質量分析装置を用いたＳｍａｌｌ－ｃｏｌｏｎｙ　ｖａｒｉａｎｔｓの菌種同定法の検討

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本研究では、様々な菌種において持続的な細胞内での代謝不活性状態から生じる小型コロニー変種であり、様々な栄養素を要求する栄養要求性変異株の総称であるBacterial small-colony variants(SCVs)について、生化学的性状と必要としない菌種同定検査方法である質量分析計を用いた菌種同定の検討を行い、その有用性について検討を行った。本検討では、対象として2008年～2014年の間に臨床材料から分離されたStaphylococcus属、Enterococcus属、腸内細菌科のチミジン要求性菌29株、ヘミン要求性菌7株、オレイン酸要求性菌5株、CO_2ガス要求性菌3株菌計44株を用い、分子生物学的同定検査法と質量分析計を用いた同定検査を行い、その結果を比較した。本検討の結果、分子生物学的同定と質量分析計を用いた同定にて挙げられた菌名は全て一致した。しかしMALDI法での前処理をOn plate法で実施した場合、全て同定スコアが≧2.00となり菌種レベルでの同定となったが、エタノール・ギ酸抽出法によるオレイン酸要求性Staphylococcus epidermidisとヘミン要求性Staphylococcus capraeの同定スコアはそれぞれ平均1.83、1.91となり、挙げられた菌種は正しい結果であったものの属レベルでの同定と判定された。質量分析計を用いた同定でのエタノール・ギ酸抽出法にて同定スコアが若干低くなる菌株が見られたが、SCVsの菌種同定が可能と考えられた。SCVsは細胞内代謝が不活性な状態であるが、質量分析計を用いた同定におけるリボソーム蛋白を主とするマススペクトルパターンに影響を与えないと考えられた。質量分析計による細菌同定検査はSCVsの同定検査にも有用である。