CGH法および染色体ペインティング法による培養細胞株の染色体再配列の解析

使用 CGH 方法和染色体涂色方法分析培养细胞系中的染色体重排

• 批准号: 09772075
• 负责人: 田辺 秀之
• 金额: $ 1.02万
• 依托单位: National Institute of Health Sciences
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1997
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1997 至 1998
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-09772075/
• 关键词: CGH法; 染色体; 培養細胞株; ゲノム解析; 核型分析

国立医薬品食品衛生研究所・細胞バンクの各種培養細胞株(計11種類:JCRB0085 llL60、JCRB0006 HL60RG、JCRB0622 HSC-2、 JCRB0034 RPMl8226、 JCRB0112.1′THP-1、JCRB0612 GOTOJCRB0621 NB-1、JCRB0710 EJ-1、JCRB0711 T24、JCRB0744 ECV304、JCRB0814 VMRC-LCD)(こついて平成9年度に検討した実験条件(SpectrumGreenとSpectrumRedの2色の蛍光色素を使用)に基づいて、CGH(Comparative Genomic Hybridization)法を行い、Qバンド法による核型分析データを踏まえたゲノムの増幅および欠失領域の特定を試みた。その結果、以下の点が新たに明らかになった。I.HL60およびその変異株HL60RGに関して:(1)HL60から派生したHL60RGには転座染色体der(11)t(11;13)(p13;q14)の生成に伴い11番染色体短腕の欠失領域が存在すること、(2)c-myc遺伝子の増幅率がHL60RGではHL60のl/3以下に減少しており、double minute染色体が観察されないこと、(3)18番染色体がIIL60では3本なのに対し、HL60RGでは2本に逆行変異していること。II.HSC-2およびRPMI8226に関して:constitutionalなdicentric染色体が存在すること(HSC-2:dic(10;17)(p15;13)、RPM18226:dic(1;14)(p13;q32))。III.G0T0およびNB-1に関して:(1)constitutiolmlに存在するIISRはN-myc遺伝子の増幅に由来すること、(2)マーカー染色体の由来がlq、8、10q、16番染色体に特定されたこと。IV.EJ-1、T24、ECV304に関して:(1)3細胞株の基本的々性状(染色体モード数81本)が共通していること、(2)3細胞株に共通なマーカー染色体der(6)t(6;?19)が存在すること、(3)3細胞株の16、17、19、20、22番染色体の増幅パターンが類似していること、(4)前記の(1)〜(3)より、3細胞株はT24を起源としたクロスカルチャーコンタミネーションを起こしている可能性が大きいこと。このようにCGHと核型分析のデータを組み合わせることによって、染色体再配列の総合的な解析を行うことが可能となり、現在、データ整理を進めている。

来自国家药品和食品卫生细胞库的各种培养的细胞系（总计11种类型：JCRB0085 LLL60，JCRB0006 HL60RG，JCRB0622 HSC-0622 HSC-2，JCRB0034 rpml8226 JCRB0711 T24，JCRB0744 ECV304，JCRB0814基于1997年检查的实验条件（Spectrumgreen和Spectrumred），我们进行了比较基因组杂交（CGH）方法，以放大基因组并根据Karyotyper的数据揭示了Q-BAND-BAND。源自HL60RG的HL60RG具有11个染色体的缺失区域，其产生的易位染色体der（11）t（11; 13）（p13; Q14），（2）C-Myc基因的扩增率已降低到HL60 rys的L/3或更少。 IIL60中的三个，而HL60RG中有2个有关HSC-2和RPMI8226的逆转。 iii。关于G0T0和NB-1：（1）constitutiolml中存在的IISR来自N-MYC基因的扩增。 ，（2）在IV.EJ-1，T24和ECV304上鉴定出标记染色体的起源。三个细胞系中的染色体16、17、19、20和22是相似的，（4）基于上述（1）至（3），这三个细胞系很可能受到T24起源的跨文化污染。通过以这种方式组合CGH和核型分析数据，可以对染色体重排进行全面分析，并且我们目前正在研究组织数据。