In silico解析を活用した球脊髄性筋萎縮症の骨格筋病態の解明

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球脊髄性筋萎縮症（SBMA）は成人男性のみに発症する進行性の遺伝性神経筋疾患である。本研究課題では、in silico解析を活用してSBMAの骨格筋病態の解明を目指す。本年はSBMA細胞モデルおよびマウスモデルを用いた既存の遺伝子発現解析の結果を利用して、骨格筋病態の改善が期待される候補薬をin silico解析により抽出することを目標とした。1. SBMAモデルの遺伝子情報の収集SBMAマウスモデルの骨格筋に関する遺伝子発現解析データ(RNA-seqもしくはmicroarray)を5種類（前脛骨筋、大腿四頭筋など）取得した。そのうち一つはメスのSBMAマウスモデルのデータであった。またSBMA患者のiPSC-derived motor neuronの遺伝子発現解析データを3種類、SBMA患者の剖検組織の遺伝子発現解析データを1種類取得した。データ取得の条件（FDRやfold changeなど）を設定し、それぞれの発現変動遺伝子（DEG）を算出した。算出したDEGをLibrary of Integrated Network-based Cellular Signatures（LINCS）データベースに入力して、SBMAの病態と負の相関を呈する薬剤を抽出した。それらの薬剤の作用機序について各モデルで共通して抽出されるものを確認した。2. SBMAと脊髄性筋萎縮症（SMA）の遺伝子情報の比較SMAのマウスモデルの遺伝子発現解析データを取得し、上記と同様にSMAの病態と負の相関を呈する薬剤を抽出した。それらの薬剤の作用機序についてSBMA抽出されたものと比較した。