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溶液中タンパク質におけるtrough-bond電子移動経路の定量的評価方法の構築

溶液中蛋白质槽键电子传递途径定量评价方法的构建

基本信息

批准号：
16655009
负责人：
青木百合子
金额：
$ 2.37万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2006
项目状态：
已结题

项目摘要

以前より当研究室で開発してきた高分子の理論的重合法(Elongation)を、非経験的分子軌道法のレベルで実用化できるよう発展させ、現在プログラムGAMESSに組み込み世界中に公開した。さらなる発展として、非経験的MO法のレベルで分子内軌道相互作用および分子間軌道相互作用の定量的解析のためのab initio Through Space/Bond(TS/TB)解析法をもとにElongation-LMO-NBO based Through Space/Bond相互作用解析法(ELN-TS/TB法)を発展させている。この新しいバージョンにPCM法を導入し、水やベンゼン溶媒中におけるオリゴチオフェンの電子状態をElongation法と組み合わせて計算できるように開発した。得られた全エネルギーは、従来法による全系に対する結果と10^<-9>a.u./atomの誤差で一致することを確認し、タンパク質における協同現象や電子移動反応の解析が可能となる段階にある。現在DNAへの適用も行ない、非常に高い精度で電子状態が得られることがわかっているため、さらに溶媒効果を導入することによりより現実的な系への適用に進んでいる。さらなる実用化を図るために、超効率的2電子積分の高速化のためのQFFM法の導入も検討し、AO-cut法を利用しなければ実行可能な状態になっている。一方、電場のもとでの高分子の電子状態変化を計算できるように完成し、種々のオリゴマー系への適用をおこなった。タンパク質のみならず、高分子の非線形現象が扱えるように電場の影響のもとでのThrough Space/Bond相互作用解析が可能となるように、Fock演算子に電場のハミルトニアンを加えた状態で解析するための方法を開発中した。NLO材料設計のためにab initio Through Space/Bond(TS/TB)解析法を適用した結果は現在投稿中である。

In the past, the laboratory started the Elongation method of polymer theory, the molecular channel method, the chemical method, and the exhibition, and now it is open to the public in the world of GAMESS. The quantitative analysis of intramolecular channel interaction, intermolecular channel interaction and intermolecular channel interaction was studied by MO method and non-linear MO method. The analytical method of Elongation-LMO-NBO based Through Space/Bond interaction (ELN-TS/TB method) was used to analyze the quantitative analysis of intermolecular channel interaction. The new PCM method has been introduced into the system, and the computer state Elongation method has been used to calculate the temperature and temperature in the aqueous solution. The results show that the full range of information is available. The results of the whole series of tests are 10 ^ & lt;-9>a.u./atom. The results are consistent with the results of the confirmation and coordination with the computer anti-jamming analysis system. At present, in the DNA system, the precision of the system is very high, and the solvent is used in the system that is used in the system. The use of high-speed transmission equipment, high-speed transmission equipment, high-speed equipment, high-speed transmission, high-speed, high-speed, high-speed On the one hand, the computer market is responsible for the calculation of polymer electronics, the completion of the computer, and the use of the electronic equipment for all kinds of equipment. It is possible to analyze the interaction between the computer field and the Through Space/Bond, and the Fock operator is in the process of analyzing the interaction between the computer field and the computer. NLO material Design Analysis ab initio Through Space/Bond (TS/TB) Analytical methods the results of the simulation results are now being reviewed in contributions.

项目成果

期刊论文数量（37）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Anaytical Method for Predicting Ferromagnetic Properties of Benzyl-Radical Polymers Based on NBMO Theory

基于NBMO理论预测苄基聚合物铁磁性能的分析方法

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
J.Chem.Theory Comput. (in press)
影响因子：
0
作者：
M.Makowski;et al.;Y.Orimoto;Y.Orimoto et al.
通讯作者：
Y.Orimoto et al.

Nonlinear Optical Properties of Alkalides Li+(calix[4]pyrrole)M-(M=Li,Na and Kl) : Alkali Anion Atomic Number Dependence

碱金属化合物 Li (calix[4]pyrrole)M-(M=Li,Na 和 Kl) 的非线性光学性质：碱金属阴离子原子序数依赖性

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
J.Am.Chem.Soc.Communication 128
影响因子：
0
作者：
W.Chen et al.
通讯作者：
W.Chen et al.

Ab initio MO study on [3+2] annulation using β-phenylthio-acryloysilanes with alkyl methyl ketone enolates and its through-space/bond interaction analysis

β-苯硫基丙烯酰硅烷与烷基甲基酮烯醇化物[3+2]成环的从头MO研究及其空间/键相互作用分析

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
Org.Biomol.Chem 3
影响因子：
0
作者：
M.Makowski;et al.;Y.Orimoto;Y.Orimoto et al.;Y.Orimoto et al.;Y.Orimoto et al.;Y.Orimoto et al.
通讯作者：
Y.Orimoto et al.

NBO-Based CI/MP Through-Space/Bond Interaction Analysis and its Application to Stereoelectronic Effects in SN2 Reactions

基于 NBO 的 CI/MP 空间/键相互作用分析及其在 SN2 反应立体电子效应中的应用

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
Int.J.Quantum Chem. 104
影响因子：
0
作者：
M.Makowski;et al.;Y.Orimoto;Y.Orimoto et al.;Y.Orimoto et al.;Y.Orimoto et al.;Y.Orimoto et al.;J.Korchowiec et al.;Y.Orimoto et al.
通讯作者：
Y.Orimoto et al.

Elongation Method for Polymers and its Application to Nonlinear Optics, in Atoms, Molecules and Clusters in Electric Fields : Theoretical Approaches to the Calculation of Electric Polarizabilities, edited by G. Maroulis, Vol. 1

聚合物的伸长方法及其在非线性光学中的应用，在电场中的原子、分子和团簇中：计算电极化率的理论方法，由 G. Maroulis 编辑，卷。