多種肺線維症マウスモデル間のシングルセル解析データ比較による炎症細胞機能の解析

通过比较各种肺纤维化小鼠模型之间的单细胞分析数据来分析炎症细胞功能

• 批准号: 22K16195
• 负责人: 小山 壱也
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: The University of Tokushima
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K16195/
• 关键词: 肺線維症; 炎症細胞; シングルセル解析

肺線維症において炎症細胞が肺組織の線維化に関わることが報告されているが、肺線維症の背景疾患には多彩な病態を持つ疾患が含まれており 、その組織線維化の進行の仕方や治療薬への反応性は様々であり、それらに対する炎症細胞の関わり方については十分に解明されていない。ど のように炎症細胞の肺組織線維化の可逆性や進行性への関与を解明することは肺線維症の治療開発に対して有意義であると考えられる。 本研究の目的は様々なマウスモデルでの肺線維化を炎症細胞の関与という視点から探究することである。特にシリカ誘発性肺線維症モデルとブレオマイシン(BLM)誘発性肺線維症モデルにおけるシングルセル解析のデータを元に1) 肺線維化促進に関わる共通の炎症細胞を同定し機能を解析するとともに、2) 肺線維化の改善に関わる炎症細胞を解明し治療標的を明らかにする。シリカ誘発性肺線維症マウスモデルでは非可逆的な肺線維化を呈し、BLM誘発性肺線維症モデルでの肺線維化は可逆的であることが知られている。そのためそれぞれの肺線維化の時間経過で炎症細胞を評価することは線維化を促進もしくは抑制する炎症細胞の同定及び追跡に有用であると考えられた。本研究の以前にシリカ誘発性肺線維症モデルにおける時系列的評価のための炎症細胞プロファイルのscRNA-seqは実施しており、BLMモデルにおける炎症細胞のscRNA-seqを経時的に追加実施し、シリカモデルのデータと比較検討したところ、シリカモデルにおいては病理学的に肉芽腫性炎症が目立つのに対してsc-RNA-seqでは炎症細胞プロファイルにBLMモデルと大きな違いは見られなかった。今後、炎症細胞の空間的解析や他に公表されているデータも含めた解析を行い炎症細胞の線維化における役割を検討していく予定である。

The relationship between inflammatory cells and lung tissue maintenance in lung cancer is reported. Background diseases of lung cancer include multiple pathological diseases, and the relationship between inflammatory cells and treatment is very clear. The relationship between the reversible and progressive development of lung tissue maintenance of inflammatory cells and the significance of the development of treatment for lung diseases is discussed. The purpose of this study was to explore the relationship between lung maintenance and inflammatory cells. 1) Analysis of common inflammatory cell homeostasis related to lung maintenance promotion; 2) Identification of inflammatory cell homeostasis related to improvement of lung maintenance; and 3) Identification of therapeutic targets. In the case of BLM-induced lung disease, it is known that lung maintenance is irreversible and that BLM-induced lung disease is reversible. The time course of lung maintenance was evaluated, and the lung maintenance was promoted, and the inflammatory cells were stabilized and tracked. In this study, we evaluated the scRNA-seq of inflammatory cells in a series of previous studies on the induction of inflammatory lung disease. We also compared the scRNA-seq of inflammatory cells in BLM with that in other studies. In the case of granulomatous inflammation, sc-RNA-seq is used to detect the presence of inflammatory cells. In the future, the spatial analysis of inflammatory cells and other public tables will be carried out in the linear analysis of inflammatory cells.

项目成果

Evaluation of fibrocytes in silica-induced and bleomycin-induced pulmonary fibrosis model in mice by single cell RNA-seq analysis

通过单细胞 RNA-seq 分析评估二氧化硅诱导和博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型中的纤维细胞

• 发表时间: 2022
• 作者: Kazuya Koyama;Seidai Sato;Hiroshi Kawano;Atsushi Mitsuhashi;Kojin Murakami;Yuya Yamashita;Keiko Haji;Kozo Kagawa;Hirohisa Ogawa;Yasuhiko Nishioka
• 通讯作者: Yasuhiko Nishioka