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RNA干渉現象における内在、外来遺伝子の識別機構の解明

RNA干渉現象における内在、外来遺伝子の識別機構の解明
阐明RNA干扰现象中内源基因和外源基因的区分机制
批准号：
16658046
负责人：
佐藤 文彦
金额：
$2.11万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2004
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2004 至 2005
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16658046/
关键词：
RNA干渉法transitive RNAi外来遺伝子内在遺伝子systemic RNAiDNA methylationRNAi

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
3'UTR配列に対するRNAiによって、psbP遺伝子ファミリーの1A,5B遺伝子(グループ I)を発現抑制したタバコの植物体では、配列相同性の高い上流領域を介したtransitive RNAiによる他のPsbPグループに対する発現抑制効果は認められない。そこで、この形質転換タバコに、新たにこのdsRNAの標的となる3'UTR配列を持つpsbP_1A遺伝子を形質転換によって外来遺伝子として再導入(supertransformation)した。クロロフィル蛍光分析、及び、ウエスタン解析を行った結果、それらの形質転換体の一部の系統では、RNAiの標的配列をもたないグループIIのpsbP遺伝子にも発現抑制効果が及んでいることが明らかとなった。一方で、3'UTR配列を持たないpsbP_1A遺伝子を形質転換によって外来遺伝子として再導入した系統では、そうした抑制効果を示す個体は認められなかった。従って、3'UTR配列を持つpsbP_1A遺伝子を導入した系統では、3'UTR配列の上流領域に対するtransitive RNAiが生じている可能性が示唆された。しかしながら、低分子RNAの解析を行った結果、上流領域に対するsiRNAの検出できず、transitive RNAiが原因であると断定することはできなかった。この原因としては、二次的なsiRNAの蓄積レベルが低い可能性と、転写レベルでの発現抑制が生じている可能性が考えられた。今後、より感度の高いsiRNAの検出方法を工夫するとともに、DNAメチル化状態の詳細な解析を行う事で新たな研究展開が期待できると考えられた。
英文摘要
3'UTR配列に対するRNAiによって、psbP遺伝子ファミリーの1A,5B遺伝子(グループ I)を発現抑制したタバコの植物体では、配列相同性の高い上流領域を介したtransitive RNAiによる他のPsbPグループに対する発現抑制効果は認められない。そこで、この形質転換タバコに、新たにこのdsRNAの標的となる3'UTR配列を持つpsbP_1A遺伝子を形質転換によって外来遺伝子として再導入(supertransformation)した。クロロフィル蛍光分析、及び、ウエスタン解析を行った結果、それらの形質転換体の一部の系統では、RNAiの標的配列をもたないグループIIのpsbP遺伝子にも発現抑制効果が及んでいることが明らかとなった。一方で、3'UTR配列を持たないpsbP_1A遺伝子を形質転換によって外来遺伝子として再導入した系統では、そうした抑制効果を示す個体は認められなかった。従って、3'UTR配列を持つpsbP_1A遺伝子を導入した系統では、3'UTR配列の上流領域に対するtransitive RNAiが生じている可能性が示唆された。しかしながら、低分子RNAの解析を行った結果、上流領域に対するsiRNAの検出できず、transitive RNAiが原因であると断定することはできなかった。この原因としては、二次的なsiRNAの蓄積レベルが低い可能性と、転写レベルでの発現抑制が生じている可能性が考えられた。今後、より感度の高いsiRNAの検出方法を工夫するとともに、DNAメチル化状態の詳細な解析を行う事で新たな研究展開が期待できると考えられた。
期刊论文(12)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Functional analysis of four members of the PsbP family in photosystem II in Nicotiana tabacum using differential RNA interference.
DOI： 10.1093/pcp/pci207
发表时间： 2005-12
期刊： Plant & cell physiology
影响因子： 4.9
作者： [Seiko Ishihara;Yumiko Yamamoto;K. Ifuku;F. Sato]
通讯作者： Seiko Ishihara;Yumiko Yamamoto;K. Ifuku;F. Sato
Functional analysis of four PsbP members encoded by a multigene family in Nicotiana tabacum by RNA interference technique
RNA干扰技术分析烟草多基因家族编码的四个PsbP成员的功能
DOI： --
发表时间： 2005
期刊： Proc.Photosynthesis Congress 2004 (In press)
影响因子： --
作者： [Ishihara, S., Yamamoto, Y., Ifuku, K., Sato, F.]
通讯作者： F.
RNAi and functional genoimics
RNAi 和功能基因组学
DOI： --
发表时间： 2005
期刊： Plant Biotechnology 22
影响因子： --
作者： [伊福健太郎, 佐藤文彦, Fumihiko Sato]
通讯作者： Fumihiko Sato
RNAiで遺伝子を置換する!?
用RNAi取代基因！？
DOI： --
发表时间： 2005
期刊： 生物工学会誌 83・9
影响因子： --
作者： [伊福健太郎, 佐藤文彦]
通讯作者： 佐藤文彦
共 6 条
    Projections to the brainstem from the cerebellum involved in the control of masticatory movements and their controllability
    • 批准号：
      23K09118
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $3.08万
    • 财政年份：
      2023
    • 负责人：
      佐藤 文彦
    • 依托单位：
      Osaka University
    頭頸部癌における免疫チェックポイント阻害剤の効果予測因子の探究
    • 批准号：
      23K15877
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
    • 资助金额：
      $1.25万
    • 财政年份：
      2023
    • 负责人：
      佐藤 文彦
    • 依托单位：
      Kurume University
    父娘関係を背景にしたナチス少女文学の成立と展開についての研究
    • 批准号：
      22K00446
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $1.75万
    • 财政年份：
      2022
    • 负责人：
      佐藤 文彦
    • 依托单位：
      Kanazawa University
    Relationship between ascending projection of jaw-closing muscle-proprioception to the intralaminar thalamic nuclei and Tourette syndrome treatment mechanism
    • 批准号：
      20K09888
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.83万
    • 财政年份：
      2020
    • 负责人：
      佐藤 文彦
    • 依托单位：
      Osaka University