現代日本人の縄文由来SNPを用いた縄文人の集団史に関する包括的解析

利用现代日本人绳文衍生的 SNP 综合分析绳文人的人口历史

基本信息

  • 批准号:
    21K15175
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.16万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

2022年度は、昨年度までに検出した現代日本人ゲノム中の20万個の縄文人由来変異を用いて、日本人の成立史を調べる解析を行った。現代日本人の北海道を除く46都府県の全ゲノムSNP情報を用いて縄文人由来変異保有率を調べたところ、現代日本の沖縄や東北地方、鹿児島および島根などの地域集団では縄文人由来変異の保有率が高く、近畿や四国では縄文人由来変異の保有率が低いことが明らかとなり、現代日本人の縄文人と渡来人の混血の程度には地理的な勾配があることが示された。昨年度までに縄文人由来変異を遺伝的マーカーとして縄文人および渡来系弥生人の全ゲノムSNPのアリル頻度を推定する解析を行ってきたが、本年度はこのアリル頻度情報と日本人のGWASの解析結果を組み合わせて、縄文人と渡来人の表現型を復元する解析を行った。この結果、縄文人は遺伝的に低身長で血糖値や中性脂肪が高くなりやすいこと、渡来人は遺伝的に高身長で好酸球数やCRP値が高くなりやすいことが明らかとなった。これら縄文人および渡来人の特徴的な遺伝形質は、それぞれの生業形態に適応した結果生じたのではないかと考察した。さらに、現代日本人の一部の表現型に地域差がある理由は、「縄文人と渡来人がそれぞれ特徴的な表現型を持っており、現代における両集団の混血の程度が地域間で異なるため」であると考えられた。本研究で得られた知見から、「現代日本人の遺伝子型と表現型の地域的多様性は、先史時代の本土日本の各地域の人口規模の違いに起因する、地域間の縄文人と渡来人の混血の程度の違いにより生じた」という本土日本人の集団形成モデルを提唱し、国内学会および査読付き国際誌で報告した。
2022 annual は, yesterday's annual ま で に 検 out し た modern Japanese ゲ ノ ム の in 200000 の jomon people origin - different を with い て, history of the Japanese established の を べ る parsing line を っ た. Modern Japanese Hokkaido の を except く 46 mansion 県 の full ゲ ノ ム SNP intelligence を with い て jomon people origin - the different retention を adjustable べ た と こ ろ, modern Japanese の 縄 や northeast place, deer island where お よ び island root な ど の region set 団 で は jomon people origin - different の penetration が high く, kinki や で は jomon people origin - different の penetration が low い こ と が ら Youdaoplaceholder2 とな とな, modern Japanese, Okinawa literatorians と, immigrants <s:1>, mixed race <e:1>, degree に, に, geographical な matching がある, とが, とが indication された. Yesterday's annual ま で に jomon people origin - different を but 伝 マ ー カ ー と し て jomon people お よ び crossing to tie yayoi の full ゲ ノ ム SNP の ア リ ル frequency を presumption す る parsing line を っ て き た が, this year's は こ の ア リ ル frequency intelligence と Japanese の GWAS の analytical results を group み close わ せ て, jomon people と crossing the bearer の phenotype を recovery す る parsing を line Youdaoplaceholder0. こ の results, jomon people は heritage 伝 に low length で high blood sugar numerical や neutral fat が く な り や す い こ と, crossing the bearer は heritage 伝 に high length で good acid count や CRP high numerical が く な り や す い こ と が Ming ら か と な っ た. こ れ ら jomon people お よ び な of crossing the bearer の te 徴 伝 character は, そ れ ぞ れ の に profession form optimum 応 し た result born じ た の で は な い か と investigation し た. さ ら に, modern Japanese の a の phenotype に regional difference が あ る reason は, "jomon people と crossing the bearer が そ れ ぞ れ な phenotype of 徴 を hold っ て お り, modern に お け る struck set 団 の regional で between different degree of half-blood の が な る た め" で あ る と exam え ら れ た. This study で have ら れ た knowledge か ら, type "伝 son of modern Japanese の と phenotype の regional history of many others in sexual は, first time の native Japanese の geographic の population scale の violations い に cause す る, regional between の jomon people と crossing the bearer の half-blood の degree の violations い に よ り raw じ た" と い う native Japanese の set 団 form モ デ ル を sing し, domestic society お よ び check Youdaoplaceholder0 reports to 読 International Journal で on た た.

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
現代日本人の縄文人由来変異から解き明かす本土日本人の形成史
从现代日本人的绳纹衍生变异揭示日本大陆人的形成历史
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    渡部裕介;大橋順
  • 通讯作者:
    大橋順
現代日本人の集団ゲノムデータに基づく縄文人の全ゲノムSNPのアリル頻度の推定
基于现代日本人群基因组数据估计绳文全基因组 SNP 等位基因频率
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    渡部裕介;河合洋介;大前陽輔;宮原麗子;Seik-Soon Khor;野入英世;大橋順;徳永勝士
  • 通讯作者:
    徳永勝士
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渡部 裕介其他文献

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现代日本基因组中源自绳文人的候选 SNP 的检测
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    渡部 裕介;大橋 順
  • 通讯作者:
    大橋 順

渡部 裕介的其他文献

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    $ 2.16万
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    $ 2.16万
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    2003
  • 资助金额:
    $ 2.16万
  • 项目类别:
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  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 2.16万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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作者:{{ showInfoDetail.author }}

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