Estimating genotype-environment interaction using genomic information
Estimating genotype-environment interaction using genomic information
批准号:
DP160102126
负责人:
A/Prof Sang Hong Lee
金额:
$23.24万
依托单位国家:
澳大利亚
项目类别:
Discovery Projects
财政年份:
2016
资助国家:
澳大利亚
项目状态:
已结题
起止时间:
2016-01-01 至 2019-04-30
中文摘要
本项目旨在开发统计方法,利用全基因组单核苷酸多态性或序列数据,在基因组水平上探索基因型-环境相互作用。它计划估计遗传变异的影响如何随着环境条件的变化而变化,以及总体遗传变异如何由于特定基因区域的影响变化而变化。它计划提供统计模型和方法,以及在软件中实现的有效算法,这将广泛有利于复杂性状遗传学领域。在基因组水平上估计基因型-环境相互作用效应的方法将有助于阐明复杂的生物系统,包括人类对变化的环境因素的遗传反应和动物对变化的环境条件的潜在适应。
英文摘要
This project aims to develop statistical methods that can explore genotype–environment interaction at the genomic level using genome-wide single nucleotide polymorphisms or sequence data. It plans to estimate how the effects of genetic variants change with changing environmental conditions and how overall genetic variance changes due to changing effects in specific gene regions. It plans to deliver statistical models and methods and an efficient algorithm implemented in software, which would broadly benefit the field of complex trait genetics. Methods to estimate genotype–environment interaction effects at the genomic level would help elucidate complex biological systems, including human genetic response to changing environmental factors and the potential adaptation of animals to changing environmental conditions.
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会议论文
Whole-genome multivariate reaction norm model for complex traits
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批准号:DP190100766
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项目类别:Discovery Projects
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资助金额:$28.38万
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财政年份:2019
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负责人:A/Prof Sang Hong Lee
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依托单位:
Complex trait analyses based on genome-wide approaches
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批准号:FT160100229
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项目类别:ARC Future Fellowships
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资助金额:$50.36万
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财政年份:2017
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负责人:A/Prof Sang Hong Lee
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依托单位:
Novel statistical algorithms and methods to quantify and partition pleiotropy between complex traits in populations
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批准号:DE130100614
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项目类别:Discovery Early Career Researcher Award
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资助金额:$26.45万
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财政年份:2013
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负责人:A/Prof Sang Hong Lee
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依托单位:
国内基金
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人大肠癌SP细胞干性表型和基因型分析
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批准号:81101870
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:20.0万元
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批准年份:2011
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负责人:胡均
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依托单位:
DARC在基底细胞样乳腺癌中作用机制的研究
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批准号:81001172
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:20.0万元
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批准年份:2010
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负责人:王杰
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依托单位:
蛋鸡啄羽相残行为的研究:基于社会性气味识别的控制对策
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批准号:30770289
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项目类别:面上项目
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资助金额:8.0万元
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批准年份:2007
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负责人:赵亚军
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依托单位:
不同基因型蛔虫宿主特异性差异和“猪型蛔虫-猪”、“人型蛔虫-猪”实验模型的建立
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批准号:30560139
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项目类别:地区科学基金项目
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资助金额:24.0万元
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批准年份:2005
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负责人:彭卫东
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依托单位: