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沖縄県に好発する血管肉腫の免疫微小環境の理解と治療標的となる腫瘍ゲノム変異の探索

了解冲绳县多发血管肉瘤的免疫微环境，寻找肿瘤基因组突变作为治疗靶点

基本信息

批准号：
22K16266
负责人：
粟澤遼子
金额：
$ 2.91万
依托单位：
University of the Ryukyus
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K16266/
关键词：
血管肉腫カポジ肉腫血管内皮細胞遺伝子変異遺伝子発現

项目摘要

頭部血管肉腫とカポジ肉腫は脈管内皮細胞に由来する悪性腫瘍であるが、その病態や予後は著しく異なる。私共はこれまでの疫学調査より、頭部血管肉腫は琉球諸島において世界頻度の3-5倍、古典型カポジ肉腫は原因ウイルスHHV8の浸淫地区である宮古諸島において日本本土の約1000 倍の頻度で好発することを明らかにし、これは、琉球諸島に流布するHHV8が独自の進化を遂げ、宮古島では日本全体の11倍の高感染率であることも一因である。本研究課題では、沖縄県に好発する頭部血管肉腫およびカポジ肉腫のトランスクリプトームおよびエクソームデータの群間比較解析を通して、特に血管肉腫での免疫微小環境やドライバー変異を網羅的に解析し、多数の新規免疫チェックポイント因子阻害薬の中から最適な治療標的を選択するアルゴリズムを開発する。これまでに頭部血管肉腫13検体のトランスクリプトームデータの取得が完了した。これを検出力の高い統計解析を行うために、教室内で保存されている腫瘍組織を加えてデータ数を増やすとともに、疾患コントロールとしてカポジ肉腫のトランスクリプトームデータを取得した。従来の汎用されるデータ処理法では、ストップコドン、フレームシフト、エクソンスキップ等の変異をうけ、蛋白発現のないと考えられる変異RNA発現配列もその発現単位として計上される。そのため、必ずしも機能的蛋白として発現していないRNA分子も、予後不良群vs長期生存群に差のある因子として検出されてしまう。そこで新たなトランスクリプトームの処理プログラムを用いて、さらに広く最適化した遺伝子発現データプロファイルの違いを検索している。現時点での解析で、血管肉腫の検体に共通するウイルスや細菌、真菌などの病原性外来遺伝子の病的意義のある存在は確認されなかった。

Vascular swelling of the head is caused by vascular endothelial cells. In epidemiological investigation, vascular swelling of the head is 3-5 times more frequent in the Ryukyu Islands than in the world. The classical type of vascular swelling is caused by HHV8. The infection area is about 1000 times more frequent in the Miyako Islands than in Japan. The HHV8 is isolated and evolved in the Ryukyu Islands. Miyako Island has an 11-fold higher infection rate than Japan. This study aims to analyze the differences between groups of different immune microenvironment factors in patients with vascular edema, especially vascular edema, and to develop new immune microenvironment factors for the selection of optimal therapeutic targets. The blood vessels of the head were swollen and the body was completely recovered. The number of tumor tissues in the classroom increased and the number of tumor tissues in the classroom increased. In recent years, the general use of different processing methods, such as reverse transcription, reverse transcription. The difference between the RNA molecule and the long-term survival group is due to the presence of a protein that must function. This new technology is used to optimize the process of generating data and to detect errors. At this point in time, the significance of the existence of common pathogens such as bacteria and fungi as pathogenic foreign heritage diseases has been confirmed.