Development of effective method selectively detecting y and b ions in the LC-MS/MS

开发在 LC-MS/MS 中选择性检测 y 和 b 离子的有效方法

基本信息

  • 批准号:
    24658104
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.25万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
  • 财政年份:
    2012
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2012-04-01 至 2014-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

In the LC-MSMS spectral analysis, assigning C-terminus y- and N-terminus b-ions are important to sequence the peptides. However, these have been based on empirical. In this study, the reporter established a method to theoretically distinguish N-terminus b-ions and C-terminus y-ions by introducing mass difference in at N- or C-terminus with derivatizations. The reporter also developed software named "MSMS Search Tool" which automatically selects y-ions and b-ions using raw mass data (ASCII format).
在LC-MSMS光谱分析中,分配C-末端y-和N-末端b-离子对于肽的测序是重要的。然而,这些都是基于经验的。在这项研究中,报告者建立了一种方法,理论上区分N-末端b-离子和C-末端y-离子,通过引入质量差异在N-或C-末端的衍生化。报告者还开发了名为“MSMS搜索工具”的软件,该软件使用原始质量数据(ASCII格式)自动选择y离子和b离子。

项目成果

期刊论文数量(65)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
セルラーゼ反応遷移状態構造を組み込んだ分子プローブの開発
结合纤维素酶反应过渡态结构的分子探针的开发
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Masaru Hashimoto;Akane Hirose;Takanori Murakami;橋本勝・竹川大登・田中和明・福士江里・松尾光一・根平達夫;広瀬あかね・村上貴宣・橋本勝;六車美沙・本間美保・橋本勝;村井嘉晃・高橋萌子・坂元君年・橋本勝;橋本勝;橋本勝;池田達也,田邊直也,橋本勝;久守未央奈,大場雄貴,橋本勝
  • 通讯作者:
    久守未央奈,大場雄貴,橋本勝
Lambertellin System, the mechanism for fungal replacement of Moniliniafructigena with Lambertellacorni-maris without competitive inhibition on ager media.
Lambertellin 系统,用 Lambertellacorni-maris 真菌替代 Moniliniafructigena 的机制,对老化介质没有竞争性抑制。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Hirose;A.; Kudo;S.; Murakami;T.; Tanaka;K.; Harada;K.; Hashimoto;M.
  • 通讯作者:
    M.
Neomacropgorin I, II,および IIIの構造決定
新巨菌素 I、II 和 III 的结构测定
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    S.Kanamaru;M.Honma;T.Murakami;T.Tsushima;S.Kudo;K.Tanaka;K.Nihei;T.Nehira;M.Hashimoto;橋本勝;橋本勝・廣瀬あかね・殿内暁夫・根平達夫
  • 通讯作者:
    橋本勝・廣瀬あかね・殿内暁夫・根平達夫
Neomacrophorin I, II, and III, novel drimenyl cyclohexanes with hydroxylated butanoates from Trichoderma sp.
Neomacrophorin I、II 和 III,是来自木霉属的新型补二甲酰环己烷与羟基化丁酸酯。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Hirose;A.; Maeda;H.; Tonouchi;A.; Nehira;T.; Hashimoto;M.
  • 通讯作者:
    M.
旧 Fengycin構造の合成研究
老风霉素结构的合成研究
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    S.Kanamaru;M.Honma;T.Murakami;T.Tsushima;S.Kudo;K.Tanaka;K.Nihei;T.Nehira;M.Hashimoto;橋本勝;橋本勝・廣瀬あかね・殿内暁夫・根平達夫;本村優奈・狩原恭平・田中和明・前多隼人・根平達夫・ウォーレンヒーリー橋本勝;橋本勝・廣瀬あかね・殿内暁夫・根平達夫;本村優奈・狩原恭平・田中和明・前多隼人・根平達夫・ウォーレン ヒーリー;村井嘉晃・高橋萌子・坂元君年・橋本勝;廣瀬あかね・殿内暁夫・根平達夫・橋本勝;六車美沙・本間美保・橋本勝
  • 通讯作者:
    六車美沙・本間美保・橋本勝
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

HASHIMOTO Masaru其他文献

HASHIMOTO Masaru的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('HASHIMOTO Masaru', 18)}}的其他基金

Investigation of practical calculation protocols in the reproduction of spectra of natural products.
天然产物光谱再现中实用计算协议的研究。
  • 批准号:
    16K14910
  • 财政年份:
    2016
  • 资助金额:
    $ 2.25万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
Bioorganic study on mycoparasitism by Lambertella spp.
兰伯特菌属真菌寄生的生物有机研究。
  • 批准号:
    21380069
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 2.25万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
A reaction mechanism elucidation study based on many sugar-endo Type glycosidase complex analysi
基于多糖内切型糖苷酶复合物分析的反应机理阐明研究
  • 批准号:
    19380064
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 2.25万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

相似海外基金

学生実習でも可能なDNA塩基配列決定手法の確立
可用于学生实训的DNA序列测定方法的建立
  • 批准号:
    24K06424
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.25万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Evaluation of preferences for equity in resource allocation decision-making for health policy
卫生政策资源分配决策中公平偏好的评估
  • 批准号:
    474155
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 2.25万
  • 项目类别:
    Studentship Programs
日本人ハプロイドゲノムの構造多型の配列決定と高効率アッセイ法の開発
日本单倍体基因组结构多态性的测序和高效检测方法的开发
  • 批准号:
    26430193
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 2.25万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
次世代シークエンサーによる統合失調症脆弱性HLA領域の配列決定
使用下一代测序仪对精神分裂症易受影响的 HLA 区域进行测序
  • 批准号:
    26293267
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 2.25万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
メダカを用いたDNAシークエンサーによる配列決定を取り入れた遺伝学実験の教材化
使用青鳉鱼进行 DNA 测序仪测序的遗传学实验教材
  • 批准号:
    22924006
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 2.25万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
ゲノム機能研究の比較解析基盤を提供する重要魚類の機能性RNA大量配列決定
重要鱼类功能RNA大规模测序为基因组功能研究提供比较分析平台
  • 批准号:
    22770237
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 2.25万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
HPV塩基配列決定による新規ハイリスクバリアントと高齢者子宮頸癌関連型の同定
通过 HPV 测序鉴定与老年人宫颈癌相关的新型高危变异和类型
  • 批准号:
    18591841
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 2.25万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
ゼニゴケY染色体の全配列決定・アノテーション・遺伝子発現プロファイル
苔类 Y 染色体的完整测序、注释和基因表达谱
  • 批准号:
    15011224
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 2.25万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
化学修飾探針を用いたSTMによるDNA/RNAの塩基配列決定法
使用化学修饰探针的 STM DNA/RNA 碱基测序方法
  • 批准号:
    02J07944
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 2.25万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
塩基配列決定による子宮頸癌、異形成、健常女性の網羅的HPV型データベースの構築
利用碱基测序构建宫颈癌、不典型增生和健康女性的综合 HPV 型数据库
  • 批准号:
    14770861
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 2.25万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了