霊長類ゲノムにおける染色体テリトリーの核内配置解析による転座染色体生成機構の解明

通过分析灵长类基因组中染色体区域的核排列来阐明易位染色体产生的机制

基本信息

批准号：
17018014
负责人：
田辺秀之
金额：
$ 3.07万
依托单位：
The Graduate University for Advanced Studies
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究は、霊長類各種の染色体テリトリーの相対核内配置をゲノムワイドなスケールで調べることにより、進化的な染色体再編成により生じた転座染色体の生成機構がどのように制御されているのか、相対核内配置と種分化との関わりを「3次元核内環境」という視点から明らかにすることを目的とする。具体的には、ヒトの系統のみで染色体融合が生じたと考えられるヒト2番染色体と大型類人猿の2本のアクロセントリック染色体ホモログに着目して種間比較を行い、ヒト2番染色体の短腕(2p)および長腕(2q)領域をプローブとした3D-FISH法により相対核内配置を調べた。霊長類血液サンプルの収集は、京都大学霊長類研究所の共同利用研究を通じて実施し、以下の霊長類各種より、末梢血リンパ球の3D細胞核スライド標本を作製した。チンパンジー、アジルテナガザル、ニホンザル、カニクイザル、アカゲザル、タイワンザル、マントヒヒ、アフリカミドリザルの計8種。このうち、ヒト、チンパンジー、ニホンザルの3種において、ヒト2p、2q領域をプローブとした3D-FISH法を行い、各プローブの蛍光重心間の平均距離および染色体テリトリー表面間の最短距離を細胞核計測プログラムを用いて計測した。その結果、ニホンザルでは両ホモログが互いに近接している頻度は低いが、チンパンジーでは少なくとも一組のヒト2p、2qの両ホモログ同士が互いに高頻度に近接する結果となった。このことより、進化的な染色体再編成が生じている近縁種間での染色体ホモログ領域は、互いに相対核内配置が近接している傾向を示す可能性を持つものと考えられた。今後比較種類数を増やしてさらに検討を進める必要がある。また、生細胞における染色体テリトリーのダイナミクスを調べる目的で、ヒストンH2B-EGFPを発現させたアフリカミドリザル腎臓由来上皮系のVero細胞を作成し、生細胞蛍光観察条件の検討を行った。

这项研究旨在通过检查“三维核环境”的角度来阐明相对核的布置与物种形成之间的关系，通过检查各个基因组规模的各种灵长类动物的染色体领土的相对核排列。具体而言，我们比较了2人类染色体的两个族裔染色体同源物，它们被认为仅在人类线中具有染色体融合，以及两个巨大猿类的杂物染色体同源物，并使用短（2p）和长期（2p）和cromosome的3D-fish方法检查了相对核的位置，并使用3D-FISH方法进行了研究。通过在京都大学的灵长类动物研究所的联合使用研究中进行了灵长类动物样品的收集，并从以下灵长类动物中制备了外周血淋巴细胞的3D细胞核滑坡标本。有八种黑猩猩，azirite gibbons，日本猕猴，cynomolgus猴子，恒河猴，泰国猴子，披风的狒狒和非洲绿猴。其中，使用人2p和2q区域作为探针进行了3D-FISH方法，其中三种物种，人类，黑猩猩和日本猕猴进行了3D-Fish方法，并使用蜂窝核测量程序测量了每个探针的荧光重心与每个探针的荧光重心之间的平均距离。结果，尽管这两个同源物都在日本猕猴中彼此紧密，但至少一组人2p和2q同源物在黑猩猩中彼此彼此相近。这表明，进化染色体重排的紧密相关物种之间的染色体同源区域可能显示出具有紧密的相对核排列的趋势。有必要增加将来的可比类型数量，以进一步考虑结果。此外，为了研究活细胞中染色体区域的动力学，制备了来自表达组蛋白H2B-EGFP的非洲绿色猴子肾脏的肾细胞，并检查了观察活细胞荧光的条件。

项目成果

期刊论文数量（2）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Technical note. "Radial distribution of interphase chromosome territories in the human lymphocyte nucleus is highly correlated with their gene densities."

技术说明。

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
Cytologia 70
影响因子：
0
作者：
Hideyuki Tanabe;Katrin Kupper;Takafumi Ishida;Michaela Neusser;Hiroshi Mizusawa;Hideyuki Tanabe
通讯作者：
Hideyuki Tanabe