土壌の微生物性診断法の開発

土壤微生物诊断方法的开发

• 批准号: 16658028
• 负责人: 小柳津 広志
• 金额: $ 2.3万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2006
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16658028/
• 关键词: 土壌診断; 菌体脂肪酸組成; 土壌肥沃性; TRFLP; 指数化; 土壌微生物分類

この研究では、土壌の肥沃性や病害発生の程度を予測する指標を作成し、土壌の微生物性診断技術の開発を目指した。今年度は昨年度から引き続いて、長野県中信農業試験場および茨城県農業試験場の長期連用圃場を使用して土壌微生物性の分析手法の開発およびその評価を行った。これらの圃場は関東近郊で同じ施肥条件で農薬を使用せずに長期連用された各県の試験場の実施状況を調べた結果、最適な圃場として選ばれたものである。土壌の採取は夏季栽培作物の作付けを行う直前に行った。それぞれの圃場は約10の施肥条件の違う区画に分かれているが、採取はそれぞれから6サンプル取り、土壌の物理化学的性質、全脂肪酸組成、全DNAを用いた16S rDNAを対象としてTRFLP分析などを行った。各作物の収量はそれぞれの試験場からデータをいただいた。すべでのデータに多変量解析を行ったところ、作物収量と関連する特徴的な菌体脂肪酸10個およびDNAフラグメント10個が見出された。2つの圃場のいずれでも見出された13:0 2OH、19:0 anteiso、481bpT-RF、482bpT-RFは普遍的に存在する指標性のある微生物に由来するものと考えられた。13:0 2OHは、Streptococcus bovisに特異的に、19:0 anteisoは、一部のBacillus thuringiensisとStaphylococcusに特異的に含まれる脂肪酸である。また、481bp、482bpのT-RFは、どちらもγ-proteobacteriaに属している。どちらの土壌からもγ-proteobacteriaに属するPseudomonas species、またはXanthomonas speciesに特異的に含まれる脂肪酸が抽出されていることから、Pseudomonas speciesやXanthomonas species、Bacillus thuringiensisやStreptococcus bovisは、土壌タイプ、栽培作物によらず、普遍的に収量に影響を与えている菌群である可能性が示唆された。現在、土壌菌類についてもTRFLPのバンドの塩基配列を解読し、解析を進めている。

こ の research で は, soil 壌 の rich や born diseases 発 を の degree to measure す る index を make し, soil 壌 の microorganisms diagnostic technique の open 発 を refers し た. Our annual は yesterday か ら lead き 続 い て, nagano 県 citic agricultural test field お よ び ibaraki 県 agricultural test field の long-term post nursery field を use し 壌 て soil microorganisms の analysis technique の open 発 お よ び そ の review 価 を line っ た. こ れ ら の nursery field は masato east suburb で で farmers with じ fertilization conditions 薬 を use せ ず に laparoscope, usually connected to a long-term さ れ た each 県 の の test field be applied condition を adjustable べ た results, the optimal な nursery field と し て choose ば れ た も の で あ る. Soil けを takes the summer cultivation of けを crops, and before that, に lines った. そ れ ぞ れ の nursery field は の fertilization conditions about 10 う の spare area painting に か れ て い る が, take は そ れ ぞ れ か ら 6 サ ン プ ル り, soil 壌 の physical and chemical properties, total fatty acid composition, total DNA of を with い た 16 s rDNA を like と seaborne し て TRFLP analysis な ど を line っ た. The <s:1> yield <e:1> of each crop is それぞれ, and the <s:1> experimental field is らデ タを タを ただ た た. す べ で の デ ー タ に amount - more analytical line を っ た と こ ろ, crop 収 と masato even す る of 徴 な thalli fatty acid 10 お よ び DNA フ ラ グ メ ン ト out 10 が さ れ た. 2 つ の nursery field の い ず れ で も shows さ れ た 13:0 2 oh, 19:0 anteiso, 481 BPT - RF, 482 BPT - RF は common に exist す る indexes の あ る microbial に origin す る も の と exam え ら れ た. 13:0 2OH に, Streptococcus bovisに specific に, 19:0 anteiso まれる, a part of the <s:1> Bacillus thuringiensisとStaphylococcusに specific に containing まれる fatty acids である. Youdaoplaceholder0, 481bp, 482bp <s:1> T-RF, <s:1> ちら <s:1> <s:1> γ-proteobacteriaに belong to the genus て て る る る. ど ち ら の soil 壌 か ら も gamma proteobacteria に genus す る Pseudomonas species, ま た は Xanthomonas species contains に specific に ま れ る fatty acids が spare さ れ て い る こ と か ら, Pseudomonas Species や Xanthomonas species, Bacillus thuringiensis や Streptococcus bovis は, soil 壌 タ イ プ, crop cultivation に よ ら ず, common に 収 effects に を and え て い る flora で あ が る possibility in stopping さ れ た. Now, earth 壌 fungi に つ い て も TRFLP の バ ン ド の salt base with column を solution 読 し, parse を into め て い る.

项目成果

Microbial indices of soil fertility

• DOI: 10.1111/j.1365-2672.2004.02529.x
• 发表时间: 2005-05
• 期刊: Journal of Applied Microbiology
• 影响因子: 4
• 作者: C. Suzuki;T. Kunito;T. Aono;C.-T. Liu;H. Oyaizu

The hierarchical system of the 'Alphaproteobacteria':: description of Hyphomonadaceae fam. nov., Xanthobacteraceae fam. nov and Erythrobacteraceae fam. nov.

• DOI: 10.1099/ijs.0.63663-0
• 发表时间: 2005-09-01
• 期刊: INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY
• 影响因子: 2.8
• 作者: Lee, KB;Liu, CT;Oyaizu, H
• 通讯作者: Oyaizu, H