Identification of SNPs on mature micro RNA to analyze origin of miRNA

鉴定成熟 micro RNA 上的 SNP 以分析 miRNA 的起源

• 批准号: 25670369
• 负责人: CHAYAMA Kazuaki
• 金额: $ 2.41万
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2013
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2013-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-25670369/
• 关键词: 肝臓学; SNP; digital PCR; microRNA; transplantation

Recent research made it clear that there are certain amount of circulating miRNA in serum, which present in serum associated with proteins such as AGO1 and AGO2. Such AGO-protein bound miRNA is quite stable and detectable by polymerase chain reaction after extraction from the serum samples and reverse transcription. We attempted to analyze organs which secrete each miRNA by analyzing circulating miRNA that is present in serum samples. To perform this analysis we tried to identify SNPs that is present in miRNA. We searched for such SNP in entire human genome analyzing human genome database and identified several candidate SNPs. Although we attempted to detect such miRNA with digital PCR, detection of small amount of miRNA was quite difficult. Further study is needed to detect such small amount of miRNA in serum samples.

最近的研究表明，血清中存在一定量的循环miRNA，其存在与血清中AGO1、AGO2等蛋白相关。这种ago蛋白结合的miRNA从血清样品中提取并进行逆转录后，具有相当的稳定性和聚合酶链反应可检测到。我们试图通过分析血清样本中存在的循环miRNA来分析分泌每种miRNA的器官。为了进行这一分析，我们试图确定存在于miRNA中的snp。我们通过分析人类基因组数据库，在整个人类基因组中寻找这些SNP，并确定了几个候选SNP。虽然我们尝试用数字PCR检测这类miRNA，但少量的miRNA检测难度很大。在血清样本中检测如此少量的miRNA还需要进一步的研究。

项目成果

Thromboxane A2 Synthase Inhibitors Prevent Production of Infectious Hepatitis C Virus in Mice with Humanized Livers.

血栓素 A2 合酶抑制剂可防止具有人源化肝脏的小鼠产生传染性丙型肝炎病毒。

• DOI: 10.1053/j.gastro.2013.05.014
• 发表时间: 2013
• 期刊: Gastroenterology
• 影响因子: 29.4
• 作者: Abe Y;Aly HH;Hiraga N;Imamura M;Wakita T;Shimotohno K;Chavama K;Hijikata M.
• 通讯作者: Hijikata M.

New Treatment Paradigms for HCV: The Basics

HCV 新治疗模式：基础知识

• 发表时间: 2014
• 作者: Chayama K ;Hayes CN;Ohishi W,Kawakami Y;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰
• 通讯作者: 茶山一彰

Treatment of Chronic Hepatitis C with First Generation Protease Inhibitors in Asian Population:Telaprevir-Based Triple Therapy in Japanese Population

第一代蛋白酶抑制剂治疗亚洲人群慢性丙型肝炎：日本人群基于特拉匹韦的三联疗法

• 发表时间: 2013
• 作者: Chayama K ;Hayes CN;Ohishi W,Kawakami Y;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰
• 通讯作者: 茶山一彰

DAAs時代におけるC型慢性肝炎治療戦略と今後の展望

DAA时代慢性丙型肝炎治疗策略及未来展望

• 发表时间: 2013
• 作者: Chayama K ;Hayes CN;Ohishi W,Kawakami Y;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰
• 通讯作者: 茶山一彰

All-oral Combination of Daclatasvir Plus Asunaprevir in Interferon Ineligible Naïve/Intolerant and Nonresponder Japanese Patients Chronically Infected with HCV Genotype 1b:Results from a Phase 3 Trial

Daclatasvir 加 Asunaprevir 的全口服组合治疗不符合干扰素初治/不耐受和无反应的慢性感染 HCV 基因型 1b 的日本患者：3 期试验结果

• 发表时间: 2013
• 作者: Chayama K ;Hayes CN;Ohishi W,Kawakami Y;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰;茶山一彰
• 通讯作者: 茶山一彰