung von Markovketten Monte Carlo-Techniken (Gibbs sampler, Metropolis Algorithmus) möglich zu sein.
在该项目中,我们采用了一种方法,即在标记数据上同时检测多个QTL(数量性状基因座),然后用仪器进行韦尔登。这种仪器也可以用来分析复杂的谱系,就像她通过土地管理局的第三次选择来确定规则一样,韦尔登可以理解并减少一个用于建立一个商业模式的机构。在Merkmalausprägung上的遗传组分具有一个加性的一般线性函数,主要表现为不确定的QTL基因型模型的上位性效应。这位老人将与今天的老人在一起,在遗传学上也是如此。在多基因模型(包括双等位基因位点的遗传和附加效应)中,我们可以得到更好的结果。我们必须解决一系列生物统计学问题。mit der rechentechnischen Komplexität,der mögichen Überparametrisierung des Models usw. zusammenhängen,gelöst韦尔登.该Entwicklung entsprechender Lösungsätze und Rechenalgorithmen erscheint aber durch die Verwendung von Markovketten Monte Carlo-Techniken(Gibbs sampler,大都会采样器)möglich zu sein.

项目成果

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