Development of a comprehensive method for expression profiling of theplant genome with the use of histone code.

开发使用组蛋白代码进行植物基因组表达谱分析的综合方法。

• 批准号: 23657040
• 负责人: OBOKATA Junichi
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: Kyoto Prefectural University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-23657040/
• 关键词: シロイヌナズナ; ChIP-seq 解析; クロマチンリモデリング; ヒストンコード; H2A.Z; 遺伝子予測; 発現プロファイリング; 植物ゲノム; 転写開始点; ヌクレオソーム; 転写領域; プロモーター

In order to develop a comprehensive method for expression profiling of the plant genome with the use of histone code, we examined the genome-wide distribution profile of a histone variant H2A.Z in reference to the external stimuli and the position and strength of the transcription start sites (TSSs). Our results suggest that the plant H2A.Z could be a relatively stable marker for the transcribed regions of the plant genome.

为了开发一个全面的方法表达谱的植物基因组与使用组蛋白代码，我们研究了全基因组分布的组蛋白变体H2A. Z的外部刺激和转录起始位点（TSS）的位置和强度。我们的研究结果表明，植物H2A. Z可能是一个相对稳定的标记的转录区域的植物基因组。

项目成果

高等植物において遺伝子コード領域の存在は転写型ジーンサイレンシングを抑制する

基因编码区的存在抑制高等植物中的转录基因沉默

• 发表时间: 2012
• 作者: 松尾充啓;佐藤壮一郎;工藤久幸;安井孝彰;中邨真之;木村宏;山本義治;小保方潤一
• 通讯作者: 小保方潤一

A new driving force for the functional gene transfer during endo- symbiotic evolution

内共生进化过程中功能基因转移的新驱动力

• 发表时间: 2012
• 作者: 佐藤壮一郎;Babiychuk Elena;松尾充啓;坂本智昭;倉田哲也;Kushnir Sergei;小保方潤一;Junichi Obokata
• 通讯作者: Junichi Obokata

Pentatricopeptide repeat proteins involved in plant organellar RNA editing.

• DOI: 10.4161/rna.24908
• 发表时间: 2013
• 期刊: RNA biology
• 影响因子: 4.1
• 作者: Yagi Y;Tachikawa M;Noguchi H;Satoh S;Obokata J;Nakamura T
• 通讯作者: Nakamura T

植物ゲノム上でのプロモーター機能領域の出現に対するATG開始コドンの役割

ATG 起始密码子在植物基因组启动子功能区出现中的作用

• 发表时间: 2011
• 作者: 佐藤壮一郎;松尾充啓;工藤久幸;木村宏;中邨真之;山本義治;小保方潤一
• 通讯作者: 小保方潤一

シロイヌナズナTFIIF変異体のゲノムワイド転写開始点解析

拟南芥 TFIIF 突变体的全基因组转录起始位点分析

• 发表时间: 2012
• 作者: 佐藤壮一郎;Babiychuk Elena;松尾充啓;坂本智昭;倉田哲也;Kushnir Sergei;小保方潤一
• 通讯作者: 小保方潤一