ゲノム比較で解明するミドリイシ属サンゴの産卵時期決定の遺伝的基盤

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本研究は琉球列島で優占するコユビミドリイシと、この種に遺伝的に近縁で産卵時期の異なるAcropora sp.1のゲノム比較により、（１）産卵時期の違いに関わる遺伝子を特定し、（２）遺伝子発現解析、（３）空間的な発現解析により候補遺伝子の関与を示すことで、ミドリイシ属の産卵時期を決める遺伝的な基盤を解明することを目的としている。２０２２年度は、研究対象の２種のゲノムリシークエンスデータを用いた、集団ゲノム解析を実施した。また遺伝子発現解析のための定期的なサンプリングを実施した。しかし新型コロナウイルス感染症による移動制限や水槽でのサンゴの維持の問題から、計画通りのサンプリングは達成できなかった。このような状況ではあったが、公共データベースのデータを活用し次のような実績をあげることができた。（１）産卵時期の違いに関わる遺伝子の特定については、ゲノムリシークエンスデータを用いて、研究対象の２種間で異なる（分化した）ゲノム領域を特定した。次いでこれらのゲノム領域に存在する遺伝子を特定し、それら遺伝子の機能を遺伝子の相同性から予想した。（２）遺伝子発現解析による候補遺伝子の関与の検証については、遺伝子発現解析のための定期的なサンプリングを実施しが、前述した理由から計画通りのサンプリングは達成できなかった。そこで、公共のデータベースに登録されているミドリイシ属由来の全発現遺伝子データを取得し、サンゴの各生活史での遺伝子発現を解析した。これにより、集団ゲノム解析により特定した遺伝子の発現の特徴を調べることができた。これらの研究成果として、学会発表（１件）とシンポジウムでの発表（１件）を実施することができた。また、これらの研究成果（の一部）を論文としてまとめ国際誌への投稿準備を進めている。