生物界の第4のドメインに属する微生物の遣伝子構成の解明と純粋培養の試み

生物界第四域微生物遗传结构的阐明及纯培养的尝试

• 批准号: 11876020
• 负责人: 小柳津 広志
• 金额: $ 1.15万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 1999
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1999 至 2000
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-11876020/
• 关键词: 土壌微生物; 古細菌; 第4の生物; 生態; 培養; 遺伝子クローニング

この研究は、水田土壌からリボソームRNA遺伝子のクローンとして検出された系統的に他の生物と隔たった微生物の遺伝子構成の解明と培養を試みるものである。昨年度は、遺伝子として検出される第4ドメイン生物の濃縮法を確立するため、マグネチックビーズを用いた方法を試験した。昨年度の試験では、第4ドメインに対して特異的なプライマーをビーズに付着させて、第4ドメイン生物の濃縮も試みたが、充分な量の濃縮はできなかった。そこで、今年度は古細菌全体を濃縮させ、予測される古細菌の存在量を高い回収率で回収できることを確認した。最終的には、遺伝子ライブラリーを作製するのに充分な細胞は得られなかったが、実験規模を拡大させれば遺伝子ライブラリーの作製が可能な段階に到達した。培養法については、いろいろと検討したが、成功には至っていない。そこで、第4ドメイン生物の生態的分布を調べることとした。今回は、海洋の堆積物からクローンが分離できるか試験した。東京湾で採取した堆積物全てから第4ドメイン生物のクローンが分離され、クローン間の塩基配列は非常に大きな多様性を示した。以上の結果から、第4ドメイン生物は海洋にも広く生息していることが確かめられた。また、FISH法を用いて海洋堆積物中の第4ドメイン生物と古細菌の量を測定したところ全生物量の10〜20%に達することを明かとした。このことは、温泉や塩湖などの特殊な環境に生息すると考えられている古細菌が自然界に広く分布していることを示している。

This research is aimed at understanding and cultivating the genetic components of other organisms and microorganisms in paddy field. The fourth part of the bioconcentration method was established last year. Last year's test, the fourth part of the test, the fourth part of the test, the third part of the test, the fourth part of the test, the third part of the test, the fourth part of the test. This year, the total number of archaea was concentrated, and the estimated number of archaea was confirmed. The ultimate goal is to increase the size of the cell and to increase the efficiency of the cell. The cultivation method is to be successful. The ecological distribution of organisms in the fourth quarter of the year is adjusted. Today, the accumulation of the ocean is separated from each other. Tokyo Bay is the fourth largest area of the world where the accumulation of organic matter has been completely separated and the matrix arrangement between them has been shown to be extremely diverse. The above results show that the fourth generation of biological organisms is the most important one. The FISH method was used to determine the amount of the fourth species of organisms and archaea in marine deposits, which amounted to 10 - 20% of the total biomass. A study on the distribution of archaea in the natural world

项目成果

Kim H,Honda D,Hanada S,Kanamori N,Shibata S,Miyaki T,Nakamura K,and Oyaizu.: "A deeply branched novel phylotype found in japanese paddy soils"Microbiology. 146. 2309-2315 (2000)

Kim H、Honda D、Hanada S、Kanamori N、Shibata S、Miyaki T、Nakamura K 和 Oyaizu.：“在日本稻田土壤中发现的一种深度分支的新系统发育型”微生物学。