RecAファミリー蛋白質によるDNA組換え反応の分子機構の解析
RecAファミリー蛋白質によるDNA組換え反応の分子機構の解析
批准号:
12780482
负责人:
美川 務
金额:
$1.34万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份:
2000
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2000 至 2001
中文摘要
RecA蛋白質とその類似蛋白質はウイルスからヒトまで共通に保存されており,遺伝的組換え反応において中心的役割を果たす。しかし,その分子レベルでの組換え反応機構は明らかでない部分が多い。その最も大きな原因は,組換え反応に直接関与するDNA結合部位が未だに決定されていないことである。本研究ではこれら課題の解決を試みている。昨年度報告した以下の2点について経過を報告する。(1)高度好熱菌RecA蛋白質を用いたRecA蛋白質・DNA複合体のX線結晶構造解析構造的に安定なため結晶化に有利と考えられる高度好熱菌RecA蛋白質を用いて結晶化を行うことにより,RecA蛋白質単体の結晶を得ること,またその格子常数等を決定することに成功した。さらに,RecA蛋白質・DNAの複合体の結晶を得ることに成功し,現在,さらに良質のRecA蛋白質・DNAの複合体の結晶を得るための実験を行っている。(2)単量体化したRecA蛋白質を用いたNMR測定幾つかの方法で単量体化することに成功したRecA蛋白質のNMR測定の結果から,RecA蛋白質の中央ドメインがATPを結合することにより大きな構造変化を起こし,その結果,単鎖DNA結合を強めることをNMRを用いて始めて示した。また,N末端ドメインが単鎖DNAに結合と相互作用することなどを新たに示した。現在,どのアミノ酸残基が各結合に深く関与しているのかを調べる為の実験を行っている。
英文摘要
RecA蛋白質とその類似蛋白質はウイルスからヒトまで共通に保存されており,遺伝的組換え反応において中心的役割を果たす。しかし,その分子レベルでの組換え反応機構は明らかでない部分が多い。その最も大きな原因は,組換え反応に直接関与するDNA結合部位が未だに決定されていないことである。本研究ではこれら課題の解決を試みている。昨年度報告した以下の2点について経過を報告する。(1)高度好熱菌RecA蛋白質を用いたRecA蛋白質・DNA複合体のX線結晶構造解析構造的に安定なため結晶化に有利と考えられる高度好熱菌RecA蛋白質を用いて結晶化を行うことにより,RecA蛋白質単体の結晶を得ること,またその格子常数等を決定することに成功した。さらに,RecA蛋白質・DNAの複合体の結晶を得ることに成功し,現在,さらに良質のRecA蛋白質・DNAの複合体の結晶を得るための実験を行っている。(2)単量体化したRecA蛋白質を用いたNMR測定幾つかの方法で単量体化することに成功したRecA蛋白質のNMR測定の結果から,RecA蛋白質の中央ドメインがATPを結合することにより大きな構造変化を起こし,その結果,単鎖DNA結合を強めることをNMRを用いて始めて示した。また,N末端ドメインが単鎖DNAに結合と相互作用することなどを新たに示した。現在,どのアミノ酸残基が各結合に深く関与しているのかを調べる為の実験を行っている。
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Shibata T, Nishinaka T, Mikawa T, Aihara H, Kurumizaka H, Yokoyama S, Ito Y: "Homologous genetic recombination as an intrinsic dynamic property of a DNA structure induced by RecA/Rad51-family proteins : a possible advantage of DNA over RNA as genomic mate
Shibata T、Nishinaka T、Mikawa T、Aihara H、Kurumizaka H、Yokoyama S、Ito Y:“同源基因重组作为 RecA/Rad51 家族蛋白诱导的 DNA 结构的内在动态特性:DNA 相对于 RNA 的可能优势
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
R.Kato,M.Kataoka,T.Mikawa,R.Masui,N.Nakagawa,H.Kamikubo and S.Kuramitsu: "Observation of RecA protein monomer by small angle X-ray scattering with radiation"FEBS letters. 482・1. 159-162 (2000)
R.Kato、M.Kataoka、T.Mikawa、R.Masui、N.Nakakawa、H.Kamikubo 和 S.Kuramitsu:“通过辐射小角 X 射线散射观察 RecA 蛋白质单体”FEBS 482・1。 .159-162 (2000)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Mikawa T., Shibata T.: "DNA homologous recombination and recombinational repair mediated by RecA/Rad51 family proteins"Tanpakushitsu Kakusan Koso. 46・8(Suppl). 1013-1020 (2001)
Mikawa T.,Shibata T.:“RecA/Rad51家族蛋白介导的DNA同源重组和重组修复”Tanpakushitsu Kakusan Koso 46・8(增刊)1013-1020。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
M.Sugahara,T.Mikawa,R.Kato,K.Fukuyama,T.Kumasaka,M.Yamamoto,Y.Inoue and S.Kuramitsu: "Crystallization and preliminary X-ray crystallographic studies of Thermus thermophilus HB8 MutM protein involved in repairs of oxidative DNA damage"Journal of Biochemist
M.Sugahara、T.Mikawa、R.Kato、K.Fukuyama、T.Kumasaka、M.Yamamoto、Y.Inoue 和 S.Kuramitsu:“参与修复的嗜热栖热菌 HB8 MutM 蛋白的结晶和初步 X 射线晶体学研究
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
M.Sugahara,T.Mikawa,T.Kumasaka,M.Yamamoto,R.Kato,K.Fukuyama,Y.Inoue and S.Kuramitsu: "Crystal structure of a repair enzyme of oxidatively damaged DNA, MutM (Fpg), from an extreme thermophile, Thermus thermophilus HB8"EMBO Journal. 19・15. 3857-3869 (2000)
M. Sugahara、T. Mikawa、T. Kumasaka、M. Yamamoto、R. Kato、K. Fukuyama、Y. Inoue 和 S. Kuramitsu:“氧化损伤 DNA 修复酶 MutM (Fpg) 的晶体结构,来自极端嗜热菌,嗜热栖热菌 HB8"EMBO Journal. 19・15. 3857-3869 (2000)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
相同DNA対合活性を利用した高精度マルチプレックスPCR法の確立
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批准号:18651095
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2006
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负责人:美川 務
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依托单位:
DNA相同組換えの制御機構に関わる蛋白質群の構造と機能
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批准号:16770105
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2004
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负责人:美川 務
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依托单位:
染色体相同組換えの制御機構に関わる蛋白質群の構造と機能
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批准号:14780500
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2002
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负责人:美川 務
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依托单位:
高度好熱菌RecA蛋白質を用いたDNA組換え反応機構の解析
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批准号:96J02266
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1998
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负责人:美川 務
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依托单位:
海外基金