染色体サブテロメア領域の多様性と進化に関する基礎的研究

染色体亚端粒区域多样性与进化的基础研究

基本信息

项目摘要

本研究では、霊長類のサブテロメア領域の比較ゲノム解析を行い、種間で保存された領域と種特異的な領域を識別し、それぞれの領域に位置する遺伝子の同定、遺伝子と表現型との関連性を明らかにすることを目的として研究を行なった。本年度は、昨年度に引き続き、ヒトとチンパンジーの比較解析、特に、チンパンジーのサブテロメア領域の詳細な解析を行った。昨年度の解析から、チンパンジー21番染色体のサブテロメア領域の構造は、ヒトに比べて160kbほど長いことが明らかになっていた。そこで、チンパンジーで拡張している領域のゲノム配列を用いて相同性検索を行ったところ、ヒトの9番、10番、2番染色体の一部と高い相同性を示すことがわかった。さらに、この領域の配列の反復配列の分布を調べたところ、SINEやLINEなどのレトロトランスポゾン由来の散在性反復配列に加え、様々な種類のサテライトリピートの存在が明らかになった。また、チンパンジーで拡張した160kbの領域における、遺伝子の有無を明らかにするため、この領域のゲノム配列を用いてアノテーションを行ったところ、ヒトの糖鎖転移酵素をコードする遺伝子と相同性を示す領域を見出した。この遺伝子が、チンパンジーにおいて発現しているかどうかを明らかにするため、チンパンジー由来の培養リンパ芽球からmRNAを抽出し、 RT-PCRにより発現性を調べた。その結果、PCR産物が得られ、チンパンジーのリンパ球において、ヒトの糖鎖転移酵素ホモログが発現していることが示唆された。本研究から、チンパンジーサブテロア領域に見いだされた糖鎖転移酵素遺伝子ホモログが、ヒトとチンパンジーの表現型の相違に関与している可能性が明らかになり、この遺伝子の機能解析を進めることにより、サブテロメア領域に位置する遺伝子のヒトとチンパンジーそれぞれに及ぼす分子遺伝学的な意味づけができると期待される。
This study で は, long 霊 class の サ ブ テ ロ メ の ア field comparative ゲ ノ ム parsing を い, interspecific で save さ れ た areas と kind of specific な を identification し, そ れ ぞ れ に の field position す る posthumous son 伝 の with fixed, but 伝 と phenotype と の masato even sex を Ming ら か に す る こ と を purpose と し て を line な っ た. This year's annual に は, yesterday led き 続 き, ヒ ト と チ ン パ ン ジ ー の is parsing, に, チ ン パ ン ジ ー の サ ブ テ ロ メ の ア field detailed analytical line を っ な た. Yesterday's annual の parsing か ら, チ ン パ ン ジ ー's chromosome 21 の サ ブ テ ロ メ の ア field tectonic は, ヒ ト に than べ て 160 KB ほ ど long い こ と が Ming ら か に な っ て い た. そ こ で, チ ン パ ン ジ ー で company, zhang し て い る field の ゲ ノ ム matched with column を い gay 検 rope line を っ て phase た と こ ろ, ヒ ト の 9 times, ten times, 2 times a chromosome の gay を and shown a high と い phase す こ と が わ か っ た. の さ ら に, こ の field match column の repeatedly with column の distribution を adjustable べ た と こ ろ, going や LINE な ど の レ ト ロ ト ラ ン ス ポ ゾ ン origin の scattered in the sexual repeatedly with column に え, others 々 な kinds の サ テ ラ イ ト リ ピ ー ト の is が Ming ら か に な っ た. ま た, チ ン パ ン ジ ー で company, zhang し た 160 KB の field に お け る, but 伝 の presence of を Ming ら か に す る た め, こ の field の ゲ ノ ム matched with column を い て ア ノ テ ー シ ョ ン を line っ た と こ ろ, ヒ ト の sugar lock planning shift enzyme を コ ー ド す る posthumous son 伝 と identity を を す in field show the し た. こ の heritage 伝 が, チ ン パ ン ジ ー に お い て 発 now し て い る か ど う か を Ming ら か に す る た め, チ ン パ ン ジ ー origin の cultivate リ ン パ gemmule か ら mRNA を spare し, rt-pcr に よ り 発 now sex を adjustable べ た. そ の が results, PCR products have ら れ, チ ン パ ン ジ ー の リ ン パ ball に お い て, ヒ ト の sugar lock planning shift enzyme ホ モ ロ グ が 発 now し て い る こ と が in stopping さ れ た. This study か ら, チ ン パ ン ジ ー サ ブ テ ロ ア field に see い だ さ れ た sugar lock heritage planning shift enzyme 伝 son ホ モ ロ グ が, ヒ ト と チ ン パ ン ジ ー の phenotype の conceives に masato and し て い る possibility が Ming ら か に な り, こ の posthumous son 伝 の function analytical を into め る こ と に よ り, サ ブ テ ロ メ に ア field position す る heritage 伝 son の ヒ ト と チ ン パ ン ジ The な implications of それぞれに それぞれに and ぼす molecular heritage 伝 are づけがで ると ると expect される.

项目成果

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Reply to "Has the chimpanzee Y chromosome been sequenced?"
回复“黑猩猩Y染色体测序了吗?”
  • DOI:
  • 发表时间:
    2006
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yoko Kuroki;et al.
  • 通讯作者:
    et al.
霊長類サブテロメア領域のゲノム多様性解析
灵长类亚端粒区域的基因组多样性分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    黒木陽子;藤山秋佐夫;黒木 陽子
  • 通讯作者:
    黒木 陽子
ヒトとチンパンジーのY染色体比較解析から見出された雄特有のゲノム進化
通过对人类和黑猩猩 Y 染色体的比较分析发现男性特有基因组的进化
  • DOI:
  • 发表时间:
    2006
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    黒木陽子;藤山秋佐夫
  • 通讯作者:
    藤山秋佐夫
Comparative Analysis of Chromosome 21 Subtelomeric Regions Between Human and Chimpanzee
人类与黑猩猩21号染色体亚端粒区的比较分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Noguchi;H.;Fujiyama;A.;and 4 authors
  • 通讯作者:
    and 4 authors
ヒトーチンプY染色体の常染色体よりも速い進化
人类黑猩猩 Y 染色体的进化速度比常染色体更快
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蛋白質核酸酵素(ヒトゲノム配列決定の内容と意義、ヒトとチンパンジーの比較ゲノム, 50)
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  • DOI:
  • 发表时间:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    藤山 秋佐夫
第一期IRUD (希少・未診断疾患イニシアチブ) 統計と今後
第一阶段 IRUD(罕见和未确诊疾病倡议)统计和未来
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    要 匡;柳 久美子;磯 まなみ;小林 奈々;阿部 幸美;竹下 芽衣子;黒木 陽子;林 恵子;岡村 浩司;緒方-川田 広子;河合 智子;中林 一彦;秦 健一郎;小崎 健次郎;佐藤 万仁;松原 洋一
  • 通讯作者:
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  • DOI:
  • 发表时间:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    足立 直樹;十時 泰;豊田 敦;辰本 将司;黒木 陽子;末水 洋志;佐々木 えりか;玉置 憲一;佐竹 正延;岡野 栄之;垣生 園子;榊 佳之
  • 通讯作者:
    榊 佳之
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MISHIMA - 一种针对细菌基因组大小的大量序列快速构建多重比对的新方法。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    黒木 陽子;野口 英樹;豊田 敦;藤山 秋佐夫;Y.Murata;Saitou N.
  • 通讯作者:
    Saitou N.
Y染色体に常染色体が融合したオキナワトゲネズミにおけるY連鎖遺伝子の重複と機能保持
常染色体与 Y 染色体融合的冲绳多刺大鼠中 Y 连锁基因的复制和功能保存
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    村田 知慧;黒木 陽子;井本 逸勢;黒岩 麻里
  • 通讯作者:
    黒岩 麻里

黒木 陽子的其他文献

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