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大頭症を伴う多発奇形症候群の遺伝学的原因の探索

寻找巨头畸形多发畸形综合征的遗传原因

基本信息

批准号：
22K15901
负责人：
藤田京志
金额：
$ 2.91万
依托单位：
Yokohama City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

全エクソーム解析で原因となるバリアントが同定されていない16症例に対し、PI3K/AKTパスウェイの遺伝子のターゲットキャプチャーによるディープシークエンスを血液由来DNAを用いて実施した。平均の読み取り深度は1200xで0.5%以上のバリアントアレル頻度を検出対象とした。PI3K/AKTパスウェイは大頭症を認めるMegalencephaly-Polymicrogyria-Polydactyly-Hydrocephalus症候群、Megalencephaly-capillary malformation-polymicrogyria症候群の原因遺伝子が含まれており、また、これらの症候群では低頻度な体細胞バリアントが血液由来DNAにも認められる例も報告されている。現在候補バリアントについて検証を行っている。申請時に全エクソームが解析中であった6例のうち、3例は原因バリアントを同定し、3例は未同定となった。原因バリアントを同定したうちの1症例はこれまでに報告の少ない遺伝子であったため、他施設に同遺伝子のバリアントを有する類似症例がいないか確認したところ、海外の研究機関に2症例集積されていたため、共同研究する事となった。同じ遺伝子のバリアントを有する症例を集積することにより、遺伝子に特有の臨床的特徴や経過を知る事が可能となる。また、昨年度から大頭症を認める症例を新たに5症例集積し2症例は両親を含めた全エクソームを実施し原因となるバリアントを同定できなかった。そのうち1例は近親婚家系であるため、全ゲノム解析を用いてホモ接合領域に着目して解析を行っていく予定である。残りの3例は現在全エクソーム解析を行っている。

All the reasons for the analysis of the problem were determined by the same method. In 16 cases, PI3K/AKT was used to analyze the DNA of blood origin. The average depth is 1200x 0.5% or more, and the frequency of loss is corresponding to the image. PI3K/AKT is the most common cause of Megalencephaly-Polymicrogyria-Hydrocephalus syndrome and Megalencephaly-capillary malformation-polymicrogyria syndrome. Now the candidate is in the middle of the test. 6 cases of application, 3 cases of application, 3 cases of application. 1 case of similar cases reported by the same organization, 2 cases collected by overseas research organizations, and 2 cases studied jointly. It is possible to collect and analyze the clinical characteristics of the same virus and its associated symptoms. The reason for this is that there are five new cases of the disease. 1 case of consanguineous marriage family, full analysis of the use of the joint field, analysis of the line, predetermined 3 cases of residual