未培養微生物のシングルセル解析を発展させる新規微生物イメージング技術の開発
开发新的微生物成像技术以推进未培养微生物的单细胞分析
基本信息
- 批准号:21K14906
- 负责人:
- 金额:$ 2.91万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
- 财政年份:2021
- 资助国家:日本
- 起止时间:2021-04-01 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
地球における環境保全およびバイオテクノロジーを発展させるためには、更なる微生物生態の理解が重要である。多くの微生物が人為的な培養が困難である現状から、近年微生物を個々でゲノム解析を行うシングルセル解析が世界中で行われている。しかし、微生物を回収するために微生物を視覚的に検出する必要があるが、未だ確立させた手法が存在していない。昨年度は、銅イオンを用いないclick chemistryであるcopper-free click chemistryと研究代表者が開発したhybridizationchain reaction-Fluorescence in situ hybridization (HCR-FISH) を組み合わせたシングルセル解析が可能な高感度FISH法の開発を行った。その結果、菌体内でcopper-free click chemistryとHCR-FISH法を組み合わせることに成功した。そこで、今年度は、蛍光強度の増幅を目指し、copper-free click chemistryの実験条件、各プローブ濃度、HCR-FISH法の試薬濃度等を検討した結果、これまで報告されているHCR-FISH法よりも約3倍の蛍光強度を得ることに成功した。また、環境サンプルとしてバイオリアクターに存在するNitrospira属を標的とし、本手法を適用させた結果、特異的な蛍光が得られただけでなく、微生物の回収に向けてフィルター上でも適用可能であった。
The importance of understanding microbial ecology in the development of environmental protection on Earth Many microorganisms are difficult to cultivate artificially. In recent years, microorganisms have been analyzed in the world. There is no way to detect the presence of microorganisms. In the past year, the researchers have developed a hybridization chain reaction-Fluorescence in situ hybridization (HCR-FISH) method for the analysis of copper, copper and copper. The results were obtained by copper-free click chemistry and HCR-FISH. The results of this study include the increase in fluorescence intensity, copper-free click chemistry conditions, concentration of each reagent, HCR-FISH assay concentration, etc. The HCR-FISH assay was successful in obtaining about 3 times the fluorescence intensity. The results of this method are as follows:
项目成果
期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Copper-free click chemistryとHCR-FISH法を組み合わせた高感度FISH法
结合无铜点击化学和 HCR-FISH 方法的高灵敏度 FISH 方法
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:4)樋口ひなた; 山田光陽;山口隆司;山口剛士
- 通讯作者:山口剛士
Copper free click chemistryを組み合わせた高感度FISH法における特異性評価
高灵敏度 FISH 方法结合无铜点击化学的特异性评估
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:樋口ひなた; 山田光陽;山口隆司;山口剛士
- 通讯作者:山口剛士
Cupper-free click chemistryを用いた高感度FISH法の特異性評価
使用无铜点击化学的高灵敏度 FISH 方法的特异性评估
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:樋口ひなた; 山田光陽;山口剛士
- 通讯作者:山口剛士
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