霊長類における染色体特異的反復配列とゲノム多様性・進化に関する研究

灵长类染色体特异性重复序列、基因组多样性和进化研究

• 批准号: 17018040
• 负责人: 黒木 陽子
• 金额: $ 2.69万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17018040/
• 关键词: Y染色体; 比較ゲノム解析; パリンドローム構造; ゲノム構造解析; 塩基配列決定; ゲノム進化; 反復配列; オリゴチップ

本研究では、ヒトゲノムにおいて重複と欠失が最も多く認められるY染色体をモデルとして、ゲノムの重複・欠失領域の同定、その周辺領域の構造解析、異なる生物間での比較ゲノム解析を行い、ゲノムの重複・欠失に関わる構造上の特性を見出すこと、個体間・異なる生物間における多様性と表現型との関連、Y染色体上で見られる重複領域の進化を明らかにすることを目的として解析を行った。ヒトY染色体の詳細なゲノム構造解析を目指し、Y染色体オリゴチップを用いたアレイCGH解析を行った。ゲノムのコピー数を同定する実験系を確立することに手間取っており、現在、解析条件を検討しているところである。アレイCGH解析と並行してチンパンジーY染色体の配列決定を行い、ヒト-チンパンジーにおける比較ゲノム解析を行った。これまでに、チンパンジーY染色体の約12.7Mbの領域の高精度塩基配列決定を終了し、その領域に位置するゲノム重複領域、種特異的な反復配列の種類とその分布について解析を行った。その結果、配列決定を行った12.7Mbの領域には、パリンドローム構造を示すゲノム重複領域が4箇所存在し(P6+,P7,P8,CSP1)、そのうちの2箇所、P6+とCSP1についてはヒトとチンパンジーでゲノム構造が大きく異なっていることが明らかになった。P6+領城では、ヒトとチンパンジーで同様な構造を示したが、パリンドローム領域の大きさが異なっていた。また、CSP1は、チンパンジー特異的なパリンドローム構造で、この領域の塩基配列はヒトY染色体の配列データと85-98%の断続的な相同性を示した。ヒトとチンパンジーで認められたパリンドローム構造の相違は、約500万年もの間、Y染色体のゲノム構造がパリンドローム構造を形成するという共通な性質を保持しながら、種特異的な様式でパリンドロームの構造変化を繰り返していることを示唆するものである。

In this study, we analyzed the characteristics of Y chromosome, Y chromosome, domain, field, biological and biological properties in this study. in this study, in this study, the results of this study are as follows: in this study, the results of this study are as follows: in this study, the results of this study are as follows: in this study, the results of this study are as follows: in this study, the results of this study are as follows: 1. There are multiple sex table markers in individuals and Y chromosomes in different organisms. The purpose of this study is to analyze the data in the field of genetic analysis. The purpose of this study is to analyze the data of Y chromosome and Y chromosome, and to analyze the lines of Y chromosome by CGH. Please make sure that you have to make sure that you do not want to use your hand to get your information. Now, you can analyze the conditions. The configuration of the Y chromosome is determined by the parallel analysis of the CGH. In the field of 12.7Mb, the high-precision base alignment determines the location in the field, the location in the field, the weight in the field, the anti-alignment distribution in the field and the analysis of the distribution in the field. According to the results, the configuration determines that you need to know that the 12.7Mb domain exists in the same area (p6p7, p8csp1), and that P6 + CSP1

项目成果

Comparative analysis of chimpanzee and human Y chromosomes unveils complex evolutionary pathway

• DOI: 10.1038/ng1729
• 发表时间: 2006-02-01
• 期刊: NATURE GENETICS
• 影响因子: 30.8
• 作者: Kuroki, Y;Toyoda, A;Fujiyama, A
• 通讯作者: Fujiyama, A