哺乳類Y染色体の多様性と普遍性-ゲノム構造から見る性染色体の機能とその進化-

哺乳动物Y染色体的多样性和普遍性-从基因组结构角度探讨性染色体的功能及其进化-

• 批准号: 18017026
• 负责人: 黒木 陽子
• 金额: $ 4.48万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18017026/
• 关键词: Y染色体; 比較ゲノム解析; ゲノム進化; クローン地図; 性染色体; オランウータン; STSマッピング

本研究では、Y染色体のゲノム進化の様相と染色体機能の関連性を明らかにすることを目指して、哺乳類の性染色体の比較ゲノム解析を行った。ヒトとチンパンジーよりも生物進化上、距離の離れた7種の哺乳類について、X-degenerate region, Y-ampliconic region, X-degenerate regionに対応するX染色体領域の3領域についてゲノム構造解析を行なった。解析対象生物7種の哺乳類のうち、オランウータン、ニホンザルについては、Y染色体由来のBACクローンを単離し、クローン地図の作成を進めた。イヌについては、Y染色体上のX-degenerate regionに位置する3つのBACクローンの高精度配列決定を行ったが、その結果、3つの遺伝子ZFY、DDX3Y、USP9Yの存在が明らかになった。これら3つの遺伝子領域のゲノム配列と、既に公共データベースに登録されていたヒト、チンパンジー、マウス、ラットのcDNA配列を用いて遺伝子領域の相同性検索を行なったところ、DDX3Y、USP9Yは種内における性染色体間(X-Y)における配列相同性よりも異なる生物種間(X-X,Y-Y)の配列相同性が高かったが、ZFYについては異なる生物種間(X-X,Y-Y)よりも種内における性染色体間(X-Y)の相同性が高く、この遺伝子を含むゲノム領域において、進化の過程で性染色体間のGene conversionが起こったことが示唆された。今後、これらの領域を対象に、他の生物種についても詳細なゲノム構造決定を進め、X-degenerate regionのゲノム進化の様相を明らかにするとともに、これらの遺伝子が関与する表現型や性染色体機能と遺伝子構造、ゲノム構造の関連性を明らかにしたいと考えている。

This study で は, Y chromosome の ゲ ノ ム evolution の others in phase と chromosome function の masato even sex を Ming ら か に す る こ と を refers し て, mammals の sex chromosome の is ゲ ノ ム parsing line を っ た. ヒ ト と チ ン パ ン ジ ー よ り も, distance の in biological evolution from れ た seven の mammals に つ い て, X - degenerate region, Y - ampliconic region, X-ray degenerate region に 応 seaborne す る in の 3 X chromosome に つ い て ゲ ノ ム structure line を な っ た. Parsing biological 7 kinds of seaborne の mammals の う ち, オ ラ ン ウ ー タ ン, ニ ホ ン ザ ル に つ い て は の BAC of the origins, the Y chromosome ク ロ ー ン を 単 し, ク ロ ー ン to 図 の made を into め た. イ ヌ に つ い て は, Y chromosome の X-ray degenerate region に position す る 3 つ の BAC ク ロ ー ン の high precision line arrangement decided を っ た が, そ の results, 3 つ の heritage 伝 ZFY, DDX3Y, USP9Y の is が Ming ら か に な っ た. こ れ ら 3 つ の heritage 伝 sub-fields の ゲ ノ ム column と, both に public デ ー タ ベ ー ス に login さ れ て い た ヒ ト, チ ン パ ン ジ ー, マ ウ ス, ラ ッ ト の cDNA matched with column を い て heritage 伝 sub-fields の identity 検 cable line を な っ た と こ ろ, DDX3Y, USP9Y は intraspecific に お け る sex chromosomes (x-y) between に お け る column Gay よ り も different な る biological species (X - X, Y, Y) の with high column of gay が か っ た が, ZFY に つ い て は different な る biological species (X - X, Y, Y) よ り も intraspecific に お け る sex chromosomes (x-y) between の identity が く, こ の heritage 伝 son を containing む ゲ ノ ム field に お い で の て, evolution process between the sex chromosomes の Gene The conversionが starts with った とが とが indicates された. In the future, こ れ ら を の field like に, he の biological kind of seaborne に つ い て も detailed な ゲ ノ ム structure decision を into め, X - degenerate Phase region の ゲ ノ ム evolution の others を Ming ら か に す る と と も に, こ れ ら の heritage 伝 son が masato and す る phenotype や sex chromosome function と heritage 伝 structure, ゲ ノ ム tectonic の masato even sex を Ming ら か に し た い と exam え て い る.

项目成果

ヒトとチンパンジーのY染色体比較解析から見出された雄特有のゲノム進化

通过对人类和黑猩猩 Y 染色体的比较分析发现男性特有基因组的进化

• 发表时间: 2006
• 期刊: 医学のあゆみ 218・3
• 作者: 黒木陽子;藤山秋佐夫
• 通讯作者: 藤山秋佐夫

ヒトーチンプY染色体の常染色体よりも速い進化

人类黑猩猩 Y 染色体的进化速度比常染色体更快

• 发表时间: 2007
• 期刊: 生物の科学 遺伝 別冊 20
• 作者: 黒木陽子;藤山秋佐夫
• 通讯作者: 藤山秋佐夫

Reply to "Has the chimpanzee Y chromosome been sequenced?"

回复“黑猩猩Y染色体测序了吗？”

• 发表时间: 2006
• 期刊: Nature Genetics 38
• 作者: Yoko Kuroki;et al.
• 通讯作者: et al.

雄特有なゲノム進化の解明を目指した哺乳類性染色体の比較ゲノム解析

哺乳动物染色体的比较基因组分析旨在阐明男性特异性基因组进化

• 发表时间: 2007
• 作者: 黒木陽子;藤山秋佐夫;黒木陽子
• 通讯作者: 黒木陽子