霊長類ゲノムにおける染色体テリトリーの核内配置解析による転座染色体生成機構の解明

通过分析灵长类基因组中染色体区域的核排列来阐明易位染色体产生的机制

• 批准号: 17018014
• 负责人: 田辺 秀之
• 金额: $ 3.07万
• 依托单位: The Graduate University for Advanced Studies
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17018014/
• 关键词: 染色体テリトリー; 相対核内配置; ゲノム進化; 転座染色体; 3D-FISH法; 霊長類; 生体分子; 蛍光観察

本研究は、霊長類各種の染色体テリトリーの相対核内配置をゲノムワイドなスケールで調べることにより、進化的な染色体再編成により生じた転座染色体の生成機構がどのように制御されているのか、相対核内配置と種分化との関わりを「3次元核内環境」という視点から明らかにすることを目的とする。具体的には、ヒトの系統のみで染色体融合が生じたと考えられるヒト2番染色体と大型類人猿の2本のアクロセントリック染色体ホモログに着目して種間比較を行い、ヒト2番染色体の短腕(2p)および長腕(2q)領域をプローブとした3D-FISH法により相対核内配置を調べた。霊長類血液サンプルの収集は、京都大学霊長類研究所の共同利用研究を通じて実施し、以下の霊長類各種より、末梢血リンパ球の3D細胞核スライド標本を作製した。チンパンジー、アジルテナガザル、ニホンザル、カニクイザル、アカゲザル、タイワンザル、マントヒヒ、アフリカミドリザルの計8種。このうち、ヒト、チンパンジー、ニホンザルの3種において、ヒト2p、2q領域をプローブとした3D-FISH法を行い、各プローブの蛍光重心間の平均距離および染色体テリトリー表面間の最短距離を細胞核計測プログラムを用いて計測した。その結果、ニホンザルでは両ホモログが互いに近接している頻度は低いが、チンパンジーでは少なくとも一組のヒト2p、2qの両ホモログ同士が互いに高頻度に近接する結果となった。このことより、進化的な染色体再編成が生じている近縁種間での染色体ホモログ領域は、互いに相対核内配置が近接している傾向を示す可能性を持つものと考えられた。今後比較種類数を増やしてさらに検討を進める必要がある。また、生細胞における染色体テリトリーのダイナミクスを調べる目的で、ヒストンH2B-EGFPを発現させたアフリカミドリザル腎臓由来上皮系のVero細胞を作成し、生細胞蛍光観察条件の検討を行った。

In this study, the relative nuclear allocation of various chromosomes in the long and short categories must be regulated and reorganized. The mechanism of chromosome generation in the long and short categories must be controlled. The relative nuclear allocation and differentiation must be related to the "three-dimensional nuclear environment" and the "viewpoint". In particular, chromosome fusion in the middle of the system was studied, and interspecific comparisons were made between the short arm (2p) and long arm (2q) regions of the two chromosomes. The collection of long blood cells and the joint utilization research of Kyoto University's Long Blood Research Institute have been carried out. The following long blood cells and 3D cell nuclear cells have been produced. There are 8 kinds of colors, such as color, color and color. 3D-FISH method was used to measure the average distance between the centers of gravity of each chromosome and the shortest distance between the surfaces of chromosomes. As a result, the frequency of contact is low, the frequency of contact is low, and the frequency of contact is low. As a result, the frequency of contact is high. The possibility of chromosome recombination between species is discussed. In the future, the number of comparison categories will increase. To investigate the conditions for the development of human chromosome and cell culture in Vero cells derived from epithelial cells.

项目成果

Inter- and intra-specific gene-density-correlated radial chromosome territory arrangements are conserved in Old World monkeys

• DOI: 10.1159/000080824
• 发表时间: 2005-01-01
• 期刊: CYTOGENETIC AND GENOME RESEARCH
• 影响因子: 1.7
• 作者: Tanabe, H;Küpper, K;Mizusawa, H
• 通讯作者: Mizusawa, H

Technical note. "Radial distribution of interphase chromosome territories in the human lymphocyte nucleus is highly correlated with their gene densities."

技术说明。

• 发表时间: 2005
• 期刊: Cytologia 70
• 作者: Hideyuki Tanabe;Katrin Kupper;Takafumi Ishida;Michaela Neusser;Hiroshi Mizusawa;Hideyuki Tanabe
• 通讯作者: Hideyuki Tanabe