RNA干渉現象における内在、外来遺伝子の識別機構の解明
阐明RNA干扰现象中内源基因和外源基因的区分机制
基本信息
- 批准号:16658046
- 负责人:
- 金额:$ 2.11万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
- 财政年份:2004
- 资助国家:日本
- 起止时间:2004 至 2005
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
3'UTR配列に対するRNAiによって、psbP遺伝子ファミリーの1A,5B遺伝子(グループ I)を発現抑制したタバコの植物体では、配列相同性の高い上流領域を介したtransitive RNAiによる他のPsbPグループに対する発現抑制効果は認められない。そこで、この形質転換タバコに、新たにこのdsRNAの標的となる3'UTR配列を持つpsbP_1A遺伝子を形質転換によって外来遺伝子として再導入(supertransformation)した。クロロフィル蛍光分析、及び、ウエスタン解析を行った結果、それらの形質転換体の一部の系統では、RNAiの標的配列をもたないグループIIのpsbP遺伝子にも発現抑制効果が及んでいることが明らかとなった。一方で、3'UTR配列を持たないpsbP_1A遺伝子を形質転換によって外来遺伝子として再導入した系統では、そうした抑制効果を示す個体は認められなかった。従って、3'UTR配列を持つpsbP_1A遺伝子を導入した系統では、3'UTR配列の上流領域に対するtransitive RNAiが生じている可能性が示唆された。しかしながら、低分子RNAの解析を行った結果、上流領域に対するsiRNAの検出できず、transitive RNAiが原因であると断定することはできなかった。この原因としては、二次的なsiRNAの蓄積レベルが低い可能性と、転写レベルでの発現抑制が生じている可能性が考えられた。今後、より感度の高いsiRNAの検出方法を工夫するとともに、DNAメチル化状態の詳細な解析を行う事で新たな研究展開が期待できると考えられた。
3'UTR alignment is related to RNAi, psbP gene expression and 1A, 5B gene expression inhibition in plants with high and high alignment identity, and other psbP gene expression inhibition effects are recognized. The target of dsRNA is the 3'UTR of psbP_1A gene. The target of dsRNA is the 3'UTR of psbP_1A gene. The results of optical analysis, and the analysis of psbP gene expression in some parts of the system show that psbP gene expression in some parts of the system is inhibited by RNAi. A 3'UTR sequence is maintained in the psbP_1A gene, and the alien gene is reintroduced into the system. The possibility of transient RNAi occurring in the upstream domain of 3 'UTR alignment is demonstrated by the introduction of psbP_1A genes into the system. Analysis of low molecular RNA results, detection of siRNA in the upstream domain, and determination of the cause of transient RNAi The reason for this is that the accumulation of secondary siRNA is likely to be low, and the occurrence of siRNA is likely to be inhibited. In the future, the detection method of high sensitivity siRNA will be studied in detail, and new research will be carried out.
项目成果
期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Functional analysis of four members of the PsbP family in photosystem II in Nicotiana tabacum using differential RNA interference.
- DOI:10.1093/pcp/pci207
- 发表时间:2005-12
- 期刊:
- 影响因子:4.9
- 作者:Seiko Ishihara;Yumiko Yamamoto;K. Ifuku;F. Sato
- 通讯作者:Seiko Ishihara;Yumiko Yamamoto;K. Ifuku;F. Sato
Functional analysis of four PsbP members encoded by a multigene family in Nicotiana tabacum by RNA interference technique
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- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Ishihara;S.;Yamamoto;Y.;Ifuku;K.;Sato;F.
- 通讯作者:F.
RNAi and functional genoimics
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- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:伊福健太郎;佐藤文彦;Fumihiko Sato
- 通讯作者:Fumihiko Sato
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2014 - 期刊:
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