質量分析装置を用いたＳｍａｌｌ－ｃｏｌｏｎｙ　ｖａｒｉａｎｔｓの菌種同定法の検討

质谱法小菌落变异菌种鉴定方法研究

• 批准号: 26931042
• 负责人: 松本 竹久
• 金额: $ 0.26万
• 依托单位: Shinshu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
• 财政年份: 2014
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2014-04-01 至 2015-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-26931042/
• 关键词: Bactorial small-colony variants; MALDI-TOF MS; 細菌同定検査

本研究では、様々な菌種において持続的な細胞内での代謝不活性状態から生じる小型コロニー変種であり、様々な栄養素を要求する栄養要求性変異株の総称であるBacterial small-colony variants(SCVs)について、生化学的性状と必要としない菌種同定検査方法である質量分析計を用いた菌種同定の検討を行い、その有用性について検討を行った。本検討では、対象として2008年～2014年の間に臨床材料から分離されたStaphylococcus属、Enterococcus属、腸内細菌科のチミジン要求性菌29株、ヘミン要求性菌7株、オレイン酸要求性菌5株、CO_2ガス要求性菌3株菌計44株を用い、分子生物学的同定検査法と質量分析計を用いた同定検査を行い、その結果を比較した。本検討の結果、分子生物学的同定と質量分析計を用いた同定にて挙げられた菌名は全て一致した。しかしMALDI法での前処理をOn plate法で実施した場合、全て同定スコアが≧2.00となり菌種レベルでの同定となったが、エタノール・ギ酸抽出法によるオレイン酸要求性Staphylococcus epidermidisとヘミン要求性Staphylococcus capraeの同定スコアはそれぞれ平均1.83、1.91となり、挙げられた菌種は正しい結果であったものの属レベルでの同定と判定された。質量分析計を用いた同定でのエタノール・ギ酸抽出法にて同定スコアが若干低くなる菌株が見られたが、SCVsの菌種同定が可能と考えられた。SCVsは細胞内代謝が不活性な状態であるが、質量分析計を用いた同定におけるリボソーム蛋白を主とするマススペクトルパターンに影響を与えないと考えられた。質量分析計による細菌同定検査はSCVsの同定検査にも有用である。

In this study, the metabolically inactive state of the intracellular metabolic inactive state of the bacterial strains and the small bacteria were maintained Bacterial small-colony Variants (SCVs), biochemical properties, necessary bacterial strains, and prescriptions The quality analysis method of the method is the same as the bacterial strain and the determination of the usefulness of the bacteria. 29 strains of Staphylococcus genus, Enterococcus genus, Enterobacteriaceae and Enterobacteriaceae were isolated from 2008 to 2014 clinical materials from 2008 to 2014. , 7 strains of ヘミミン-requiring bacteria, 5 strains of オレイン acid-requiring bacteria, 3 strains of CO_2ガス-requiring bacteria, totaling 44 strains. The same determination method and mass spectrometer used in molecular biology are used to compare the results of the same determination examination. The results of this study, the identification and mass spectrometry of molecular biology, the identification and the name of the bacteria are all consistent.しかしMALDI methodでのPretreatmentをOn When the plate method is applied, all the same bacteria are determined and the same is determined ≧2.00なったが, エタノール・ギacid extraction method によるオレインacid-requiring Staphylococcus epidermidis とヘミンdemanding Staphylococcus capraeの同定スコアはそれぞれaverage1.83、1.91となり、挙げられた strain は正しい results であったもののgenre レベルでの同定とdetermination された. The quality analyzer is used in the same method as the acid extraction method and the acid extraction method is used. It is possible to use the same strains of SCVs as the low-dry strain and the strain. SCVs are in an inactive state due to intracellular metabolism and are used in mass spectrometers.リボソームproteinを主とするマススペクトルパターンに Impact を and えないと卡えられた. The quality analyzer is useful for bacteria and SCVs.