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Genetic control of long term storage in melons

瓜类长期贮藏的基因控制

基本信息

批准号：
19H02948
负责人：
牛島幸一郎
金额：
$ 10.98万
依托单位：
Okayama University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

メロンは一般に急激な呼吸量の増加とともにエチレンの生成と果実軟化を示すクライマクテリック型果実であるが，実際にはエチレンを感受しないノンクライマクテリック型果実や，エチレン合成量が少ない，軟化速度が遅いなど，様々な成熟様相を示す品種が存在する.メロン品種のハネデュとB2は共に棚持ち性の良い品種であるが，前者はエチレン生合成，後者は果肉軟化に変異が生じている.R4年度はハネデュの棚持ち性に関する研究を中心に解析を行った．GWAS解析からハネデュのエチレン生合成不全は８番染色体の20Mbp付近（ET8）に原因遺伝子が存在することを示してきた．しかし，SNP多型との相関が低かったり，ET6周辺にはエチレン合成に関連が予測される遺伝子が存在しないなどの問題もあるので，F2集団を再度作成し再試を行うことにした．また，当初はSNP genotypingにGras-diを利用していたがコストを考慮して，より効率的なdpMIG-seqの利用も合わせて検討した．R4年度のF2集団でエチレン合成については，健全個体と不全個体が前回と同様に3:1に分離しており，やはりハネデュのエチレン合成不全は１遺伝子座に支配されていると考えられた．また，dpMIG-seqについては，まずは以前の集団を利用して解析を行ったところ同等の結果が得られており，gras-diの代替になる手法であると考えられた．R4年度の集団でもdpMIG-seqを利用してSNP genotypingを行いGWAS解析を行ったところ，エチレン合成不全についてはやはりET8付近に相関のあるSNPが検出された．また，前回の集団のデータも合わせて解析を行ったところ，より相関が高くなっておりやはりこの領域がエチレン合成において重要である可能性が高いと考えられた．

Normal and rapid breathing volume increase The fruit is softened and softened, and the fruit is softened and softened.実记にはエチレンを Feeling しないノンクライマクテリック type The amount of エチレン synthesis is small, the softening speed is が遅いなど, 様々なripe 様phase をshows the existence of the variety する.メロン varieties のハネデュとB2はKO shed holding ち性のgood い varieties であるが, the former はエチレThe latter is a raw material that softens the flesh and softens the pulp. GWAS analysis of the reason for the existence of the 20Mbp near 20Mbp chromosome of the 8th chromosome (ET8) due to incomplete biosynthetic synthesis and the existence of the missing child.しかし, SNP polytype and とのcorrelation がlow かったり, ET6 week 辺にはエチレン synthesis にassociated されThere is a problem with the existence of る伝子がしないなどのもあるので, and the F2 episode volume is made again and I try again and again. At first, the SNP genotyping was used in Gras-diを and the efficiency of dpMIG-seq was considered. The F2 episode of R4 of the year is a combination of a perfect individual and an incomplete individual. 3:1 minutes From the しており, やはりハネデュのエチレンsynthetic incomplete は1 伝子杫 dominated されていると考えられた.また，dpMIG-seqについては，まずは前の集団をutilizationしてanalyticを行ったところEqual result が got られており, gras-di の instead of になる technique であるとtest えられた． R4 annual collection of dpMIG-seq using SNP Genotypingを行いGWAS analysisを行ったところ,エチレンsynthetic incomplete についてはやはりET8 pay close to にrelated のあるSNPが検出された．また, the previous chapter of the episode 団のデータも合わせてanalyticsを行ったところ,よりrelatedが高くなっておりやはりこの区がエチレン SynthesisにおいてImportantであるPossibilityが高いとtestえられた．

项目成果

期刊论文数量（3）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

メロン軟化遅延系統の遺伝的制御とトランスクリプトーム解析

甜瓜软化延迟系遗传调控及转录组分析

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
小林和真・合田駿平・池田和生・赤木剛士・久保康隆・中野龍平・牛島幸一郎;田駿平，池田和生，小林和真，赤木剛士，加藤鎌司，久保康孝，中野龍平，牛島幸一郎
通讯作者：
田駿平，池田和生，小林和真，赤木剛士，加藤鎌司，久保康孝，中野龍平，牛島幸一郎

The Genetic Control of Long Shelf Life in Melon (Cucumis melo L.)

甜瓜（Cucumis melo L.）长保质期的遗传控制

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
Shumpei Goda;Toshiki Hatanaka;Takashi Akagi;Yasutaka Kubo;Ryohei Nakano and Koichiro Ushijima
通讯作者：
Ryohei Nakano and Koichiro Ushijima

メロンの成熟エチレン合成に関わる遺伝子座の同定とトランスクリプトーム解析

甜瓜成熟乙烯合成基因座的鉴定和转录组分析