CGH法および染色体ペインティング法による培養細胞株の染色体再配列の解析

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国立医薬品食品衛生研究所・細胞バンクの各種培養細胞株(計11種類:JCRB0085 llL60、JCRB0006 HL60RG、JCRB0622 HSC-2、 JCRB0034 RPMl8226、 JCRB0112.1′THP-1、JCRB0612 GOTOJCRB0621 NB-1、JCRB0710 EJ-1、JCRB0711 T24、JCRB0744 ECV304、JCRB0814 VMRC-LCD)(こついて平成9年度に検討した実験条件(SpectrumGreenとSpectrumRedの2色の蛍光色素を使用)に基づいて、CGH(Comparative Genomic Hybridization)法を行い、Qバンド法による核型分析データを踏まえたゲノムの増幅および欠失領域の特定を試みた。その結果、以下の点が新たに明らかになった。I.HL60およびその変異株HL60RGに関して:(1)HL60から派生したHL60RGには転座染色体der(11)t(11;13)(p13;q14)の生成に伴い11番染色体短腕の欠失領域が存在すること、(2)c-myc遺伝子の増幅率がHL60RGではHL60のl/3以下に減少しており、double minute染色体が観察されないこと、(3)18番染色体がIIL60では3本なのに対し、HL60RGでは2本に逆行変異していること。II.HSC-2およびRPMI8226に関して:constitutionalなdicentric染色体が存在すること(HSC-2:dic(10;17)(p15;13)、RPM18226:dic(1;14)(p13;q32))。III.G0T0およびNB-1に関して:(1)constitutiolmlに存在するIISRはN-myc遺伝子の増幅に由来すること、(2)マーカー染色体の由来がlq、8、10q、16番染色体に特定されたこと。IV.EJ-1、T24、ECV304に関して:(1)3細胞株の基本的々性状(染色体モード数81本)が共通していること、(2)3細胞株に共通なマーカー染色体der(6)t(6;?19)が存在すること、(3)3細胞株の16、17、19、20、22番染色体の増幅パターンが類似していること、(4)前記の(1)〜(3)より、3細胞株はT24を起源としたクロスカルチャーコンタミネーションを起こしている可能性が大きいこと。このようにCGHと核型分析のデータを組み合わせることによって、染色体再配列の総合的な解析を行うことが可能となり、現在、データ整理を進めている。