ミドリイシサンゴの環境ストレス耐性の遺伝的基盤：ゲノムの種内多型から探る

鹿角珊瑚环境胁迫耐受性的遗传基础：探索基因组中的种内多态性

• 批准号: 21K14898
• 负责人: 仮屋園 志帆
• 金额: $ 1.41万
• 依托单位: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (2022)The Graduate University for Advanced Studies (2021)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K14898/
• 关键词: リシークエンス; ゲノム; ゲノム多型

サンゴ礁をつくる造礁サンゴ（以下サンゴと表記する）は、生物多様性の高いサンゴ礁生態系の基盤である。この造礁サンゴは、水温の上昇や海洋の酸性化といった地球規模の環境変動により、その生息数が減少している。生息環境からのストレス（環境ストレス）によりサンゴの個体が受ける影響には、個体差があること、この個体差にはそれぞれの個体のゲノム情報の違いが関与することがわかってきている。だが、具体的にどのような遺伝子が関わるのかという知見は少ない。 そこで本研究では、サンゴの環境ストレス耐性の個体差がどのように生み出されてきたのかを、コユビミドリイシ集団を用いたゲノム比較解析、ストレス耐性に関連するゲノム領域の分子進化解析により検討している。本年度は、サンゴのゲノム塩基配列データを用いて、「ある遺伝子をもつ個体ともたない個体が存在する」という遺伝子有無の多型を探索した。 この多型は遺伝子の機能の有無に直結するため、個体間の違いに影響する可能性がある。コユビミドリイシの全ゲノム塩基配列を参照配列として、遺伝子有無の多型を探索したところ、タンパク質の安定性に関わる１遺伝子を含むあるゲノム領域が、研究対象の1集団で欠失している可能性が高いことが示された。この欠失領域に存在する遺伝子は、先行研究により、サンゴの高温への応答や、サンゴの浮遊性の幼生が固着性の成体へと変態する際の応答に関わることが予想されている遺伝子であった。より詳細な研究が必要ではあるが、このような遺伝子を持つ群体と持たない群体が存在することにより、ストレス耐性の違いが生じる可能性が示唆された。

The diversity of organisms in the reef ecosystem is high. The rise of water temperature, the acidification of the ocean, the change of the environment on the scale of the earth, and the decrease of the number of living things The environment is different from the environment, and the individual is affected by the environment. The specific meaning of the word is: In this study, we analyzed the molecular evolution of different domains by using comparative analysis and correlation analysis. This year, we will explore whether there are multiple types of genes in the gene pool. The function of the polytype gene is directly related to the possibility of inter-individual interference. All of them are required to be assigned to the same group. The reference assignment is required to be assigned to the same group. The polymorphism of the gene is explored. The stability of the gene is related to the stability of the gene. The gene is included in the domain. The possibility of missing the gene is high. The existence of such missing fields is related to the study of the relationship between the high temperature and the high temperature, and the relationship between the plankton, the juvenile, and the fixed adult. A detailed study is necessary to demonstrate the possibility of the existence of a population that is resistant to a disease.