权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

ゼニゴケY染色体の全配列決定・アノテーション・遺伝子発現プロファイル

苔类 Y 染色体的完整测序、注释和基因表达谱

基本信息

批准号：
15011224
负责人：
大山莞爾
金额：
$ 3.84万
依托单位：
Ishikawa Agricultural College
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

YR1を構成する31クローンのドラフト塩基配列を得た。YR2については、コンティグをさらに伸長させ(合計6.29Mb)、57クローンの塩基配列を得た。YR1中に14個の遺伝子を見いだした。YR2については、Contig-Aで22個、Contig-Bで21個の遺伝子を見いだした。これらのうち少なくとも17個は雄生殖器官および葉状体で発現しており、残り7個は雄生殖器官特異的に発現していた。雄生殖器官特異的に発現していた遺伝子の中には、マウス精子の鞭毛に局在するタンパク質と相同性を示すアミノ酸配列をコードするものも含まれていた。局在するタンパク質と相同性を示すアミノ酸配列をコードするものも含まれていた。雌雄生殖器官および葉状体由来のcDNAライブラリーを作成し、遺伝学研究所にて配列解読を依頼している。今後の課題として、今回の相同性検索は、BLASTアルゴリズムによる単純なものであったが、今後はWise2を用いてより詳細に遺伝子を探索する。またEST情報を取得した後、遺伝子コード領域を正確かつ網羅的に探索する。同時にアレイ作成に着手し、Y染色体遺伝子の発現解析を行う。ゼニゴケY染色体には、他の植物種の遺伝子とは相同性を示さず、動物の遺伝子のみと相同性を示す遺伝子が存在した。今後、ゼニゴケY染色体遺伝子と動物遺伝子とを比較することで、例えば精子全般に共通して必要とされる因子を同定することが可能になると考えられる。

YR1 is composed of 31 parts and the base is arranged. YR2 has been expanded (6.29Mb in total), and 57 units have been allocated. YR1 contains 14 missing pieces. YR2, Contig-A 22, Contig-B 21 17 male reproductive organs and thallus appeared, 7 male reproductive organs and thallus appeared. Male reproductive organs are found in the middle of the sperm, and sperm are found in the middle of the sperm. The quality of the product is similar to that of the original product. Genital organs and thallus origin of cDNA translation, genetic research institute for the translation of DNA translation Future issues, current similarities, BLAST failures, and future use of Wise2 are explored. After the EST information is obtained, the sub-domain is searched correctly. At the same time, Y-chromosome gene expression analysis was carried out. The Y-chromosome is the same as that of other plant species, and the same as that of animals. In the future, the Y chromosome gene and the animal gene are compared, and the common factors of sperm are determined.