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霊長類Y染色体における比較ゲノム解析

灵长类Y染色体的比较基因组分析

基本信息

批准号：
14654152
负责人：
黒木陽子
金额：
$ 2.18万
依托单位：
The Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至 2004
项目状态：
已结题

项目摘要

本年度は、霊長類ゲノムリソースの完備と、ヒトとチンパンジーを中心とした比較ゲノム解析研究を行った。研究成果は下記のとおりである。1.ゲノムリソースの完備として、ヒトY染色体特異的フォスミドライブラリー(YハプロタイプC型,10ゲノム分をカバー)を作製した。本研究費の補助を受けた3年間で、8種類の正常ヒトY染色体ハプロタイプ別フォスミドライブラリーの作製と各ライブラリーの3Dスクリーニングシステムの構築を完了した。また、他の研究課題の一貫として、ニホンザルとオランウータンのBACライブラリー作製を進行中であり、ヒト8個体におけるY染色体多型解析、ヒト以外にチンパンジー、オランウータン、ニホンザルを含む霊長類Y染色体の比較ゲノム解析研究を行う上での基盤を確立した。2.霊長類Y染色体比較ゲノム解析については、昨年度に引き続きチンパンジーY染色体のクローンマップ作製を行い、ヒトと比較的相同性が高い約10Mbの領域について精度の高いクローンマップの構築が完了した。またヒトとチンパンジーで保存性の低い領域、つまり種間で多様性の高い領域については、領域特異的塩基置換解析法を用いて、詳細なクローンマップを作製中である。高精度なクローンマップが完成している10Mbの領域について、我々の研究室と韓国の研究チームの共同で、チンパンジーY染色体ゲノムシークエンスプロジェクトが行なわれており、クローンマップと並行し、塩基配列レベルでの比較解析研究も進んでいる。シーケンスを行なっているチンパンジーの10Mbの領域は、塩基配列のレベルではある程度の相同性を示すが、その領域には少なくとも15箇所の染色体再構成部位が存在し、染色体レベルで構造が大きく異なっていることが明らかになった。これらの染色体再構成部位について、他の霊長類における構造を調べ、霊長類におけるY染色体の系譜を明らかにしたいと考えている。

This year's ゲノムリソースのcomplete と, ヒトとチンパンジーをcenter とした comparative ゲノムanalytical research を行った. The research results are recorded below. 1.ゲノムリソースの全として、ヒトY chromosome specificフォスミドライブラリー(YハプロタイプC type, 10ゲノム分をカバー) is made by した. The subsidy for this research fee is provided for 3 years, and 8 types of normal Y-chromosome testing are carried out.ライブラリーのproducedとeachライブラリーの3Dスクリーニングシステムのconstructedをcompletedした.また、His research topicの consistentとして、ニホンザルとオランウータンのB AC ライブラリー is being produced. であり, ヒト8 individuals, におけるY chromosomes are many Type analysis, ヒトンパンジー, オランウータン, ニホンザルをcontaining Comparative analysis of Y-chromosome-like chromosomes has led to the establishment of the basic basis of the analysis. 2. Comparative analysis of the Y-chromosome of the same species The similarity between the manufacturing line and the ヒトと is high, the field is about 10Mb, and the precision is high, and the construction is completed. The field of low preservationability of またヒトとチンパンジーで, and the field of high diversification of つまりては, domain-specific hydroxyl substitution analysis method いて, detailed なクローンマップを中である. High-precision なクローンマップがComplete 10Mb field について, my laboratory and Korean research laboratory jointly, チンパンジーY dyeing Body type Comparative analytical study of parallel and radial configurations of the MACHNOLOGY series.シーケンスを行なっているチンパンジーの10Mbの区は, the same degree of homogeneity of the base arrangement is shown in the field of すが and そのには小なくとも15箇sho's chromosomal reconstruction part がexistent し, chromosomal レベルでstructure が大きくdifferent なっていることが明らかになった.これらのchromosome reconstruction part について, his の霊长similar におけるstructure を声べ, 霊length type におけるY chromosome のgenealogyを明らかにしたいと考えている.