溶液中タンパク質におけるtrough-bond電子移動経路の定量的評価方法の構築
溶液中タンパク質におけるtrough-bond電子移動経路の定量的評価方法の構築
批准号:
16655009
负责人:
青木 百合子
金额:
$2.37万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 2006
中文摘要
以前より当研究室で開発してきた高分子の理論的重合法(Elongation)を、非経験的分子軌道法のレベルで実用化できるよう発展させ、現在プログラムGAMESSに組み込み世界中に公開した。さらなる発展として、非経験的MO法のレベルで分子内軌道相互作用および分子間軌道相互作用の定量的解析のためのab initio Through Space/Bond(TS/TB)解析法をもとにElongation-LMO-NBO based Through Space/Bond相互作用解析法(ELN-TS/TB法)を発展させている。この新しいバージョンにPCM法を導入し、水やベンゼン溶媒中におけるオリゴチオフェンの電子状態をElongation法と組み合わせて計算できるように開発した。得られた全エネルギーは、従来法による全系に対する結果と10^<-9>a.u./atomの誤差で一致することを確認し、タンパク質における協同現象や電子移動反応の解析が可能となる段階にある。現在DNAへの適用も行ない、非常に高い精度で電子状態が得られることがわかっているため、さらに溶媒効果を導入することによりより現実的な系への適用に進んでいる。さらなる実用化を図るために、超効率的2電子積分の高速化のためのQFFM法の導入も検討し、AO-cut法を利用しなければ実行可能な状態になっている。一方、電場のもとでの高分子の電子状態変化を計算できるように完成し、種々のオリゴマー系への適用をおこなった。タンパク質のみならず、高分子の非線形現象が扱えるように電場の影響のもとでのThrough Space/Bond相互作用解析が可能となるように、Fock演算子に電場のハミルトニアンを加えた状態で解析するための方法を開発中した。NLO材料設計のためにab initio Through Space/Bond(TS/TB)解析法を適用した結果は現在投稿中である。
英文摘要
以前より当研究室で開発してきた高分子の理論的重合法(Elongation)を、非経験的分子軌道法のレベルで実用化できるよう発展させ、現在プログラムGAMESSに組み込み世界中に公開した。さらなる発展として、非経験的MO法のレベルで分子内軌道相互作用および分子間軌道相互作用の定量的解析のためのab initio Through Space/Bond(TS/TB)解析法をもとにElongation-LMO-NBO based Through Space/Bond相互作用解析法(ELN-TS/TB法)を発展させている。この新しいバージョンにPCM法を導入し、水やベンゼン溶媒中におけるオリゴチオフェンの電子状態をElongation法と組み合わせて計算できるように開発した。得られた全エネルギーは、従来法による全系に対する結果と10^<-9>a.u./atomの誤差で一致することを確認し、タンパク質における協同現象や電子移動反応の解析が可能となる段階にある。現在DNAへの適用も行ない、非常に高い精度で電子状態が得られることがわかっているため、さらに溶媒効果を導入することによりより現実的な系への適用に進んでいる。さらなる実用化を図るために、超効率的2電子積分の高速化のためのQFFM法の導入も検討し、AO-cut法を利用しなければ実行可能な状態になっている。一方、電場のもとでの高分子の電子状態変化を計算できるように完成し、種々のオリゴマー系への適用をおこなった。タンパク質のみならず、高分子の非線形現象が扱えるように電場の影響のもとでのThrough Space/Bond相互作用解析が可能となるように、Fock演算子に電場のハミルトニアンを加えた状態で解析するための方法を開発中した。NLO材料設計のためにab initio Through Space/Bond(TS/TB)解析法を適用した結果は現在投稿中である。
期刊论文(37)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
登录
查看更多内容
Anaytical Method for Predicting Ferromagnetic Properties of Benzyl-Radical Polymers Based on NBMO Theory
基于NBMO理论预测苄基聚合物铁磁性能的分析方法
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
J.Chem.Theory Comput. (in press)
影响因子:
--
作者:
[M.Makowski, et al., Y.Orimoto, Y.Orimoto et al.]
通讯作者:
Y.Orimoto et al.
Nonlinear Optical Properties of Alkalides Li+(calix[4]pyrrole)M-(M=Li,Na and Kl) : Alkali Anion Atomic Number Dependence
碱金属化合物 Li (calix[4]pyrrole)M-(M=Li,Na 和 Kl) 的非线性光学性质:碱金属阴离子原子序数依赖性
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
J.Am.Chem.Soc.Communication 128
影响因子:
--
作者:
[W.Chen et al.]
通讯作者:
W.Chen et al.
Ab initio MO study on [3+2] annulation using β-phenylthio-acryloysilanes with alkyl methyl ketone enolates and its through-space/bond interaction analysis
β-苯硫基丙烯酰硅烷与烷基甲基酮烯醇化物[3+2]成环的从头MO研究及其空间/键相互作用分析
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Org.Biomol.Chem 3
影响因子:
--
作者:
[M.Makowski, et al., Y.Orimoto, Y.Orimoto et al., Y.Orimoto et al., Y.Orimoto et al., Y.Orimoto et al.]
通讯作者:
Y.Orimoto et al.
NBO-Based CI/MP Through-Space/Bond Interaction Analysis and its Application to Stereoelectronic Effects in SN2 Reactions
基于 NBO 的 CI/MP 空间/键相互作用分析及其在 SN2 反应立体电子效应中的应用
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Int.J.Quantum Chem. 104
影响因子:
--
作者:
[M.Makowski, et al., Y.Orimoto, Y.Orimoto et al., Y.Orimoto et al., Y.Orimoto et al., Y.Orimoto et al., J.Korchowiec et al., Y.Orimoto et al.]
通讯作者:
Y.Orimoto et al.
DOI:
10.1063/1.1812736
发表时间:
2004-12-01
期刊:
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS
影响因子:
4.4
作者:
[Gu, FL, Aoki, Y, Kirtman, B]
通讯作者:
Kirtman, B
共 16 条
機能性高分子材料設計のためのミクロ~メソ・マルチスケール量子シミュレータの開発
-
批准号:20H00588
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
-
资助金额:$29.04万
-
财政年份:2020
-
负责人:青木 百合子
-
依托单位:
DNA複製機構解析のためのモンテカルロElongation最適化ハイブリッド法
-
批准号:13F03028
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$0.77万
-
财政年份:2013
-
负责人:青木 百合子
-
依托单位:
生体反応機構および協同現象解明のための大規模系局所振動解析の開発
-
批准号:13F03331
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$1.54万
-
财政年份:2013
-
负责人:青木 百合子
-
依托单位:
フラーレン・ナノチューブ系ナノワイヤデバイスの超効率的理論設計法とその応用
-
批准号:09F09239
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$1.54万
-
财政年份:2009
-
负责人:青木 百合子
-
依托单位:
大規模系の非線形光学材料設計のための時間依存Hartree-Fockアプローチ
-
批准号:07F07051
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$1.41万
-
财政年份:2007
-
负责人:青木 百合子
-
依托单位:
擬一次元混合原子価金属錯体の有機無機複合化による新規機能性発現の理論的研究
-
批准号:07F07340
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$1.47万
-
财政年份:2007
-
负责人:青木 百合子
-
依托单位:
分子性固体の光物性予測のためのオーダーN量子分子動力学法の開発
-
批准号:06F06065
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$1.66万
-
财政年份:2006
-
负责人:青木 百合子
-
依托单位:
超効率的超分極率計算方法の開発と周期性および非周期性巨大ナノ系への応用
-
批准号:06F06340
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$1.92万
-
财政年份:2006
-
负责人:青木 百合子
-
依托单位:
ナノ系の化学反応性と電子構造に関する量子化学的方法論の開発と応用
-
批准号:04F04812
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$1.54万
-
财政年份:2004
-
负责人:青木 百合子
-
依托单位:
分子・高分子・固体の非線形光学特性
-
批准号:01F00763
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$0.51万
-
财政年份:2001
-
负责人:青木 百合子
-
依托单位:
有機強磁性高分子設計のための電子状態重合法の開発
-
批准号:09740525
-
项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
-
资助金额:$1.54万
-
财政年份:1997
-
负责人:青木 百合子
-
依托单位:
ランダム高分子の機能・物性予測のための電子状態重合法の開発
-
批准号:08740548
-
项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
-
资助金额:$0.64万
-
财政年份:1996
-
负责人:青木 百合子
-
依托单位:
周期性及び非周期性高分子におけるエキシトン状態の量子化学的研究
-
批准号:02740230
-
项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
-
资助金额:$0.64万
-
财政年份:1990
-
负责人:青木 百合子
-
依托单位: