双極性障害大規模シーケンス解析による稀な生殖細胞系列変異と体細胞変異の包括的研究

通过大规模测序分析全面研究双相情感障碍中罕见的种系和体细胞突变

• 批准号: 21H02855
• 负责人: 高田 篤
• 金额: $ 11.07万
• 依托单位: Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H02855/
• 关键词: エクソーム; 次世代シーケンサー; 双極性障害; 体細胞変異

2022年度は、昨年度までに取得したエクソームシーケンスデータの解析を行い、クオリティコントロール、シーケンスマッピング、変異コール、変異タイプ等の基本的なアノテーションの付与などを実施した。引き続いて、コントロールデータとの統計比較、種々のアノテーション（一般集団での頻度、ミスセンス変異の有害度、エピゲノム・転写因子結合情報等）を進めるためのデータ処理を行っている。また、体細胞変異の解析を優先する形で研究を進め、その成果を共同研究として論文としてまとめた。並行して、他の精神神経疾患のゲノムデータ解析を実施し、疾患間比較の基盤を構築した。また、ゲノム解析で同定される疾患関連遺伝子・変異の機能解析を行うための細胞実験系を整備し、CRISPR/Cas9で変異を導入した細胞のRNA-seq解析等を実施した。関連するプロジェクトとして、機械学習手法を用いて神経発達障害原因遺伝子を大規模に同定した研究（Hamanaka et al., Genome Medicine 2022）、ゲノムワイド関連解析の成果に基づいて作製された双極性障害モデルマウスを多角的に解析した研究（Yamamoto et al., Molecular Psychiatry 2023）等の成果を報告した他、統合失調症の分子病理研究に関する最新の知見をまとめるとともに今後の研究の方向性について論じた総説（Nakamura and Takata, Molecular Psychiatry 2023）等を発表した。

2022 annual は, yesterday's annual ま で に obtain し た エ ク ソ ー ム シ ー ケ ン ス デ ー タ の parsing を い, ク オ リ テ ィ コ ン ト ロ ー ル, シ ー ケ ン ス マ ッ ピ ン グ, - different コ ー ル, - different タ イ プ の such as basic な ア ノ テ ー シ ョ ン の give な ど を be applied し た. Lead き 続 い て, コ ン ト ロ ー ル デ ー タ と の statistical comparison, kind of 々 の ア ノ テ ー シ ョ ン (generally set 団 で の frequency, ミ ス セ ン ス - different の harmful degrees, エ ピ ゲ ノ ム planning write factor combined with intelligence, etc.), を into め る た め の デ ー タ 処 Richard を line っ て い る. ま た, somatic - different analytical を の priority す る を で research into め, そ の results を joint research と し て paper と し て ま と め た. Parallel て, other mental and economic disorders <s:1> ゲノムデ タ タ analysis を implementation <s:1>, comparison between disorders <s:1> base plate を construction た た. ま た, ゲ ノ ム parsing で with fixed さ れ masato る disease even heritage 伝 line, sub - different の function, analytical を う た め の cells be 験 を servicing し, CRISPR/Cas9 で - different を import し た cells の RNA - resolution of seq を be applied し た. Masato even す る プ ロ ジ ェ ク ト と し て, machine learning technique を い て god 経 発 of handicap of reason but 伝 child を large-scale に with fixed し た research (Hamanaka et al., Genome Medicine 2022), ゲ ノ ム ワ イ ド masato even parsing の results に base づ い て cropping さ れ た bipolar handicap of モ デ ル マ ウ ス を polygonal に resolution し た research (Yamamoto et al., Molecular Psychiatry 2023) を の results report し た he, identity disorder の Molecular pathology study に masato す る の latest knowledge を ま と め る と と も に の の research direction in the future に つ い て theory じ た 総 said (Nakamura and Takata, Molecular Psychiatry 2023) et al. Youdaoplaceholder0 shows that た.

项目成果

クラスタ/ハブ細胞を決定する遺伝子・鍵分子経路の特定およびヒト疾患との関連解析

鉴定决定簇/中心细胞的基因和关键分子途径并分析与人类疾病的关系

• 发表时间: 2023
• 作者: 門前暁;堀越舞;菊池愛;多田羅洋太;真里谷靖;高田篤
• 通讯作者: 高田篤

Molecular diagnosis of 405 individuals with autism spectrum disorder

• DOI: 10.1038/s41431-023-01335-7
• 发表时间: 2023-03-27
• 期刊: EUROPEAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS
• 影响因子: 5.2
• 作者: Miyake，Noriko;Tsurusaki，Yoshinori;Matsumoto，Naomichi
• 通讯作者: Matsumoto，Naomichi

データ駆動型アプローチによるてんかん性脳症のゲノム解析と分子診断精度向上にむけての取り組み

使用数据驱动的方法提高癫痫性脑病基因组分析和分子诊断的准确性

• 发表时间: 2022
• 作者: Satoru Monzen;Tatsuya Ueno;Mitsuru Chiba;Yasushi Mariya;Andrzej Wojcik;Lovisa Lundholm;高田篤
• 通讯作者: 高田篤

Investigation of newly arising mutations in psychiatric disorders and their implication in abnormal aging

研究精神疾病中新出现的突变及其对异常衰老的影响

• 发表时间: 2022
• 作者: Tashiro M;Ishioka Y;Mesfin BT;Inamura A,Watanuki S;Miyake M;Hiraoka K;Harada R;Furumoto S;Yanai K;Okamura N;Watabe H.;Kenji Hashimoto;高田 篤
• 通讯作者: 高田 篤

Large-scale discovery of novel neurodevelopmental disorder-related genes through a unified analysis of single-nucleotide and copy number variants.

• DOI: 10.1186/s13073-022-01042-w
• 发表时间: 2022-04-26
• 期刊: Genome medicine
• 影响因子: 12.3