Genetic control of long term storage in melons

瓜类长期贮藏的基因控制

• 批准号: 19H02948
• 负责人: 牛島 幸一郎
• 金额: $ 10.98万
• 依托单位: Okayama University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19H02948/
• 关键词: エチレン合成; メロン; 果実成熟; エチレン; 果肉軟化; GWAS; 成熟; 果実; エチレン生合成; 果実軟化; 棚持ち性

メロンは一般に急激な呼吸量の増加とともにエチレンの生成と果実軟化を示すクライマクテリック型果実であるが，実際にはエチレンを感受しないノンクライマクテリック型果実や，エチレン合成量が少ない，軟化速度が遅いなど，様々な成熟様相を示す品種が存在する.メロン品種のハネデュとB2は共に棚持ち性の良い品種であるが，前者はエチレン生合成，後者は果肉軟化に変異が生じている.R4年度はハネデュの棚持ち性に関する研究を中心に解析を行った．GWAS解析からハネデュのエチレン生合成不全は８番染色体の20Mbp付近（ET8）に原因遺伝子が存在することを示してきた．しかし，SNP多型との相関が低かったり，ET6周辺にはエチレン合成に関連が予測される遺伝子が存在しないなどの問題もあるので，F2集団を再度作成し再試を行うことにした．また，当初はSNP genotypingにGras-diを利用していたがコストを考慮して，より効率的なdpMIG-seqの利用も合わせて検討した．R4年度のF2集団でエチレン合成については，健全個体と不全個体が前回と同様に3:1に分離しており，やはりハネデュのエチレン合成不全は１遺伝子座に支配されていると考えられた．また，dpMIG-seqについては，まずは以前の集団を利用して解析を行ったところ同等の結果が得られており，gras-diの代替になる手法であると考えられた．R4年度の集団でもdpMIG-seqを利用してSNP genotypingを行いGWAS解析を行ったところ，エチレン合成不全についてはやはりET8付近に相関のあるSNPが検出された．また，前回の集団のデータも合わせて解析を行ったところ，より相関が高くなっておりやはりこの領域がエチレン合成において重要である可能性が高いと考えられた．

メ ロ ン は general に nasty shock な breathing in の raised add と と も に エ チ レ ン の generated と fruit be soften を shown す ク ラ イ マ ク テ リ ッ ク type fruit be で あ る が, be interstate に は エ チ レ ン を feel し な い ノ ン ク ラ イ マ ク テ リ ッ ク type fruit be や, エ チ レ ン synthetic fewer が な い, softening speed が 遅 い な ど, Others 々 を な others in mature phase in す varieties exist が す る. メ ロ ン varieties の ハ ネ デ ュ と B2 は に shed a total ち varieties of good sex の い で あ る が, the former は エ チ レ ン biosynthesis, the latter は flesh softening に - born different が じ て い る. R4 annual は ハ ネ デ ュ の shed a ち sex に masato す を る research center line analytical を に っ た. GWAS parsing か ら ハ ネ デ ュ の エ チ レ ン biosynthesis insufficiency は 8-fold chromosome の MBP pay nearly 20 (ET8) cause of に survived 伝 が exist す る こ と を shown し て き た. し か し, SNP polymorphism と の phase masato が low か っ た り, ET6 weeks 辺 に は エ チ レ ン synthetic に masato even が be さ れ る posthumous son 伝 が exist し な い な ど の problem も あ る の で, F2 set 団 を again made し line try を う こ と に し た. ま た, は SNP genotyping に Gras - di を using し て い た が コ ス ト を consider し て, よ り sharper rate な dpMIG - seq の using も close わ せ て beg し 検 た. R4 annual の F2 set 団 で エ チ レ ン synthetic に つ い て は, individual sound と insufficiency before が と back with others に 3:1 に separation し て お り, や は り ハ ネ デ ュ の エ チ レ ン synthetic insufficiency は 1 heritage 伝 stroma に dominate さ れ て い る と exam え ら れ た. ま た dpMIG - seq に つ い て は, ま ず は の set before 団 を using し analytical line を っ て た と こ ろ equally the result of の が ら れ て お り, gras - di の instead of に な る gimmick で あ る と exam え ら れ た. R4 annual の set 団 で も dpMIG - seq を using し て SNP genotyping を line analytical を い GWAS っ た と こ ろ, エ チ レ ン synthetic insufficiency に つ い て は や は り ET8 paying nearly に phase masato の あ る SNP が 検 out さ れ た. の set back by ま た, 団 の デ ー タ も close わ せ analytical line を っ て た と こ ろ, よ り phase masato が high く な っ て お り や は り こ の field が エ チ レ ン synthetic に お い て important で あ likely が る い と exam え ら れ た.

项目成果

メロン軟化遅延系統の遺伝的制御とトランスクリプトーム解析

甜瓜软化延迟系遗传调控及转录组分析

• 发表时间: 2021
• 作者: 小林和真・合田駿平・池田和生・赤木剛士・ 久保康隆・中野龍平・牛島幸一郎;田駿平，池田和生，小林和真，赤木剛士，加藤鎌司，久保康孝，中野龍平，牛島幸一郎
• 通讯作者: 田駿平，池田和生，小林和真，赤木剛士，加藤鎌司，久保康孝，中野龍平，牛島幸一郎

The Genetic Control of Long Shelf Life in Melon (Cucumis melo L.)

甜瓜（Cucumis melo L.）长保质期的遗传控制

• 发表时间: 2020
• 作者: Shumpei Goda;Toshiki Hatanaka;Takashi Akagi;Yasutaka Kubo;Ryohei Nakano and Koichiro Ushijima
• 通讯作者: Ryohei Nakano and Koichiro Ushijima

メロンの成熟エチレン合成に関わる遺伝子座の同定とトランスクリプトーム解析

甜瓜成熟乙烯合成基因座的鉴定和转录组分析

• 发表时间: 2021
• 作者: 小林和真・合田駿平・池田和生・赤木剛士・ 久保康隆・中野龍平・牛島幸一郎