Genetic control of long term storage in melons

瓜类长期贮藏的基因控制

基本信息

批准号：
19H02948
负责人：
牛島幸一郎
金额：
$ 10.98万
依托单位：
Okayama University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

メロンは一般に急激な呼吸量の増加とともにエチレンの生成と果実軟化を示すクライマクテリック型果実であるが，実際にはエチレンを感受しないノンクライマクテリック型果実や，エチレン合成量が少ない，軟化速度が遅いなど，様々な成熟様相を示す品種が存在する.メロン品種のハネデュとB2は共に棚持ち性の良い品種であるが，前者はエチレン生合成，後者は果肉軟化に変異が生じている.R4年度はハネデュの棚持ち性に関する研究を中心に解析を行った．GWAS解析からハネデュのエチレン生合成不全は８番染色体の20Mbp付近（ET8）に原因遺伝子が存在することを示してきた．しかし，SNP多型との相関が低かったり，ET6周辺にはエチレン合成に関連が予測される遺伝子が存在しないなどの問題もあるので，F2集団を再度作成し再試を行うことにした．また，当初はSNP genotypingにGras-diを利用していたがコストを考慮して，より効率的なdpMIG-seqの利用も合わせて検討した．R4年度のF2集団でエチレン合成については，健全個体と不全個体が前回と同様に3:1に分離しており，やはりハネデュのエチレン合成不全は１遺伝子座に支配されていると考えられた．また，dpMIG-seqについては，まずは以前の集団を利用して解析を行ったところ同等の結果が得られており，gras-diの代替になる手法であると考えられた．R4年度の集団でもdpMIG-seqを利用してSNP genotypingを行いGWAS解析を行ったところ，エチレン合成不全についてはやはりET8付近に相関のあるSNPが検出された．また，前回の集団のデータも合わせて解析を行ったところ，より相関が高くなっておりやはりこの領域がエチレン合成において重要である可能性が高いと考えられた．

瓜通常是高潮的杂种水果，表现出乙烯产生和果实的软化，呼吸量突然增加，但实际上，有非高潮的陶器水果对乙烯敏感不敏感，以及表现出各种成熟的品种，例如低乙烯合成和缓慢的软化速率。瓜品种（Hanedue和B2）都是具有良好架子持有特性的品种，但前者具有乙烯生物合成的突变，后者的肉体变软。在R4中，我们主要分析了对Hanedue的货架持续特性的研究。 GWAS分析表明，病原体基因存在于乙烯生物合成不足的20 Mbp（ET8）约为20 Mbp（ET8）。但是，存在一些问题，例如与SNP多态性的低相关性以及与ET6周围乙烯合成有关的基因的缺失，因此我们决定再次创建F2种群并重试。此外，GRAS-DI最初用于SNP基因分型，但是考虑到成本，我们还考虑使用dpmig-seq，这更有效。关于R4中F2种群中的乙烯合成，健康个体和个体不足在3：1（如上一篇文章）分离，并且人们认为Hanedue的乙烯合成失败是由一个基因座控制的。此外，当我们首次使用先前的人群进行分析时，我们获得了可比的结果，并且被认为是GRAS-DI的替代方法。在R4群体中，使用DPMIG-SEQ进行SNP基因分型进行GWAS分析，对于乙烯合成失败，在ET8周围检测到具有相关性的SNP。此外，当我们分析了先前人群的数据时，相关性较高，人们认为该区域在乙烯合成中可能很重要。

项目成果

期刊论文数量（3）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

メロン軟化遅延系統の遺伝的制御とトランスクリプトーム解析

甜瓜软化延迟系遗传调控及转录组分析

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
小林和真・合田駿平・池田和生・赤木剛士・久保康隆・中野龍平・牛島幸一郎;田駿平，池田和生，小林和真，赤木剛士，加藤鎌司，久保康孝，中野龍平，牛島幸一郎
通讯作者：
田駿平，池田和生，小林和真，赤木剛士，加藤鎌司，久保康孝，中野龍平，牛島幸一郎

The Genetic Control of Long Shelf Life in Melon (Cucumis melo L.)

甜瓜（Cucumis melo L.）长保质期的遗传控制

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
Shumpei Goda;Toshiki Hatanaka;Takashi Akagi;Yasutaka Kubo;Ryohei Nakano and Koichiro Ushijima
通讯作者：
Ryohei Nakano and Koichiro Ushijima

メロンの成熟エチレン合成に関わる遺伝子座の同定とトランスクリプトーム解析

甜瓜成熟乙烯合成基因座的鉴定和转录组分析