In silico解析を活用した球脊髄性筋萎縮症の骨格筋病態の解明

使用计算机分析阐明脊髓和延髓肌萎缩症的骨骼肌病理学

• 批准号: 22K15705
• 负责人: 飯田 円
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K15705/
• 关键词: 球脊髄性筋萎縮症; in silico解析; 骨格筋病態; 細胞モデル; マウスモデル; In silico解析

球脊髄性筋萎縮症（SBMA）は成人男性のみに発症する進行性の遺伝性神経筋疾患である。本研究課題では、in silico解析を活用してSBMAの骨格筋病態の解明を目指す。本年はSBMA細胞モデルおよびマウスモデルを用いた既存の遺伝子発現解析の結果を利用して、骨格筋病態の改善が期待される候補薬をin silico解析により抽出することを目標とした。1. SBMAモデルの遺伝子情報の収集SBMAマウスモデルの骨格筋に関する遺伝子発現解析データ(RNA-seqもしくはmicroarray)を5種類（前脛骨筋、大腿四頭筋など）取得した。そのうち一つはメスのSBMAマウスモデルのデータであった。またSBMA患者のiPSC-derived motor neuronの遺伝子発現解析データを3種類、SBMA患者の剖検組織の遺伝子発現解析データを1種類取得した。データ取得の条件（FDRやfold changeなど）を設定し、それぞれの発現変動遺伝子（DEG）を算出した。算出したDEGをLibrary of Integrated Network-based Cellular Signatures（LINCS）データベースに入力して、SBMAの病態と負の相関を呈する薬剤を抽出した。それらの薬剤の作用機序について各モデルで共通して抽出されるものを確認した。2. SBMAと脊髄性筋萎縮症（SMA）の遺伝子情報の比較SMAのマウスモデルの遺伝子発現解析データを取得し、上記と同様にSMAの病態と負の相関を呈する薬剤を抽出した。それらの薬剤の作用機序についてSBMA抽出されたものと比較した。

Spinal cord atrophy (SBMA) みに adult male みに occurrence する progressive epigrotic 伝 neuromuscular disorder である. The research topic of this study is で で, in silico, to analyze を, to apply <s:1> SBMA, and to explain the pathological conditions of <s:1> bone, grid and tendon, and to clarify を and す. This year は SBMA cells モ デ ル お よ び マ ウ ス モ デ ル を with い た existing の heritage 伝 son 発 analytical results の を now use し て, skeletal muscle pathological の improve が expect さ れ る alternate 薬 を in silico parsing に よ り spare す る こ と を target と し た. 1. SBMA モ デ ル の heritage 伝 child intelligence の 収 set SBMA マ ウ ス モ デ ル の skeletal muscle に masato す る posthumous son 伝 発 now parse デ ー タ (RNA - seq も し く は microarray) を 5 kinds (former shin jin, thigh quadriceps muscle な ど) obtain し た. Youdaoplaceholder0 うち うち - うち メス メス メス SBMA ウスモデ ウスモデ デ デ タであった タであった タであった. ま た SBMA patients の iPSC - derived motor neuron の posthumous son 伝 発 now parse デ ー タ を 3 kinds, SBMA patients の cutting 検 organization の heritage 伝 son 発 now parse デ ー タ を 1 species obtained し た. デ ー タ obtain の conditions (FDR や fold change な ど) を set し, そ れ ぞ れ の 発 now - move legacy 伝 child (DEG) を calculate し た. Calculate し た DEG を Library of Integrated Network - -based Cellular Signatures (LINCS) デ ー タ ベ ー ス に し into force て, SBMA の pathological と negative の phase masato を show す る 薬 tonic を spare し た. そ れ ら の 薬 tonic の function machine sequence に つ い て each モ デ ル で common し て spare さ れ る も の を confirm し た. 2. SBMA と spinal marrow sex muscle atrophy (SMA) の heritage 伝 child intelligence の is SMA の マ ウ ス モ デ ル の posthumous son 伝 発 now parse デ ー タ を obtain し, written と with others に SMA の pathological と negative の phase masato を show す る 薬 tonic を spare し た. The sequence of action of それら drug <e:1> is に された て て てSBMA extraction された <s:1> と と for comparison of <s:1> た.

项目成果

Metabolome and transcriptome analysis on muscle of sporadic inclusion body myositis.

• DOI: 10.1002/acn3.51657
• 发表时间: 2022-10
• 期刊: ANNALS OF CLINICAL AND TRANSLATIONAL NEUROLOGY
• 影响因子: 5.3
• 作者: Murakami, Ayuka;Noda, Seiya;Kazuta, Tomoyuki;Hirano, Satoko;Kimura, Seigo;Nakanishi, Hirotaka;Matsuo, Koji;Tsujikawa, Koyo;Iida, Madoka;Koike, Haruki;Sakamoto, Kazuma;Hara, Yuichiro;Kuru, Satoshi;Kadomatsu, Kenji;Shimamura, Teppei;Ogi, Tomoo;Katsuno, Masahisa
• 通讯作者: Katsuno, Masahisa

CLINICAL NEUROSCIENCE

临床神经科学

• 发表时间: 2020
• 作者: Ohmura Y;Tanaka F K;Yamanaka A;Yoshioka M.;青木吉嗣
• 通讯作者: 青木吉嗣

Clinical implication of denervation in sporadic inclusion body myositis

• DOI: 10.1016/j.jns.2022.120317
• 发表时间: 2022-06-13
• 期刊: JOURNAL OF THE NEUROLOGICAL SCIENCES
• 影响因子: 4.4
• 作者: Noda, Seiya;Murakami, Ayuka;Katsuno, Masahisa
• 通讯作者: Katsuno, Masahisa