捕食者適応による表現系の可塑性を支配する遺伝子群とそのシグナル伝達のカスケード

由于捕食者适应及其信号转导级联而控制表型可塑性的基因组

• 批准号: 16657071
• 负责人: 森 司
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: Nihon University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2006
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16657071/
• 关键词: 表現型の可塑性; マイクロアレー; オタマジャクシ; エゾアカガエル; エゾサンショウウオ; サブトラクション; 捕食者適応戦略

目的:我々は上述のエゾサンショウオの捕食圧により、著しく膨満型に誘導されたオタマジャクシの体表、脳を含む顔部、内臓を含んだ腹部、そして尾部でいったいどのような遺伝子群が発現、又はどのような遺伝子が抑制されているのかを見出すことを行っている。このことにより、捕食者-被捕食者相互作用における表現型の可塑性を支配している進化生物学上極めて重要であると考えられる遺伝子のスクリーニングを行なう。方法:昨年度遺伝子のサブトラクションなどを行いトータルで7000個の遺伝子をスクリーニングし、それらの遺伝子配列をブラスト解析により解析した。その中から同一な遺伝子を排除、又は選抜して約1000個の遺伝子を用いてマイクロアレーを作成した。このアレーを用いてサンショウウオと一緒に飼育したオタマジャクシの顔部から継次的にサンプリングしたRNAを用いてアレー解析行った。また、頭胴部からもRNAを抽出してアレー解析を行った。結果:今回の解析で捕食者であるサンショウウオが存在すると発現し、捕食者を抜くと発現量が減少する遺伝子のスクリーニングに成功した。これらの遺伝子は捕食者誘導による表現型の可塑性に強く関連する遺伝子であることが推測される。現在投稿準備中である。

Objective: To investigate the effects of predator pressure, expansion, induction, surface, interior, tail, middle and middle on the development and inhibition of predator sub-groups. The plasticity of phenotypes in predator-prey interactions is extremely important in evolutionary biology. Methods: 7000 samples were collected from last year's database, and the sequence of samples was analyzed. In addition to eliminating the same gene, we also selected about 1000 genes to create a new gene. This is the first time I've ever seen a woman. The first part of the RNA extraction process Results: The analysis of the predator was successful, and the predator's occurrence was reduced. A strong correlation between the phenotype plasticity and the predator-induced phenotype of these genes is inferred. Now in preparation for submission.

项目成果

Genetic basis of phenotypic plasticity for predator-induced morphological defenses in anuran tadpole, Rana pirica, using cDNA subtraction and microarray analysis

使用 cDNA 消减和微阵列分析，研究无尾蝌蚪（Rana pirica）捕食者诱导的形态防御表型可塑性的遗传基础

• 发表时间: 2005
• 期刊: Biochemical and Biophysical Research Communications 330
• 作者: Tsukasa Mon;Ikuei Hiraka;Youichi Kurata;Hiroko Kawachi;Osamu Kishida;Kinya Nishimura
• 通讯作者: Kinya Nishimura