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Individual regulation of kinetochore-microtubule attachment revealed by a novel chromosome analysis technology

Individual regulation of kinetochore-microtubule attachment revealed by a novel chromosome analysis technology
新型染色体分析技术揭示动粒-微管附着的个体调节
批准号:
21K15022
负责人:
竹之内 修
金额:
$3.0万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31

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本年度は、①機械学習による染色体同定モデルの構築と②個々の染色体の動態解析を行った。染色体同定モデルの構築について、これまで使用していた学習モデルでは、達成できる予測性に限界があることが判明したため、学習モデルの変更を行った。さらに、学習するデータの情報量(データの圧縮の仕方、サンプル数の変更)を増加させ、再度学習を行った。結果、1つの卵母細胞内において、5-10種の染色体を高確率(85-100%)で判定できることがわかった。本結果はdCasによる蛍光標識と機械学習によるアプローチが染色体同定に極めて有用であることを示唆している。個々の染色体の動態解析について、卵母細胞内に存在する20種の染色体のうち、10種の染色体(1,2,3,8,9,17,18,19番, X)の動態解析を行った。結果、小さな染色体(17,18,19番)は大きな染色体(1,2,3,X)に比べ、紡錘体の内側に局在することが判明した。また、核膜崩壊から1-3時間においてサイズ依存的な局在傾向が確立していき、その後anaphaseまでその傾向が維持されることが明らかになった。さらに、個々の染色体の動原体の挙動を調べると、小さな染色体ほど微小管の接合が早期に開始される可能性が判明した。この結果は、個々の染色体ごとに制御に差が存在することを示唆している。次に、動原体たんぱく質Ndc80の微小管接合部位の変異体を発現させたところ、サイズ依存的な局在が減弱された。この結果は、微小管接合の重要性を示唆している。
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会议论文
受精卵の核内における染色体の空間制御の分子基盤と生物学的重要性の探求
4D Imaging-based Analysis of Segregation Errors of individually labeled Chromosomes in Mouse Oocytes
心筋細胞間コミュニケーションにおけるGPCRの機能解析が可能な光制御技術の開発
  • 批准号:
    16J04820
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额:
    $1.09万
  • 财政年份:
    2016
  • 负责人:
    竹之内 修
  • 依托单位:
国内基金
海外基金
细胞有丝分裂过程中Aurora-A激酶驱动内质网动态形变促进染色体排列的机制研究
  • 批准号:
    32100589
  • 项目类别:
    青年科学基金项目(C类)
  • 资助金额:
    30.0万元
  • 批准年份:
    2021
  • 负责人:
    张炜
  • 依托单位:
细胞核分布基因C样蛋白2在胞质分裂过程中的作用及机制研究
  • 批准号:
    32070709
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    杨月红
  • 依托单位:
异染色质蛋白HP1与ATRX结合在有丝分裂期维护染色体稳定性的分子机制研究
  • 批准号:
    32000499
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    易琦
  • 依托单位:
用一种新的方法研究Bub1调控有丝分裂的分子机制
  • 批准号:
    31970666
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万元
  • 批准年份:
    2019
  • 负责人:
    张刚
  • 依托单位: