CGH法および染色体ペインティング法による培養細胞株の染色体再配列の解析

使用 CGH 方法和染色体涂色方法分析培养细胞系中的染色体重排

• 批准号: 09772075
• 负责人: 田辺 秀之
• 金额: $ 1.02万
• 依托单位: National Institute of Health Sciences
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1997
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1997 至 1998
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-09772075/
• 关键词: CGH法; 染色体; 培養細胞株; ゲノム解析; 核型分析

国立医薬品食品衛生研究所・細胞バンクの各種培養細胞株(計11種類:JCRB0085 llL60、JCRB0006 HL60RG、JCRB0622 HSC-2、 JCRB0034 RPMl8226、 JCRB0112.1′THP-1、JCRB0612 GOTOJCRB0621 NB-1、JCRB0710 EJ-1、JCRB0711 T24、JCRB0744 ECV304、JCRB0814 VMRC-LCD)(こついて平成9年度に検討した実験条件(SpectrumGreenとSpectrumRedの2色の蛍光色素を使用)に基づいて、CGH(Comparative Genomic Hybridization)法を行い、Qバンド法による核型分析データを踏まえたゲノムの増幅および欠失領域の特定を試みた。その結果、以下の点が新たに明らかになった。I.HL60およびその変異株HL60RGに関して:(1)HL60から派生したHL60RGには転座染色体der(11)t(11;13)(p13;q14)の生成に伴い11番染色体短腕の欠失領域が存在すること、(2)c-myc遺伝子の増幅率がHL60RGではHL60のl/3以下に減少しており、double minute染色体が観察されないこと、(3)18番染色体がIIL60では3本なのに対し、HL60RGでは2本に逆行変異していること。II.HSC-2およびRPMI8226に関して:constitutionalなdicentric染色体が存在すること(HSC-2:dic(10;17)(p15;13)、RPM18226:dic(1;14)(p13;q32))。III.G0T0およびNB-1に関して:(1)constitutiolmlに存在するIISRはN-myc遺伝子の増幅に由来すること、(2)マーカー染色体の由来がlq、8、10q、16番染色体に特定されたこと。IV.EJ-1、T24、ECV304に関して:(1)3細胞株の基本的々性状(染色体モード数81本)が共通していること、(2)3細胞株に共通なマーカー染色体der(6)t(6;?19)が存在すること、(3)3細胞株の16、17、19、20、22番染色体の増幅パターンが類似していること、(4)前記の(1)〜(3)より、3細胞株はT24を起源としたクロスカルチャーコンタミネーションを起こしている可能性が大きいこと。このようにCGHと核型分析のデータを組み合わせることによって、染色体再配列の総合的な解析を行うことが可能となり、現在、データ整理を進めている。

National Institute of Medicine, Food and Hygiene·Cell lines (11 types: JCRB 0085 llL 60, JCRB 0006 HL 60 RG, JCRB 0622 HSC-2, JCRB 0034 RPMl 8226, JCRB0112.1 ′ THP-1, JCRB 0612 GOTOJCRB 0621 NB-1, JCRB 0710 EJ-1, JCRB 0711 T24, JCRB 0744 ECV 304, JCRB 0814 VMRC-LCD)((Comparative Genomic Hybridization) method is used to analyze karyotypes. The results are as follows: I. HL60 is a variant of HL60 RG, and its related chromosomes are: (1) HL60 is a derivative of HL60 RG, and its chromosome der (11) t (11; 13)(p13; The frequency of c-myc gene amplification from HL60RG to HL60 decreased by less than 1/3. The frequency of c-myc gene amplification from HL60RG to HL60RG decreased by less than 1/3. The frequency of c-myc gene amplification from HL60RG to HL60 II. HSC-2: dic (10; 17)(p15; 13), RPM 18226: dic (1; 14)(p13; q32). III. G0T0 and NB-1 are related to: (1) the existence of IISR N-myc gene and its origin;(2) the origin of chromosome 1q, 8, 10q and 16. IV. EJ-1, T24, ECV304 are related to: (1) basic traits (chromosome number 81) of 3 cell lines are common;(2) chromosome number (6) t (6) t (6) t (6) 19) There is a high possibility that chromosome 16, 17, 19, 20, and 22 of 3 cell lines are similar in amplitude, and (4) there is a high possibility that chromosome 16, 17, 19, 20, and 22 of 3 cell lines are similar in amplitude, and (5) there is a high possibility that chromosome 16, 17, 19, 20, and 22 of 3 cell lines are similar in amplitude, and (6) there is a high possibility that chromosome 16, 17, 19, 20, and 22 of 3 cell lines are similar in amplitude, and (7) there is a high possibility that chromosome 16, 17, 19, 20, and 22 of 3 cell lines are similar in amplitude. CGH karyotype analysis, chromosome rearrangement, chromosome recombination, chromosome analysis, chromosome rearrangement, chromosome