Who is the host of uncultivated viruses? Linking viral and bacterial genomes in the environment
Who is the host of uncultivated viruses? Linking viral and bacterial genomes in the environment
批准号:
22K15182
负责人:
岡崎 友輔
金额:
$3.0万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2025-03-31
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英文摘要
メタゲノム解析の普及で、環境中のウイルスのゲノムを分離培養を介さず直接得られるようになった。しかし新たな課題となっているのが「ゲノム情報だけでは、ウイルスの生態の理解に必須の『宿主』が分からない」ことである。本研究では、湖沼の細菌とそれに感染するウイルス群集を対象に、その両者を繋ぐ情報に多様な先端技術を駆使して迫る。これにより、湖沼微生物生態系において「どのウイルスがどの細菌に感染するのか?」を網羅的に解明し、その生態と進化をとりまく理解を飛躍させる。今年度までの研究では、琵琶湖沖において、夏季・冬季それぞれ2水深から得られた細菌のシングルセルゲノム解析を行い、細菌ゲノムと同時に得られるウイルスゲノム配列に着目することで、ウイルス-宿主ペアの網羅的な特定を試みている。
期刊论文(9)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
チェコ・科学アカデミー(チェコ)
捷克科学院(捷克共和国)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
“湖の微生物生態系”を対象としたゲノム・多型・遺伝子発現の網羅的比較解析
“湖泊微生物生态系统”基因组、多态性、基因表达综合比较分析
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[岡崎友輔, 中野伸一, 豊田敦, 玉木秀幸]
通讯作者:
玉木秀幸
湖沼深水層の細菌の生態学
深水湖泊和沼泽中细菌的生态学
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[岡崎友輔, 中野伸一]
通讯作者:
中野伸一
Ecogenomics of prokaryotes, viruses, and microbial eukaryotes in deep freshwater lakes
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批准号:18J00300
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$2.58万
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财政年份:2018
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负责人:岡崎 友輔
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依托单位:
海外基金